More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0633 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  50.3 
 
 		 1167 aa  1084    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2766  helicase domain-containing protein  63.92 
 
 		 906 aa  1122    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388883  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  63.73 
 
 		 1212 aa  1514    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  49.28 
 
 		 1170 aa  1080    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  51.06 
 
 		 1172 aa  1146    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  55.6 
 
 		 760 aa  822    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  52.43 
 
 		 829 aa  751    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  95.29 
 
 		 1169 aa  2233    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  44.72 
 
 		 1136 aa  867    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  44.98 
 
 		 1137 aa  873    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  51.63 
 
 		 1194 aa  1113    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  50.09 
 
 		 1160 aa  1068    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  49.87 
 
 		 1167 aa  1077    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  58.99 
 
 		 1170 aa  1338    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2799  type III restriction enzyme, res subunit  59.71 
 
 		 814 aa  689    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0231877  normal  0.391027 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  60.6 
 
 		 1170 aa  1451    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  49.79 
 
 		 1167 aa  1073    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  60.89 
 
 		 1172 aa  1474    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 1169 aa  2387    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  73.01 
 
 		 1170 aa  1765    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  48.94 
 
 		 1160 aa  1011    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  50.38 
 
 		 1168 aa  1102    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2498  helicase domain protein  46.35 
 
 		 774 aa  625  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  43.65 
 
 		 964 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0659  DEAD/DEAH box helicase family protein  62.64 
 
 		 440 aa  571  1e-161  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.348224  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  35.54 
 
 		 1129 aa  476  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  35.63 
 
 		 1116 aa  467  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  32.49 
 
 		 1138 aa  461  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  32.31 
 
 		 1144 aa  447  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  32.85 
 
 		 1145 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  34.69 
 
 		 835 aa  401  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  54.73 
 
 		 1131 aa  390  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  33 
 
 		 1147 aa  389  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  40.5 
 
 		 1062 aa  347  6e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  30.46 
 
 		 988 aa  333  1e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0821  putative helicase  37.23 
 
 		 565 aa  328  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1396  SNF2-related  62.55 
 
 		 283 aa  327  7e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  30.24 
 
 		 969 aa  274  9e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  27.76 
 
 		 1069 aa  268  5e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  27.76 
 
 		 1069 aa  268  5e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  32.7 
 
 		 877 aa  266  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  27.63 
 
 		 971 aa  259  2e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  31.49 
 
 		 933 aa  253  1e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  31.4 
 
 		 966 aa  251  7e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  29.94 
 
 		 922 aa  251  7e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  31.83 
 
 		 801 aa  248  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  33.83 
 
 		 962 aa  248  6.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  30.4 
 
 		 969 aa  246  1.9999999999999999e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  29.83 
 
 		 925 aa  243  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  31.3 
 
 		 941 aa  243  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  31.3 
 
 		 941 aa  243  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  29.98 
 
 		 805 aa  241  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  27.88 
 
 		 927 aa  238  5.0000000000000005e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1632  DEAD-like helicase  46.48 
 
 		 312 aa  235  4.0000000000000004e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  32.57 
 
 		 1046 aa  232  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  28.65 
 
 		 952 aa  227  1e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  31.68 
 
 		 972 aa  227  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  28.57 
 
 		 937 aa  224  9e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  32.73 
 
 		 894 aa  221  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  31.42 
 
 		 1049 aa  221  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  33.93 
 
 		 919 aa  221  5e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  30.37 
 
 		 1058 aa  215  4.9999999999999996e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  31.17 
 
 		 1031 aa  214  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  28.87 
 
 		 572 aa  213  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  28.75 
 
 		 1057 aa  213  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  30.89 
 
 		 1045 aa  211  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  29.1 
 
 		 1165 aa  201  7e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  27.87 
 
 		 560 aa  197  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  27.87 
 
 		 560 aa  196  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  29.6 
 
 		 1038 aa  195  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  27.87 
 
 		 560 aa  195  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  27.75 
 
 		 560 aa  194  9e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  27.71 
 
 		 560 aa  194  9e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  27.43 
 
 		 560 aa  193  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  27.43 
 
 		 560 aa  193  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  27.43 
 
 		 560 aa  193  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  27.43 
 
 		 560 aa  194  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  27.43 
 
 		 560 aa  193  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  27.75 
 
 		 560 aa  192  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  28.62 
 
 		 1082 aa  191  5.999999999999999e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  30.64 
 
 		 1177 aa  190  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  30.46 
 
 		 953 aa  184  6e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  31.56 
 
 		 963 aa  183  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  29.37 
 
 		 900 aa  183  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  29.76 
 
 		 1201 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  29.76 
 
 		 1201 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0461  helicase domain-containing protein  28.68 
 
 		 986 aa  182  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.838477  unclonable  0.0000248811 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  30.51 
 
 		 1095 aa  181  4.999999999999999e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  27.44 
 
 		 584 aa  177  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  28.73 
 
 		 961 aa  177  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.93 
 
 		 1028 aa  174  7.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  30.67 
 
 		 955 aa  174  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  27.89 
 
 		 969 aa  172  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1355  helicase domain-containing protein  26.96 
 
 		 954 aa  172  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  28.34 
 
 		 951 aa  170  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  27.32 
 
 		 1013 aa  170  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3804  SNF2-related protein  28.21 
 
 		 961 aa  168  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.502587  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  25.99 
 
 		 949 aa  167  9e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  27.02 
 
 		 584 aa  167  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  28.35 
 
 		 940 aa  167  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>