More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_4903 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  53.64 
 
 		 955 aa  1014    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  43.34 
 
 		 947 aa  764    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0958  SNF2-related protein  56.06 
 
 		 975 aa  1101    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106346  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1983  SNF2-related protein  46.41 
 
 		 966 aa  862    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.094528  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  44.55 
 
 		 932 aa  774    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3658  SNF2 family helicase  43.54 
 
 		 960 aa  753    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.041395  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  57.14 
 
 		 665 aa  763    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3804  SNF2-related protein  40 
 
 		 961 aa  662    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.502587  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  39.81 
 
 		 951 aa  679    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  54.93 
 
 		 964 aa  1040    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  45.32 
 
 		 949 aa  819    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1538  helicase domain-containing protein  52.72 
 
 		 963 aa  1034    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52390  helicase, Snf2 family  42.62 
 
 		 929 aa  723    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 963 aa  1981    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  47.05 
 
 		 967 aa  853    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  46.11 
 
 		 942 aa  843    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  38.2 
 
 		 961 aa  625  1e-177  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  42.56 
 
 		 921 aa  514  1e-144  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  42.68 
 
 		 915 aa  515  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  42.68 
 
 		 916 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  42.68 
 
 		 915 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  32.2 
 
 		 560 aa  233  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  32.37 
 
 		 560 aa  232  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  32.37 
 
 		 560 aa  232  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  32.37 
 
 		 560 aa  232  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  32.37 
 
 		 560 aa  232  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  32.37 
 
 		 560 aa  232  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  32.54 
 
 		 560 aa  231  7e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  32.26 
 
 		 560 aa  229  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  32.03 
 
 		 560 aa  230  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  32.88 
 
 		 560 aa  229  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  31.63 
 
 		 555 aa  224  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  30.83 
 
 		 560 aa  219  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  30.17 
 
 		 572 aa  212  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0036  hypothetical protein  34.83 
 
 		 363 aa  209  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.922282  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  28.2 
 
 		 584 aa  209  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  28.06 
 
 		 941 aa  202  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  28.06 
 
 		 941 aa  202  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  28.39 
 
 		 584 aa  201  7.999999999999999e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  30.22 
 
 		 962 aa  199  3e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  28.71 
 
 		 969 aa  196  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  30.39 
 
 		 1138 aa  196  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  29.48 
 
 		 1144 aa  195  4e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  29.48 
 
 		 835 aa  195  4e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  27.18 
 
 		 988 aa  194  8e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  28.32 
 
 		 966 aa  193  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  30.46 
 
 		 1129 aa  191  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  28.44 
 
 		 933 aa  189  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  24.53 
 
 		 1046 aa  187  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  28.91 
 
 		 1145 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  29.7 
 
 		 1062 aa  181  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  28.64 
 
 		 877 aa  180  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  29.42 
 
 		 1116 aa  178  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  30.06 
 
 		 1169 aa  177  6e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  27.46 
 
 		 1037 aa  177  9e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  30 
 
 		 1160 aa  175  3.9999999999999995e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  32.17 
 
 		 1194 aa  175  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  26.99 
 
 		 952 aa  174  5.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  26.94 
 
 		 969 aa  174  9e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  29.91 
 
 		 1160 aa  173  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  30.38 
 
 		 1170 aa  173  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  30.28 
 
 		 1169 aa  173  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  28.94 
 
 		 972 aa  172  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  28.75 
 
 		 1147 aa  171  5e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  30.73 
 
 		 1172 aa  171  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  26.95 
 
 		 1201 aa  168  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  26.95 
 
 		 1201 aa  168  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  31.36 
 
 		 1170 aa  166  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  30.49 
 
 		 1136 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  28.35 
 
 		 1172 aa  165  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  30.89 
 
 		 1170 aa  163  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  29.19 
 
 		 1167 aa  162  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  26.42 
 
 		 1028 aa  162  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  26.75 
 
 		 971 aa  161  5e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  27.41 
 
 		 964 aa  161  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  28.16 
 
 		 937 aa  160  8e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  29.3 
 
 		 1167 aa  160  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  27.01 
 
 		 925 aa  159  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  30.32 
 
 		 1167 aa  159  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  28.17 
 
 		 1095 aa  159  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0251  helicase  26.31 
 
 		 541 aa  158  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0464  helicase domain protein  27.24 
 
 		 1044 aa  157  7e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  26.93 
 
 		 922 aa  157  8e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  27.64 
 
 		 1058 aa  157  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  28.92 
 
 		 1137 aa  154  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  27.43 
 
 		 1057 aa  154  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  28.8 
 
 		 1168 aa  153  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.04 
 
 		 1212 aa  152  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  27.43 
 
 		 1049 aa  152  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  30.07 
 
 		 1170 aa  151  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  27.08 
 
 		 805 aa  151  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  25.24 
 
 		 1165 aa  150  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  26.82 
 
 		 1038 aa  149  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  28.67 
 
 		 894 aa  148  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  26.59 
 
 		 927 aa  146  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  27.31 
 
 		 801 aa  146  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  28.49 
 
 		 829 aa  143  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  27.08 
 
 		 900 aa  142  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  27.86 
 
 		 1046 aa  139  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  27.53 
 
 		 1045 aa  139  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>