More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1325 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007412  Ava_C0219  helicase-like  73.57 
 
 
840 aa  1254    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000357618  hitchhiker  0.00781123 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  100 
 
 
1082 aa  2204    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  42.36 
 
 
1177 aa  835    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  35.1 
 
 
1031 aa  522  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  34.15 
 
 
1046 aa  522  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  34.55 
 
 
1049 aa  508  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  33.57 
 
 
1045 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  32.88 
 
 
1058 aa  491  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0464  helicase domain protein  33.01 
 
 
1044 aa  437  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  31.76 
 
 
1095 aa  434  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  33.12 
 
 
1057 aa  436  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  33.24 
 
 
1165 aa  435  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  33.03 
 
 
1201 aa  432  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  33.03 
 
 
1201 aa  432  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  31.53 
 
 
1038 aa  426  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  32.51 
 
 
1028 aa  421  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4787  DEAD-like helicases-like protein  42.43 
 
 
338 aa  228  4e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111321  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  33.17 
 
 
919 aa  223  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  30.12 
 
 
969 aa  219  2e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  29.55 
 
 
1172 aa  211  9e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0745  helicase domain protein  31.1 
 
 
1094 aa  207  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  28.22 
 
 
952 aa  204  6e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  29.83 
 
 
971 aa  203  9.999999999999999e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  29.85 
 
 
988 aa  201  6e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  27.74 
 
 
1170 aa  199  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  28.47 
 
 
1212 aa  197  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  29.35 
 
 
1172 aa  197  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  30.46 
 
 
1160 aa  195  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  29.6 
 
 
1160 aa  192  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  31.02 
 
 
1167 aa  192  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1355  helicase domain-containing protein  28.72 
 
 
954 aa  191  5e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  28.89 
 
 
968 aa  190  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4785  helicase domain-containing protein  28.3 
 
 
724 aa  190  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0599344  normal  0.582969 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  31.02 
 
 
1167 aa  189  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  30.2 
 
 
1170 aa  187  8e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  28.7 
 
 
1169 aa  187  9e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  28.66 
 
 
1169 aa  187  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1416  helicase domain protein  28.33 
 
 
945 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  30.62 
 
 
1167 aa  186  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  30.22 
 
 
1168 aa  185  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  29.22 
 
 
1194 aa  186  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  29.44 
 
 
1136 aa  185  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4828  helicase family protein  27.76 
 
 
952 aa  182  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5808  helicase family protein  27.76 
 
 
952 aa  182  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3885  helicase domain-containing protein  27.59 
 
 
952 aa  181  5.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.929535  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  29.7 
 
 
1129 aa  181  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4894  helicase family protein  27.78 
 
 
952 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  28.06 
 
 
1170 aa  178  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3743  helicase domain protein  28.2 
 
 
973 aa  177  8e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  29.03 
 
 
1170 aa  177  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  27.6 
 
 
933 aa  176  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  28.81 
 
 
805 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  29.08 
 
 
1116 aa  174  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  28.67 
 
 
1147 aa  174  6.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  28.59 
 
 
949 aa  174  9e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3088  helicase domain-containing protein  29.9 
 
 
956 aa  172  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.01898 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  29.12 
 
 
941 aa  172  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  29.12 
 
 
941 aa  172  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  30.31 
 
 
964 aa  171  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  29.05 
 
 
933 aa  170  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  27.19 
 
 
801 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  29.6 
 
 
972 aa  169  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4771  helicase domain-containing protein  28.26 
 
 
953 aa  166  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.360251 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0353  helicase-like  28.01 
 
 
933 aa  166  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  27.64 
 
 
877 aa  165  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  25.95 
 
 
941 aa  165  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  27.1 
 
 
1144 aa  163  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  27.1 
 
 
835 aa  162  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  27.95 
 
 
829 aa  162  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  28.08 
 
 
1145 aa  160  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  28.32 
 
 
953 aa  159  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  25.45 
 
 
1138 aa  159  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0273  helicase domain-containing protein  27.99 
 
 
919 aa  157  9e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  28.13 
 
 
1137 aa  157  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  27.17 
 
 
950 aa  157  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  25.82 
 
 
940 aa  156  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  26.84 
 
 
966 aa  155  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  27.17 
 
 
962 aa  155  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1526  helicase domain-containing protein  28.04 
 
 
923 aa  154  8e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.796043  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  28.48 
 
 
958 aa  150  9e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  26.94 
 
 
969 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  28.57 
 
 
958 aa  148  6e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  26.68 
 
 
1013 aa  146  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  27.39 
 
 
900 aa  144  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1983  SNF2-related protein  26.34 
 
 
966 aa  140  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.094528  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3804  SNF2-related protein  25.85 
 
 
961 aa  140  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.502587  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  23.2 
 
 
937 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  27.82 
 
 
894 aa  134  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  25.39 
 
 
932 aa  134  9e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  26.27 
 
 
963 aa  134  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  26.2 
 
 
964 aa  133  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  26.04 
 
 
584 aa  130  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  27 
 
 
925 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0958  SNF2-related protein  25.34 
 
 
975 aa  129  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106346  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  27.33 
 
 
927 aa  128  5e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  26.9 
 
 
961 aa  127  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  26.59 
 
 
942 aa  125  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  25.12 
 
 
967 aa  125  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  25.16 
 
 
1037 aa  121  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3658  SNF2 family helicase  25.26 
 
 
960 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.041395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>