More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0213 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  65.57 
 
 
560 aa  775    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  65.57 
 
 
560 aa  776    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  65.57 
 
 
560 aa  776    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  65.03 
 
 
560 aa  770    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  65.57 
 
 
560 aa  776    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  65.39 
 
 
560 aa  779    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  65.57 
 
 
560 aa  776    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  65.57 
 
 
560 aa  776    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  65.03 
 
 
560 aa  770    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  65.21 
 
 
560 aa  773    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  100 
 
 
554 aa  1144    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  65.57 
 
 
560 aa  776    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  85.23 
 
 
555 aa  991    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  50.19 
 
 
572 aa  532  1e-150  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  41.97 
 
 
669 aa  375  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  46.26 
 
 
467 aa  372  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0259  helicase domain-containing protein  41.28 
 
 
578 aa  371  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  39.08 
 
 
584 aa  353  2.9999999999999997e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  38.48 
 
 
584 aa  342  8e-93  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  33.45 
 
 
921 aa  230  6e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  29.55 
 
 
966 aa  225  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  30.38 
 
 
933 aa  219  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  32.37 
 
 
915 aa  216  7e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  32.19 
 
 
915 aa  216  8e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  32.19 
 
 
916 aa  216  8e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  30.27 
 
 
949 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  29.59 
 
 
969 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  30.73 
 
 
942 aa  212  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0251  helicase  31.91 
 
 
541 aa  211  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432976  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  29.29 
 
 
941 aa  209  8e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  29.29 
 
 
941 aa  209  8e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  29.63 
 
 
951 aa  207  5e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  30.57 
 
 
801 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3804  SNF2-related protein  30.67 
 
 
961 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.502587  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  31.28 
 
 
947 aa  199  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  29.96 
 
 
937 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  30.75 
 
 
805 aa  198  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  28 
 
 
988 aa  197  3e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  30.51 
 
 
932 aa  197  3e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52390  helicase, Snf2 family  29.52 
 
 
929 aa  197  6e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  28.87 
 
 
1116 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  28.87 
 
 
1138 aa  191  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3304  non-specific serine/threonine protein kinase  29.64 
 
 
1002 aa  189  9e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0728777  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3658  SNF2 family helicase  30.15 
 
 
960 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.041395  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  28.12 
 
 
1144 aa  186  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  28.12 
 
 
835 aa  185  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  25.13 
 
 
969 aa  181  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  28.87 
 
 
1145 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  28.39 
 
 
900 aa  178  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  28.34 
 
 
665 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  29.17 
 
 
894 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  27.38 
 
 
1172 aa  173  9e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  24.6 
 
 
971 aa  172  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  26.54 
 
 
1043 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  27.83 
 
 
1160 aa  168  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  28.82 
 
 
1168 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  27.72 
 
 
1170 aa  162  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  27.03 
 
 
621 aa  161  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  27.69 
 
 
1170 aa  160  5e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0569  ATP-dependent helicase HepA  27.29 
 
 
967 aa  157  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  27.29 
 
 
1181 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  25.89 
 
 
964 aa  156  9e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  27.62 
 
 
1013 aa  155  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0568  ATP-dependent helicase HepA  27.33 
 
 
970 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00434325  normal  0.886581 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  28.09 
 
 
1078 aa  154  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  25.89 
 
 
777 aa  154  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
1152 aa  153  5.9999999999999996e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0061  ATP-dependent helicase HepA  27.13 
 
 
968 aa  154  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00130615  normal  0.800173 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00061  ATP-dependent helicase HepA  27.13 
 
 
968 aa  153  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.283033  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3540  SNF2-related protein  27.13 
 
 
968 aa  153  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410418  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0061  ATP-dependent helicase HepA  27.13 
 
 
968 aa  153  7e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000176621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3598  ATP-dependent helicase HepA  27.13 
 
 
968 aa  153  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.517032  unclonable  0.0000000467864 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00060  hypothetical protein  27.13 
 
 
968 aa  153  7e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.326785  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0063  ATP-dependent helicase HepA  27.13 
 
 
968 aa  153  7e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000144173  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0064  ATP-dependent helicase HepA  27.13 
 
 
919 aa  153  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.694047  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2892  ATP-dependent helicase HepA  26.97 
 
 
942 aa  153  8e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0051  ATP-dependent helicase HepA  27.13 
 
 
968 aa  153  8e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000808065  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  25.61 
 
 
1037 aa  153  8.999999999999999e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3539  SNF2-related protein  27.07 
 
 
872 aa  152  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0608  ATP-dependent helicase HepA  26.77 
 
 
967 aa  152  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.171676  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  27.94 
 
 
1068 aa  152  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0575  ATP-dependent helicase HepA  27.65 
 
 
968 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3455  ATP-dependent helicase HepA  27.65 
 
 
968 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0606  ATP-dependent helicase HepA  26.32 
 
 
968 aa  150  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00996895  normal  0.766513 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0108  ATP-dependent helicase HepA  26.87 
 
 
968 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0102  ATP-dependent helicase HepA  26.87 
 
 
968 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0648061  normal  0.111163 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0106  ATP-dependent helicase HepA  26.87 
 
 
968 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00405197  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0101  ATP-dependent helicase HepA  26.87 
 
 
968 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0103  ATP-dependent helicase HepA  26.87 
 
 
944 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0457  ATP-dependent helicase HepA  27.29 
 
 
968 aa  150  6e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.65643 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  27.61 
 
 
829 aa  150  6e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0574  ATP-dependent helicase HepA  26.82 
 
 
968 aa  150  6e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  27.63 
 
 
1072 aa  150  7e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3790  ATP-dependent helicase HepA  26.93 
 
 
968 aa  150  7e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0535  ATP-dependent helicase HepA  26.93 
 
 
968 aa  150  7e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3916  ATP-dependent helicase HepA  26.93 
 
 
968 aa  150  8e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3733  ATP-dependent helicase HepA  26.93 
 
 
968 aa  150  8e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  25 
 
 
617 aa  149  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  27.13 
 
 
919 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0730  ATP-dependent helicase HepA  26.46 
 
 
968 aa  148  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000570719  normal  0.719856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>