More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0637 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  59.54 
 
 
1194 aa  1326    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  51.57 
 
 
1170 aa  1139    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  45.74 
 
 
1136 aa  932    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  51.8 
 
 
1212 aa  1187    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  100 
 
 
1168 aa  2394    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  45.44 
 
 
1131 aa  827    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  58.96 
 
 
1172 aa  1374    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  49.4 
 
 
760 aa  695    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  49.87 
 
 
1170 aa  1091    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  53.82 
 
 
1170 aa  1220    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  53.1 
 
 
1167 aa  1183    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  54.27 
 
 
1160 aa  1205    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  54.17 
 
 
829 aa  809    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2766  helicase domain-containing protein  51.71 
 
 
906 aa  839    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388883  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  51.69 
 
 
1160 aa  1147    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  53.58 
 
 
1167 aa  1195    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  53.58 
 
 
1170 aa  1224    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  52.55 
 
 
1172 aa  1209    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  50.55 
 
 
1169 aa  1101    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2498  helicase domain protein  53.54 
 
 
774 aa  770    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  50.38 
 
 
1169 aa  1099    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  46.8 
 
 
1137 aa  941    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  53.58 
 
 
1167 aa  1196    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  41.75 
 
 
964 aa  574  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2799  type III restriction enzyme, res subunit  51.14 
 
 
814 aa  556  1e-157  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0231877  normal  0.391027 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0659  DEAD/DEAH box helicase family protein  62.53 
 
 
440 aa  529  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.348224  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  35.49 
 
 
1116 aa  483  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  34.86 
 
 
1129 aa  483  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  31.85 
 
 
1138 aa  447  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  33.06 
 
 
1144 aa  449  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  31.86 
 
 
1145 aa  422  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  32.38 
 
 
1147 aa  410  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1396  SNF2-related  76.43 
 
 
283 aa  407  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  36.29 
 
 
835 aa  404  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  32.92 
 
 
1062 aa  366  1e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0821  putative helicase  37.43 
 
 
565 aa  335  2e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  32.36 
 
 
988 aa  322  1.9999999999999998e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  28.42 
 
 
971 aa  292  3e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  33.38 
 
 
969 aa  290  2e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  31.96 
 
 
969 aa  257  1.0000000000000001e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  32.76 
 
 
1069 aa  256  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  32.76 
 
 
1069 aa  256  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  32.03 
 
 
933 aa  252  3e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  31.75 
 
 
877 aa  250  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1632  DEAD-like helicase  46.15 
 
 
312 aa  249  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  32.61 
 
 
941 aa  248  6e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  32.61 
 
 
941 aa  248  6e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  29.69 
 
 
801 aa  247  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  29.54 
 
 
805 aa  247  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  29.18 
 
 
925 aa  244  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  31.54 
 
 
966 aa  243  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  30.7 
 
 
962 aa  242  2.9999999999999997e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  29.59 
 
 
922 aa  242  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  31.29 
 
 
919 aa  238  5.0000000000000005e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  33.69 
 
 
972 aa  235  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  29.03 
 
 
937 aa  229  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  31.3 
 
 
572 aa  222  3e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  29.31 
 
 
952 aa  222  3.9999999999999997e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  29.68 
 
 
1057 aa  210  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  29.8 
 
 
894 aa  207  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  31.25 
 
 
1165 aa  204  6e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  30.58 
 
 
1031 aa  197  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  31.53 
 
 
1045 aa  196  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  29.66 
 
 
560 aa  194  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  30.06 
 
 
1082 aa  192  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  29.86 
 
 
1046 aa  192  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  28.59 
 
 
900 aa  191  7e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  31.33 
 
 
1049 aa  191  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  29.97 
 
 
1038 aa  188  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  30.95 
 
 
1028 aa  188  6e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  30.04 
 
 
1058 aa  187  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  30.84 
 
 
1177 aa  179  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  29.15 
 
 
584 aa  178  5e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  33.33 
 
 
927 aa  177  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  29.82 
 
 
948 aa  176  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0464  helicase domain protein  27.99 
 
 
1044 aa  175  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  29 
 
 
940 aa  174  7.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  30.55 
 
 
1095 aa  174  9e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  29.42 
 
 
1201 aa  173  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  29.42 
 
 
1201 aa  173  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1355  helicase domain-containing protein  28.02 
 
 
954 aa  173  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  26.31 
 
 
949 aa  172  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  27.57 
 
 
555 aa  172  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  28.9 
 
 
584 aa  171  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1416  helicase domain protein  27.72 
 
 
945 aa  169  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  28.09 
 
 
961 aa  168  5e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  28.64 
 
 
554 aa  168  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  30.33 
 
 
963 aa  166  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0273  helicase domain-containing protein  29.46 
 
 
919 aa  164  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  28.03 
 
 
951 aa  163  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  32.36 
 
 
933 aa  163  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  29.21 
 
 
949 aa  162  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  28.27 
 
 
968 aa  160  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  26.41 
 
 
1013 aa  160  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4771  helicase domain-containing protein  29.53 
 
 
953 aa  159  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.360251 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  29.85 
 
 
964 aa  159  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  30.12 
 
 
955 aa  159  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3804  SNF2-related protein  27.52 
 
 
961 aa  159  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.502587  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1538  helicase domain-containing protein  28.15 
 
 
963 aa  158  7e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  28.33 
 
 
953 aa  157  8e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>