More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3743 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3088  helicase domain-containing protein  61.46 
 
 		 956 aa  1123    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01898 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0352  helicase domain protein  46.91 
 
 		 937 aa  692    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5420  helicase domain-containing protein  48.69 
 
 		 1046 aa  860    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  45.49 
 
 		 960 aa  733    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.608461 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3743  helicase domain protein  100 
 
 		 973 aa  1954    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1416  helicase domain protein  39.27 
 
 		 945 aa  501  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1355  helicase domain-containing protein  37.02 
 
 		 954 aa  476  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5808  helicase family protein  36.41 
 
 		 952 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4828  helicase family protein  36.41 
 
 		 952 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4894  helicase family protein  36.64 
 
 		 952 aa  466  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3885  helicase domain-containing protein  36.17 
 
 		 952 aa  463  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.929535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1314  helicase domain-containing protein  34.79 
 
 		 982 aa  415  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  33.64 
 
 		 919 aa  203  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  30.36 
 
 		 1201 aa  201  6e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  30.36 
 
 		 1201 aa  201  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  28.16 
 
 		 1031 aa  201  7e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  27.98 
 
 		 1045 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  28.33 
 
 		 1046 aa  193  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  28.63 
 
 		 1058 aa  189  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  27.11 
 
 		 1038 aa  189  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  31.37 
 
 		 952 aa  185  4.0000000000000006e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  27.75 
 
 		 1095 aa  184  7e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  28.2 
 
 		 1082 aa  177  8e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  27.89 
 
 		 1028 aa  177  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  29.64 
 
 		 941 aa  175  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  29.64 
 
 		 941 aa  175  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  28.31 
 
 		 1177 aa  174  7.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  27.63 
 
 		 988 aa  172  4e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  26.49 
 
 		 969 aa  171  6e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  29.53 
 
 		 1165 aa  170  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  27.04 
 
 		 971 aa  167  6.9999999999999995e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  29.41 
 
 		 949 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  29.41 
 
 		 1049 aa  165  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  29.71 
 
 		 805 aa  163  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  27.6 
 
 		 877 aa  163  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  28.12 
 
 		 969 aa  161  6e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  26.52 
 
 		 972 aa  160  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  28.63 
 
 		 933 aa  160  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  28.88 
 
 		 1167 aa  158  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  28.64 
 
 		 1167 aa  157  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  30.15 
 
 		 1170 aa  156  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  28.19 
 
 		 801 aa  154  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  30.19 
 
 		 950 aa  153  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  29.65 
 
 		 1160 aa  153  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0259  helicase domain-containing protein  29.25 
 
 		 578 aa  152  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  28.62 
 
 		 1167 aa  153  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0745  helicase domain protein  36.42 
 
 		 1094 aa  152  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  26.23 
 
 		 1170 aa  152  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  27.63 
 
 		 966 aa  151  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  28.01 
 
 		 1170 aa  150  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  28.92 
 
 		 1147 aa  150  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1526  helicase domain-containing protein  28.74 
 
 		 923 aa  148  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.796043  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  28.99 
 
 		 953 aa  147  9e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  26.02 
 
 		 560 aa  146  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  27.38 
 
 		 957 aa  146  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  27.4 
 
 		 584 aa  145  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  30.02 
 
 		 1129 aa  145  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  28.91 
 
 		 962 aa  142  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  27.6 
 
 		 584 aa  142  3.9999999999999997e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4771  helicase domain-containing protein  27.84 
 
 		 953 aa  140  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.360251 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  28.1 
 
 		 958 aa  139  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  26.67 
 
 		 948 aa  137  8e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  27.06 
 
 		 1013 aa  137  9e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0461  helicase domain-containing protein  26.1 
 
 		 986 aa  137  9e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.838477  unclonable  0.0000248811 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0725  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  27.78 
 
 		 949 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  28.04 
 
 		 1069 aa  135  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  28.04 
 
 		 1069 aa  135  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0353  helicase-like  25.6 
 
 		 933 aa  134  6.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  26.88 
 
 		 900 aa  134  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  24.44 
 
 		 560 aa  134  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  24.44 
 
 		 560 aa  134  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  29.36 
 
 		 1116 aa  133  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  27.42 
 
 		 958 aa  134  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  25.81 
 
 		 941 aa  132  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  28.3 
 
 		 835 aa  132  4.0000000000000003e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  24.21 
 
 		 560 aa  132  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  28.3 
 
 		 1144 aa  131  6e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  24.25 
 
 		 560 aa  131  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  24.25 
 
 		 560 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  24.25 
 
 		 560 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  24.25 
 
 		 560 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  24.25 
 
 		 560 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0273  helicase domain-containing protein  27.77 
 
 		 919 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  24.07 
 
 		 560 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  24.25 
 
 		 560 aa  129  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0606  ATP-dependent helicase HepA  28.2 
 
 		 968 aa  127  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00996895  normal  0.766513 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00061  ATP-dependent helicase HepA  26.96 
 
 		 968 aa  125  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.283033  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3540  SNF2-related protein  26.96 
 
 		 968 aa  125  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410418  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0061  ATP-dependent helicase HepA  26.96 
 
 		 968 aa  125  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000176621  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00060  hypothetical protein  26.96 
 
 		 968 aa  125  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.326785  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0061  ATP-dependent helicase HepA  26.96 
 
 		 968 aa  125  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00130615  normal  0.800173 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3419  ATP-dependent helicase HepA  27.31 
 
 		 968 aa  125  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0051  ATP-dependent helicase HepA  26.96 
 
 		 968 aa  125  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000808065  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3547  ATP-dependent helicase HepA  27.31 
 
 		 968 aa  125  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.212031  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0063  ATP-dependent helicase HepA  26.96 
 
 		 968 aa  125  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000144173  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  27.43 
 
 		 1145 aa  125  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3508  ATP-dependent helicase HepA  26.46 
 
 		 968 aa  125  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.285717  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3598  ATP-dependent helicase HepA  26.96 
 
 		 968 aa  125  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.517032  unclonable  0.0000000467864 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2948  ATP-dependent helicase HepA  27.31 
 
 		 968 aa  125  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.476978 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0064  ATP-dependent helicase HepA  26.96 
 
 		 919 aa  125  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.694047  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>