More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4237 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  100 
 
 
1065 aa  2212    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  100 
 
 
1065 aa  2212    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  29.16 
 
 
925 aa  197  9e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  27.72 
 
 
1046 aa  184  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  27.75 
 
 
963 aa  181  9e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2172  helicase-like  26.34 
 
 
922 aa  178  5e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338314  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  41.15 
 
 
698 aa  171  8e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  28.74 
 
 
921 aa  171  8e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  26.37 
 
 
962 aa  169  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  28.02 
 
 
916 aa  168  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  28.02 
 
 
915 aa  167  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  25.81 
 
 
1043 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0497  type III restriction protein res subunit  36.09 
 
 
696 aa  165  5.0000000000000005e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.154157  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  27.8 
 
 
915 aa  164  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  27.38 
 
 
942 aa  164  7e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  25.25 
 
 
967 aa  162  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  25.06 
 
 
1172 aa  156  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  26.7 
 
 
1177 aa  156  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1540  helicase domain protein  29.27 
 
 
1187 aa  155  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100683  unclonable  0.000000000869975 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1538  helicase domain-containing protein  26.96 
 
 
963 aa  154  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  25.81 
 
 
1037 aa  152  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3658  SNF2 family helicase  25.42 
 
 
960 aa  150  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.041395  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  35.56 
 
 
969 aa  148  4.0000000000000006e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  31.15 
 
 
988 aa  148  5e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  35.19 
 
 
933 aa  147  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  33.12 
 
 
969 aa  146  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1537  type III restriction enzyme, res subunit  32.86 
 
 
732 aa  144  9e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  32.79 
 
 
706 aa  141  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  30.54 
 
 
971 aa  141  7.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  34.67 
 
 
966 aa  140  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  27.87 
 
 
941 aa  139  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  27.87 
 
 
941 aa  139  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  40.2 
 
 
927 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  23.73 
 
 
1080 aa  132  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  40.2 
 
 
922 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0102  SNF2-related protein  39.9 
 
 
346 aa  129  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  31.94 
 
 
1147 aa  128  6e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1374  type III restriction protein res subunit  33.48 
 
 
707 aa  127  8.000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.304908  normal  0.550958 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  38.89 
 
 
801 aa  127  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  38.89 
 
 
805 aa  127  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  29.55 
 
 
584 aa  126  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0012  helicase-like protein  33.46 
 
 
924 aa  127  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  22.99 
 
 
1052 aa  127  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  30.45 
 
 
1170 aa  125  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0352  ATP-dependent helicase HepA  34.41 
 
 
969 aa  125  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2948  ATP-dependent helicase HepA  34.87 
 
 
968 aa  124  7e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.476978 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  35.75 
 
 
877 aa  124  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3547  ATP-dependent helicase HepA  34.87 
 
 
968 aa  124  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.212031  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1516  ATP-dependent helicase HepA  38.46 
 
 
966 aa  124  8e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0411  helicase domain-containing protein  25.4 
 
 
1086 aa  124  8e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3419  ATP-dependent helicase HepA  34.87 
 
 
968 aa  124  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4324  ATP-dependent helicase HepA  31.23 
 
 
968 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  26.93 
 
 
584 aa  124  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  22.48 
 
 
1051 aa  123  9.999999999999999e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0730  ATP-dependent helicase HepA  35.48 
 
 
968 aa  123  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000570719  normal  0.719856 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0545  helicase-like  32.67 
 
 
910 aa  123  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  28.99 
 
 
964 aa  123  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0568  ATP-dependent helicase HepA  35.38 
 
 
970 aa  122  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00434325  normal  0.886581 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  27.21 
 
 
1172 aa  121  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1535  helicase domain-containing protein  23.14 
 
 
1086 aa  121  9e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  28.77 
 
 
937 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  32.34 
 
 
1137 aa  120  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  30.69 
 
 
829 aa  120  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0064  ATP-dependent helicase HepA  34.95 
 
 
919 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.694047  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0606  ATP-dependent helicase HepA  35.48 
 
 
968 aa  120  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00996895  normal  0.766513 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3302  ATP-dependent helicase HepA  34.42 
 
 
968 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  30.52 
 
 
1160 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0051  ATP-dependent helicase HepA  34.95 
 
 
968 aa  120  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000808065  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00061  ATP-dependent helicase HepA  34.95 
 
 
968 aa  120  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.283033  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3540  SNF2-related protein  34.95 
 
 
968 aa  120  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410418  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0061  ATP-dependent helicase HepA  34.95 
 
 
968 aa  120  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00130615  normal  0.800173 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3598  ATP-dependent helicase HepA  34.95 
 
 
968 aa  120  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.517032  unclonable  0.0000000467864 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3704  ATP-dependent helicase HepA  35.38 
 
 
968 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0061  ATP-dependent helicase HepA  34.95 
 
 
968 aa  120  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000176621  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0457  ATP-dependent helicase HepA  32.78 
 
 
968 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.65643 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0063  ATP-dependent helicase HepA  34.95 
 
 
968 aa  120  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000144173  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3178  type III restriction protein res subunit  34.07 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00060  hypothetical protein  34.95 
 
 
968 aa  120  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.326785  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3733  ATP-dependent helicase HepA  33.49 
 
 
968 aa  119  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3790  ATP-dependent helicase HepA  33.49 
 
 
968 aa  119  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3916  ATP-dependent helicase HepA  33.49 
 
 
968 aa  119  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0535  ATP-dependent helicase HepA  33.49 
 
 
968 aa  119  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0625  ATP-dependent helicase HepA  31.82 
 
 
968 aa  119  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0575  ATP-dependent helicase HepA  33.49 
 
 
968 aa  118  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3455  ATP-dependent helicase HepA  33.49 
 
 
968 aa  118  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0574  ATP-dependent helicase HepA  33.49 
 
 
968 aa  118  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0278  helicase domain protein  31.45 
 
 
915 aa  118  5e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0102  ATP-dependent helicase HepA  36.02 
 
 
968 aa  118  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0648061  normal  0.111163 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0575  ATP-dependent helicase HepA  33.49 
 
 
968 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0103  ATP-dependent helicase HepA  36.02 
 
 
944 aa  117  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0108  ATP-dependent helicase HepA  36.02 
 
 
968 aa  117  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0101  ATP-dependent helicase HepA  36.02 
 
 
968 aa  117  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0106  ATP-dependent helicase HepA  36.02 
 
 
968 aa  117  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00405197  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2088  ATP-dependent helicase HepA  33.85 
 
 
969 aa  117  8.999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000725404  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4519  ATP-dependent helicase HepA  34.87 
 
 
975 aa  117  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  31.46 
 
 
1136 aa  117  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21230  ATP-dependent helicase HepA  36.04 
 
 
950 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  30.03 
 
 
1129 aa  117  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  28.05 
 
 
1170 aa  117  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1352  helicase-like  31.92 
 
 
928 aa  117  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>