More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3830 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C0103  ATP-dependent helicase HepA  46.18 
 
 		 944 aa  860    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0608  ATP-dependent helicase HepA  47.35 
 
 		 967 aa  892    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.171676  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00061  ATP-dependent helicase HepA  46.99 
 
 		 968 aa  905    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.283033  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3540  SNF2-related protein  46.99 
 
 		 968 aa  905    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410418  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0625  ATP-dependent helicase HepA  48.34 
 
 		 968 aa  912    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1145  ATP-dependent helicase HepA  46.07 
 
 		 948 aa  810    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.286627 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3733  ATP-dependent helicase HepA  48.13 
 
 		 968 aa  907    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2531  ATP-dependent helicase HepA  43.17 
 
 		 949 aa  714    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002392  RNA polymerase associated protein RapA  48.29 
 
 		 969 aa  920    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000609656  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4519  ATP-dependent helicase HepA  50.72 
 
 		 975 aa  943    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0575  ATP-dependent helicase HepA  49.27 
 
 		 968 aa  921    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4272  ATP-dependent helicase HepA  46.07 
 
 		 948 aa  815    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2948  ATP-dependent helicase HepA  46.99 
 
 		 968 aa  883    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.476978 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4104  ATP-dependent helicase hepA , putative  47.23 
 
 		 948 aa  831    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2247  ATP-dependent helicase HepA  43.71 
 
 		 958 aa  784    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2218  ATP-dependent helicase HepA  43.81 
 
 		 958 aa  782    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3842  ATP-dependent helicase HepA  47.22 
 
 		 948 aa  832    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1986  ATP-dependent helicase HepA  39.98 
 
 		 982 aa  655    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.819734 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0106  ATP-dependent helicase HepA  46.89 
 
 		 968 aa  898    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00405197  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0457  ATP-dependent helicase HepA  48.03 
 
 		 968 aa  908    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.65643 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1162  ATP-dependent helicase HepA  46.08 
 
 		 948 aa  814    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504978  normal  0.026685 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3598  ATP-dependent helicase HepA  46.99 
 
 		 968 aa  905    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.517032  unclonable  0.0000000467864 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03699  ATP-dependent helicase HepA  55.63 
 
 		 947 aa  1080    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0051  ATP-dependent helicase HepA  46.89 
 
 		 968 aa  903    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000808065  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0606  ATP-dependent helicase HepA  47.2 
 
 		 968 aa  900    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00996895  normal  0.766513 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1255  ATP-dependent helicase HepA  46.69 
 
 		 948 aa  824    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03676  ATP-dependent helicase HepA  48.04 
 
 		 969 aa  904    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00060  hypothetical protein  46.99 
 
 		 968 aa  905    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.326785  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0536  ATP-dependent helicase HepA  48.34 
 
 		 968 aa  895    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00420482  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2088  ATP-dependent helicase HepA  47.93 
 
 		 969 aa  905    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000725404  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0469  ATP-dependent helicase HepA  40.27 
 
 		 980 aa  661    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1485  ATP-dependent helicase HepA  46.65 
 
 		 947 aa  817    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.810829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2286  ATP-dependent helicase HepA  40.43 
 
 		 1028 aa  657    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.642335  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3704  ATP-dependent helicase HepA  49.22 
 
 		 968 aa  917    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3419  ATP-dependent helicase HepA  47.1 
 
 		 968 aa  884    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3830  ATP-dependent helicase HepA  100 
 
 		 943 aa  1957    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3302  ATP-dependent helicase HepA  48.76 
 
 		 968 aa  919    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1516  ATP-dependent helicase HepA  44.74 
 
 		 966 aa  795    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30280  ATP-dependent helicase HepA  46.95 
 
 		 949 aa  808    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.561885  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0102  ATP-dependent helicase HepA  46.89 
 
 		 968 aa  897    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0648061  normal  0.111163 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0575  ATP-dependent helicase HepA  49.38 
 
 		 968 aa  926    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3455  ATP-dependent helicase HepA  49.07 
 
 		 968 aa  924    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0063  ATP-dependent helicase HepA  46.99 
 
 		 968 aa  905    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000144173  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3508  ATP-dependent helicase HepA  47.93 
 
 		 968 aa  899    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.285717  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0535  ATP-dependent helicase HepA  48.03 
 
