More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0503 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  43.99 
 
 		 1145 aa  915    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  44.03 
 
 		 1138 aa  922    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  46.05 
 
 		 1144 aa  959    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  49.7 
 
 		 835 aa  772    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 1147 aa  2341    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  38.06 
 
 		 1129 aa  617  1e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  37.76 
 
 		 1116 aa  601  1e-170  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  34.13 
 
 		 1160 aa  450  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  33.97 
 
 		 1172 aa  430  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  34.25 
 
 		 1194 aa  432  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  32.76 
 
 		 1170 aa  424  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  32.77 
 
 		 1168 aa  421  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  32.69 
 
 		 1167 aa  422  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  33.05 
 
 		 1170 aa  417  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  33 
 
 		 1172 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  33.21 
 
 		 1167 aa  414  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  31.44 
 
 		 1170 aa  415  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  33.24 
 
 		 1167 aa  416  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  33.82 
 
 		 1160 aa  410  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  33.58 
 
 		 1169 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  32.23 
 
 		 1136 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  33.48 
 
 		 1169 aa  402  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.43 
 
 		 1212 aa  391  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  31.53 
 
 		 1137 aa  385  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  29.83 
 
 		 1062 aa  379  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  32 
 
 		 1170 aa  380  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  34.23 
 
 		 1131 aa  375  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  35.23 
 
 		 829 aa  363  1e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  32.51 
 
 		 964 aa  333  9e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  30.29 
 
 		 988 aa  316  9.999999999999999e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  35.03 
 
 		 941 aa  290  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  35.03 
 
 		 941 aa  290  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  29.74 
 
 		 969 aa  285  3.0000000000000004e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  30.22 
 
 		 971 aa  278  3e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  34.55 
 
 		 962 aa  264  6.999999999999999e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  34.03 
 
 		 933 aa  262  2e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  31.89 
 
 		 969 aa  260  1e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  32.76 
 
 		 972 aa  253  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  32.82 
 
 		 925 aa  242  2.9999999999999997e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  31.22 
 
 		 966 aa  242  4e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  31.7 
 
 		 805 aa  240  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  31.42 
 
 		 927 aa  238  4e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  30.87 
 
 		 801 aa  238  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  31.63 
 
 		 937 aa  236  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  31.61 
 
 		 922 aa  236  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  31.76 
 
 		 877 aa  234  9e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  30.69 
 
 		 1069 aa  233  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  30.69 
 
 		 1069 aa  233  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0659  DEAD/DEAH box helicase family protein  37.56 
 
 		 440 aa  227  8e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.348224  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2766  helicase domain-containing protein  29.52 
 
 		 906 aa  225  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388883  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2799  type III restriction enzyme, res subunit  32.44 
 
 		 814 aa  224  6e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0231877  normal  0.391027 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  29.05 
 
 		 952 aa  223  1.9999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  29.89 
 
 		 1031 aa  211  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  31.21 
 
 		 572 aa  209  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  30.83 
 
 		 900 aa  209  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  33.73 
 
 		 919 aa  207  9e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  31.07 
 
 		 942 aa  206  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  29.24 
 
 		 1049 aa  205  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  29.58 
 
 		 1165 aa  204  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  29.78 
 
 		 1045 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  31.36 
 
 		 1046 aa  202  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  31.53 
 
 		 894 aa  202  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  32.94 
 
 		 949 aa  197  7e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  30.99 
 
 		 964 aa  197  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  29.03 
 
 		 560 aa  195  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  30.71 
 
 		 947 aa  195  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52390  helicase, Snf2 family  30.98 
 
 		 929 aa  194  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2498  helicase domain protein  28.78 
 
 		 774 aa  194  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  32.31 
 
 		 932 aa  193  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  32.25 
 
 		 1057 aa  192  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  30.41 
 
 		 1095 aa  190  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  27.45 
 
 		 560 aa  189  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  28.35 
 
 		 760 aa  188  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  27.88 
 
 		 560 aa  188  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  27.29 
 
 		 560 aa  187  7e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  27.29 
 
 		 560 aa  187  8e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  27.29 
 
 		 560 aa  187  8e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  27.29 
 
 		 560 aa  187  8e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  27.29 
 
 		 560 aa  187  8e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  28.3 
 
 		 1013 aa  187  9e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  27.29 
 
 		 560 aa  187  9e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  27.45 
 
 		 560 aa  187  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0464  helicase domain protein  33.76 
 
 		 1044 aa  187  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  30.56 
 
 		 1058 aa  186  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1983  SNF2-related protein  28.72 
 
 		 966 aa  186  3e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.094528  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  29.14 
 
 		 555 aa  186  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0259  helicase domain-containing protein  29.03 
 
 		 578 aa  186  3e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  29.16 
 
 		 584 aa  186  3e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  30.21 
 
 		 921 aa  184  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  30.34 
 
 		 961 aa  182  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  29.24 
 
 		 967 aa  182  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  28.46 
 
 		 467 aa  180  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  28.51 
 
 		 955 aa  179  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  30.2 
 
 		 915 aa  179  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  30.2 
 
 		 916 aa  179  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3658  SNF2 family helicase  30.92 
 
 		 960 aa  179  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.041395  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  29.15 
 
 		 963 aa  178  6e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1538  helicase domain-containing protein  29.71 
 
 		 963 aa  177  9e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  29.19 
 
 		 1082 aa  177  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.38 
 
 		 1028 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>