More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5893 on replicon NC_008704
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  100 
 
 		 1069 aa  2169    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 1069 aa  2169    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  28.05 
 
 		 1145 aa  280  7e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  26.29 
 
 		 1172 aa  263  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  26.94 
 
 		 1144 aa  261  4e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  32.81 
 
 		 1169 aa  255  4.0000000000000004e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  33.1 
 
 		 1167 aa  254  6e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  30.53 
 
 		 1160 aa  253  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  32.46 
 
 		 1167 aa  252  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  29.94 
 
 		 1062 aa  251  4e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  27.53 
 
 		 1170 aa  251  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  33.28 
 
 		 1169 aa  251  7e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  32.94 
 
 		 1168 aa  249  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  31.75 
 
 		 1170 aa  247  8e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  27.11 
 
 		 1129 aa  247  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  26.85 
 
 		 1138 aa  246  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  31.26 
 
 		 1167 aa  245  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  27.6 
 
 		 1116 aa  245  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  33.21 
 
 		 829 aa  242  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  26.24 
 
 		 1170 aa  242  2.9999999999999997e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  33.1 
 
 		 1172 aa  241  4e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  31.37 
 
 		 1136 aa  238  6e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  31.13 
 
 		 1137 aa  235  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  32.35 
 
 		 1194 aa  233  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.61 
 
 		 1212 aa  232  3e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  29.87 
 
 		 1147 aa  227  7e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  31.95 
 
 		 835 aa  226  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  30.3 
 
 		 1160 aa  225  4e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  30.82 
 
 		 964 aa  223  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  31.4 
 
 		 1170 aa  222  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  28.94 
 
 		 988 aa  213  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  29.62 
 
 		 969 aa  206  1e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  29.39 
 
 		 971 aa  197  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  30.51 
 
 		 962 aa  192  4e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  27.87 
 
 		 972 aa  189  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  30.13 
 
 		 941 aa  188  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  30.13 
 
 		 941 aa  188  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  28.78 
 
 		 933 aa  182  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  28.67 
 
 		 966 aa  179  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  29.51 
 
 		 969 aa  178  5e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  28.47 
 
 		 925 aa  171  5e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  29.92 
 
 		 921 aa  171  7e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  26.43 
 
 		 877 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  27.34 
 
 		 927 aa  169  4e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  29.22 
 
 		 915 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  27.7 
 
 		 584 aa  164  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  29.31 
 
 		 572 aa  159  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  28.45 
 
 		 916 aa  158  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  28.45 
 
 		 915 aa  158  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  28.09 
 
 		 1095 aa  157  7e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  28.26 
 
 		 1013 aa  156  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  26.8 
 
 		 801 aa  156  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  27.07 
 
 		 805 aa  154  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  25.71 
 
 		 584 aa  151  5e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  30.31 
 
 		 919 aa  150  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  28.22 
 
 		 1201 aa  147  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  28.22 
 
 		 1201 aa  147  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  24.67 
 
 		 937 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  27.13 
 
 		 894 aa  147  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  27.22 
 
 		 952 aa  146  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  26.84 
 
 		 554 aa  144  8e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  26.02 
 
 		 555 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  27.05 
 
 		 1028 aa  142  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  26.13 
 
 		 467 aa  141  6e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  29.51 
 
 		 1038 aa  140  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  23.87 
 
 		 669 aa  138  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  29.59 
 
 		 1057 aa  138  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  26.44 
 
 		 760 aa  137  9e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  26.24 
 
 		 900 aa  135  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3743  helicase domain protein  27.83 
 
 		 973 aa  135  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  26.66 
 
 		 1046 aa  133  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3088  helicase domain-containing protein  28.79 
 
 		 956 aa  133  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01898 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  25.45 
 
 		 949 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0259  helicase domain-containing protein  27.81 
 
 		 578 aa  133  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0659  DEAD/DEAH box helicase family protein  31.76 
 
 		 440 aa  132  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.348224  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  27.33 
 
 		 1049 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  25.78 
 
 		 942 aa  128  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  27.34 
 
 		 933 aa  128  7e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1538  helicase domain-containing protein  25.59 
 
 		 963 aa  127  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  25.62 
 
 		 967 aa  126  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  28.01 
 
 		 1031 aa  125  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1526  helicase domain-containing protein  28.12 
 
 		 923 aa  126  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.796043  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  26.98 
 
 		 950 aa  125  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  22.88 
 
 		 963 aa  125  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  26.8 
 
 		 947 aa  124  7e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  26.07 
 
 		 1045 aa  124  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2766  helicase domain-containing protein  30.19 
 
 		 906 aa  124  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388883  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2498  helicase domain protein  42 
 
 		 774 aa  124  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  27.38 
 
 		 1058 aa  123  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1983  SNF2-related protein  23.26 
 
 		 966 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.094528  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  26.84 
 
 		 1177 aa  122  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  27.35 
 
 		 665 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  25.42 
 
 		 951 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1355  helicase domain-containing protein  24.38 
 
 		 954 aa  120  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  26.95 
 
 		 948 aa  119  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0985  helicase domain-containing protein  27.22 
 
 		 813 aa  120  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.033377  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  25.64 
 
 		 932 aa  119  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5420  helicase domain-containing protein  27.54 
 
 		 1046 aa  119  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0958  SNF2-related protein  23.75 
 
 		 975 aa  119  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106346  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  25.72 
 
 		 961 aa  117  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>