 		 968 aa  904    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21230  ATP-dependent helicase HepA  47.36 
 
 		 950 aa  832    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0101  ATP-dependent helicase HepA  46.89 
 
 		 968 aa  898    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0352  ATP-dependent helicase HepA  49.48 
 
 		 969 aa  946    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0061  ATP-dependent helicase HepA  46.99 
 
 		 968 aa  905    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000176621  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0574  ATP-dependent helicase HepA  49.28 
 
 		 968 aa  924    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0064  ATP-dependent helicase HepA  46.02 
 
 		 919 aa  834    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.694047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3629  ATP-dependent helicase HepA  47.76 
 
 		 967 aa  895    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3820  ATP-dependent helicase HepA  47.35 
 
 		 967 aa  892    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3547  ATP-dependent helicase HepA  47.1 
 
 		 968 aa  884    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.212031  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3790  ATP-dependent helicase HepA  48.13 
 
 		 968 aa  908    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0061  ATP-dependent helicase HepA  46.99 
 
 		 968 aa  906    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00130615  normal  0.800173 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0569  ATP-dependent helicase HepA  47.87 
 
 		 967 aa  906    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3131  ATP-dependent helicase HepA  49.43 
 
 		 967 aa  907    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0108  ATP-dependent helicase HepA  46.89 
 
 		 968 aa  898    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0730  ATP-dependent helicase HepA  47.82 
 
 		 968 aa  897    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000570719  normal  0.719856 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0568  ATP-dependent helicase HepA  47.29 
 
 		 970 aa  890    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00434325  normal  0.886581 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3916  ATP-dependent helicase HepA  48.13 
 
 		 968 aa  907    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1179  ATP-dependent helicase HepA  46.27 
 
 		 948 aa  814    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.572965 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1812  ATP-dependent helicase HepA  47.47 
 
 		 948 aa  827    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.502146  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4324  ATP-dependent helicase HepA  47.98 
 
 		 968 aa  908    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3615  ATP-dependent helicase HepA  43.87 
 
 		 953 aa  754    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4527  helicase domain-containing protein  38.39 
 
 		 982 aa  633  1e-180  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0112  ATP-dependent helicase HepA  40.61 
 
 		 960 aa  609  1e-173  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000140392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2892  ATP-dependent helicase HepA  36.18 
 
 		 942 aa  580  1e-164  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1680  ATP-dependent helicase HepA  35.06 
 
 		 874 aa  511  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0454688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0567  RNA polymerase associated protein rapA  32.09 
 
 		 898 aa  208  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0594  helicase domain protein  33 
 
 		 898 aa  205  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0602  SNF2-related protein  27.98 
 
 		 892 aa  204  7e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0610  type III restriction protein res subunit  27.16 
 
 		 905 aa  204  8e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0259  helicase domain-containing protein  29.21 
 
 		 578 aa  155  4e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  29.96 
 
 		 941 aa  154  8e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  29.96 
 
 		 941 aa  154  8e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  27.66 
 
 		 560 aa  151  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  27.49 
 
 		 560 aa  151  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  27.66 
 
 		 560 aa  151  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  27.66 
 
 		 560 aa  151  6e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  27.66 
 
 		 560 aa  151  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  27.66 
 
 		 560 aa  151  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  27.66 
 
 		 560 aa  151  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  28.06 
 
 		 560 aa  151  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  28 
 
 		 560 aa  150  8e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  27.8 
 
 		 560 aa  150  8e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  27.43 
 
 		 560 aa  148  6e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  27.96 
 
 		 555 aa  146  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  34.17 
 
 		 988 aa  138  6.0000000000000005e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  28.22 
 
 		 572 aa  131  6e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0659  DEAD/DEAH box helicase family protein  31.29 
 
 		 440 aa  122  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.348224  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  27.92 
 
 		 900 aa  121  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.61 
 
 		 1212 aa  121  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  33 
 
 		 972 aa  121  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  35.51 
 
 		 969 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0745  helicase domain protein  37.56 
 
 		 1094 aa  119  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0352  helicase domain protein  26.58 
 
 		 937 aa  119  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  31.71 
 
 		 927 aa  118  6.9999999999999995e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  28.66 
 
 		 1045 aa  118  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>