More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0273 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  47.05 
 
 		 949 aa  759    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0353  helicase-like  53.12 
 
 		 933 aa  852    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0273  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 919 aa  1843    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  47.52 
 
 		 948 aa  751    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1526  helicase domain-containing protein  54.96 
 
 		 923 aa  975    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.796043  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  43.36 
 
 		 953 aa  607  9.999999999999999e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  44.16 
 
 		 940 aa  602  1e-170  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0461  helicase domain-containing protein  42.53 
 
 		 986 aa  598  1e-169  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.838477  unclonable  0.0000248811 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  38.06 
 
 		 958 aa  595  1e-168  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  40.16 
 
 		 968 aa  595  1e-168  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  38.03 
 
 		 958 aa  592  1e-168  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  39.9 
 
 		 969 aa  583  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  41.78 
 
 		 941 aa  581  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2730  helicase domain-containing protein  41.42 
 
 		 945 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  42.09 
 
 		 946 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4771  helicase domain-containing protein  41.75 
 
 		 953 aa  575  1.0000000000000001e-162  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.360251 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  39.72 
 
 		 933 aa  550  1e-155  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  37.82 
 
 		 957 aa  536  1e-151  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  37.5 
 
 		 950 aa  526  1e-148  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0725  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  38.7 
 
 		 949 aa  477  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0832  DEAD-like helicases-like  59.43 
 
 		 313 aa  301  3e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.76445 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  32.95 
 
 		 919 aa  288  5e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  28.44 
 
 		 952 aa  283  1e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  29.29 
 
 		 1057 aa  178  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1314  helicase domain-containing protein  29.17 
 
 		 982 aa  177  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  29.22 
 
 		 969 aa  170  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  27.01 
 
 		 1046 aa  168  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1416  helicase domain protein  27.46 
 
 		 945 aa  168  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  28.43 
 
 		 1165 aa  167  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0352  helicase domain protein  30.22 
 
 		 937 aa  166  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  29.89 
 
 		 1169 aa  166  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  28.29 
 
 		 877 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  28.76 
 
 		 1049 aa  164  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  28.15 
 
 		 1058 aa  164  9e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  29.52 
 
 		 1169 aa  163  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  28.4 
 
 		 1145 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  30.56 
 
 		 933 aa  163  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0745  helicase domain protein  29.25 
 
 		 1094 aa  162  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  29.08 
 
 		 1168 aa  162  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  29.67 
 
 		 1095 aa  161  5e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  28.69 
 
 		 1045 aa  161  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  27.05 
 
 		 1028 aa  159  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  28.47 
 
 		 801 aa  158  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0464  helicase domain protein  28.21 
 
 		 1044 aa  158  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  28.06 
 
 		 1031 aa  157  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  30.51 
 
 		 969 aa  158  6e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.72 
 
 		 960 aa  157  8e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.608461 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5808  helicase family protein  28.57 
 
 		 952 aa  157  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3885  helicase domain-containing protein  28.57 
 
 		 952 aa  156  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.929535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4828  helicase family protein  28.57 
 
 		 952 aa  157  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  28.6 
 
 		 805 aa  156  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  27.16 
 
 		 1170 aa  156  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  27.99 
 
 		 1082 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  27.99 
 
 		 1170 aa  155  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  26.25 
 
 		 1167 aa  154  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  29.86 
 
 		 966 aa  153  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  30.24 
 
 		 941 aa  152  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  27.17 
 
 		 1167 aa  152  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4894  helicase family protein  27.59 
 
 		 952 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  30.24 
 
 		 941 aa  152  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  28.18 
 
 		 1172 aa  152  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  26.22 
 
 		 971 aa  152  3e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  27.62 
 
 		 1138 aa  151  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  28.25 
 
 		 1136 aa  151  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  27.16 
 
 		 1167 aa  151  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  26.49 
 
 		 1172 aa  151  7e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  27.79 
 
 		 1170 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  27.87 
 
 		 962 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  29.23 
 
 		 1160 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1355  helicase domain-containing protein  26.99 
 
 		 954 aa  149  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3088  helicase domain-containing protein  28.27 
 
 		 956 aa  147  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01898 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  29.08 
 
 		 1116 aa  145  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  27.99 
 
 		 937 aa  145  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  28.21 
 
 		 1201 aa  144  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  28.21 
 
 		 1201 aa  144  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  26.1 
 
 		 1013 aa  142  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  26.91 
 
 		 1194 aa  142  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  27.62 
 
 		 1144 aa  142  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  26.45 
 
 		 835 aa  142  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  30.27 
 
 		 1129 aa  141  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  27.71 
 
 		 1137 aa  140  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  27.15 
 
 		 829 aa  140  8.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  24.61 
 
 		 900 aa  140  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  27.94 
 
 		 1170 aa  139  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0985  helicase domain-containing protein  31.29 
 
 		 813 aa  139  2e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.033377  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  28.03 
 
 		 894 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  28.12 
 
 		 972 aa  139  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  29.03 
 
 		 1160 aa  138  5e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  29.88 
 
 		 572 aa  137  9e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  27.27 
 
 		 1062 aa  137  9e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3743  helicase domain protein  27.36 
 
 		 973 aa  136  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  26.18 
 
 		 964 aa  135  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  31.93 
 
 		 1038 aa  130  8.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5420  helicase domain-containing protein  28.16 
 
 		 1046 aa  130  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  27.04 
 
 		 555 aa  124  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  23.62 
 
 		 467 aa  121  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  32.83 
 
 		 1131 aa  120  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  27.03 
 
 		 584 aa  120  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  26.67 
 
 		 1069 aa  119  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  26.67 
 
 		 1069 aa  119  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>