263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1632 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1632  DEAD-like helicase  100 
 
 		 312 aa  631  1e-180  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  57.2 
 
 		 1136 aa  295  5e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  55.64 
 
 		 829 aa  289  5.0000000000000004e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  56.03 
 
 		 1137 aa  284  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  50.19 
 
 		 1212 aa  264  2e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  48.46 
 
 		 1170 aa  263  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  47.69 
 
 		 1172 aa  261  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  51.95 
 
 		 1167 aa  260  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  50 
 
 		 1170 aa  259  5.0000000000000005e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  50.97 
 
 		 1167 aa  257  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  50.19 
 
 		 1167 aa  256  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  55.74 
 
 		 1131 aa  254  9e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2799  type III restriction enzyme, res subunit  49.08 
 
 		 814 aa  254  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0231877  normal  0.391027 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  50.19 
 
 		 1170 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  48.66 
 
 		 1172 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0659  DEAD/DEAH box helicase family protein  46.92 
 
 		 440 aa  251  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.348224  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  46.15 
 
 		 1168 aa  249  5e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  48.08 
 
 		 1194 aa  245  8e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  46.3 
 
 		 1169 aa  236  4e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  46.48 
 
 		 1169 aa  235  7e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  45.21 
 
 		 1160 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  45.91 
 
 		 1170 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  48.1 
 
 		 1160 aa  223  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  42 
 
 		 964 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  41.53 
 
 		 1116 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  40.32 
 
 		 1129 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  38.04 
 
 		 1145 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  39.51 
 
 		 1144 aa  150  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1396  SNF2-related  54.47 
 
 		 283 aa  149  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  39.51 
 
 		 835 aa  149  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  40.84 
 
 		 1138 aa  149  7e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  41.23 
 
 		 1147 aa  144  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  33.48 
 
 		 1062 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  38.75 
 
 		 927 aa  108  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  37.5 
 
 		 922 aa  106  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  37.5 
 
 		 925 aa  105  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0102  SNF2-related protein  36.88 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  38.03 
 
 		 1069 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  38.03 
 
 		 1069 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  36.88 
 
 		 877 aa  103  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  33.99 
 
 		 941 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  33.99 
 
 		 941 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  36.02 
 
 		 933 aa  97.8  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  34.57 
 
 		 805 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  34.57 
 
 		 801 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  34.35 
 
 		 966 aa  94.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  29.7 
 
 		 988 aa  91.3  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0392  hypothetical protein  38.69 
 
 		 185 aa  90.5  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  33.97 
 
 		 937 aa  89  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  33.33 
 
 		 1065 aa  88.6  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  33.33 
 
 		 1065 aa  88.6  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  33.33 
 
 		 933 aa  87.4  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  32.51 
 
 		 969 aa  87.8  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  33.33 
 
 		 968 aa  86.3  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  33.77 
 
 		 560 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  33.33 
 
 		 560 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  33.33 
 
 		 560 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  33.33 
 
 		 560 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 560 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  33.33 
 
 		 560 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  33.33 
 
 		 560 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  33.33 
 
 		 560 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  33.33 
 
 		 560 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  33.33 
 
 		 560 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  33.33 
 
 		 560 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3830  ATP-dependent helicase HepA  26.02 
 
 		 943 aa  84  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2948  ATP-dependent helicase HepA  30.39 
 
 		 968 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.476978 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  35.15 
 
 		 919 aa  83.2  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2730  helicase domain-containing protein  33.52 
 
 		 945 aa  83.2  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  31.79 
 
 		 572 aa  82.8  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0461  helicase domain-containing protein  32.29 
 
 		 986 aa  82.8  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.838477  unclonable  0.0000248811 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0730  ATP-dependent helicase HepA  27.56 
 
 		 968 aa  82.8  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000570719  normal  0.719856 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4519  ATP-dependent helicase HepA  29.82 
 
 		 975 aa  82  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3419  ATP-dependent helicase HepA  29.9 
 
 		 968 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  37.5 
 
 		 900 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  31.17 
 
 		 555 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3547  ATP-dependent helicase HepA  29.9 
 
 		 968 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.212031  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0606  ATP-dependent helicase HepA  29.52 
 
 		 968 aa  82  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00996895  normal  0.766513 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4104  ATP-dependent helicase hepA , putative  33.33 
 
 		 948 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3842  ATP-dependent helicase HepA  33.33 
 
 		 948 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  31.18 
 
 		 948 aa  81.6  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1526  helicase domain-containing protein  31.03 
 
 		 923 aa  81.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.796043  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  32.74 
 
 		 969 aa  81.3  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0352  ATP-dependent helicase HepA  31.71 
 
 		 969 aa  80.5  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  33.16 
 
 		 962 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4771  helicase domain-containing protein  34.05 
 
 		 953 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.360251 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0725  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  29.63 
 
 		 949 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  33.51 
 
 		 972 aa  80.1  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0101  ATP-dependent helicase HepA  28.1 
 
 		 968 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0745  helicase domain protein  30.73 
 
 		 1094 aa  80.1  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0103  ATP-dependent helicase HepA  28.1 
 
 		 944 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0108  ATP-dependent helicase HepA  28.1 
 
 		 968 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0106  ATP-dependent helicase HepA  28.1 
 
 		 968 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00405197  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2892  ATP-dependent helicase HepA  30.86 
 
 		 942 aa  80.5  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  29.95 
 
 		 941 aa  80.1  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0102  ATP-dependent helicase HepA  28.1 
 
 		 968 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0648061  normal  0.111163 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  32.73 
 
 		 950 aa  79.7  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2088  ATP-dependent helicase HepA  32.72 
 
 		 969 aa  79.7  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000725404  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002392  RNA polymerase associated protein RapA  33.33 
 
 		 969 aa  79.7  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000609656  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0259  helicase domain-containing protein  34.16 
 
 		 578 aa  79.3  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>