More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2799 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  74.96 
 
 
1212 aa  894    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  58.32 
 
 
1169 aa  672    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  58.77 
 
 
1170 aa  671    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  61.69 
 
 
1170 aa  733    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  65.42 
 
 
1172 aa  786    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  59.71 
 
 
1169 aa  690    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2799  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 
814 aa  1664    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0231877  normal  0.391027 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  56.44 
 
 
1170 aa  648    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0659  DEAD/DEAH box helicase family protein  62.19 
 
 
440 aa  590  1e-167  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.348224  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  51.3 
 
 
1172 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  49.19 
 
 
1167 aa  571  1e-161  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  51.6 
 
 
1194 aa  567  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  48.95 
 
 
1167 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  49.11 
 
 
1170 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  47.91 
 
 
1167 aa  560  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  50.97 
 
 
1168 aa  558  1e-157  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2766  helicase domain-containing protein  98.17 
 
 
906 aa  519  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388883  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  49.19 
 
 
1136 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  46.14 
 
 
1160 aa  508  9.999999999999999e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  48.79 
 
 
1160 aa  503  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  47.8 
 
 
1137 aa  488  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  47.25 
 
 
829 aa  469  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  49.76 
 
 
1131 aa  359  9.999999999999999e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  39.71 
 
 
964 aa  352  1e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1396  SNF2-related  55.42 
 
 
283 aa  338  1.9999999999999998e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  36.4 
 
 
1129 aa  260  6e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1632  DEAD-like helicase  49.08 
 
 
312 aa  254  5.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  60.1 
 
 
760 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  31.19 
 
 
1138 aa  239  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  32.1 
 
 
1116 aa  238  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  32.85 
 
 
1145 aa  233  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  31.15 
 
 
1144 aa  229  1e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  34.95 
 
 
1062 aa  227  6e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  30.83 
 
 
835 aa  227  8e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  32.61 
 
 
1147 aa  219  1e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  27.62 
 
 
988 aa  190  9e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  27.48 
 
 
877 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  29.02 
 
 
971 aa  151  4e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  29.95 
 
 
919 aa  151  6e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  29.86 
 
 
922 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  28.73 
 
 
969 aa  147  8.000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  29.72 
 
 
927 aa  145  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  29.58 
 
 
925 aa  145  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  28.13 
 
 
962 aa  141  4.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  27.5 
 
 
941 aa  133  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  27.5 
 
 
941 aa  133  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2498  helicase domain protein  45.45 
 
 
774 aa  132  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  24.76 
 
 
937 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  26.94 
 
 
1049 aa  128  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  29.95 
 
 
933 aa  127  6e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  28.16 
 
 
952 aa  127  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  28.4 
 
 
966 aa  125  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  24.85 
 
 
801 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0102  SNF2-related protein  27.67 
 
 
346 aa  122  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  25.59 
 
 
1057 aa  120  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  28.37 
 
 
972 aa  120  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  25.05 
 
 
805 aa  120  9e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4834  acriflavin resistance protein  81.08 
 
 
1083 aa  120  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  25.7 
 
 
1046 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  29.93 
 
 
969 aa  119  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  26.05 
 
 
1031 aa  118  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  26.45 
 
 
1045 aa  117  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  29.04 
 
 
894 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  27.22 
 
 
1165 aa  117  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  25.4 
 
 
1069 aa  117  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  25.4 
 
 
1069 aa  117  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3614  hypothetical protein  90.48 
 
 
256 aa  117  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0599096  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3420  regulatory protein, DeoR  78.38 
 
 
439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.382426  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  85.71 
 
 
281 aa  115  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0217  hypothetical protein  78.48 
 
 
387 aa  115  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0486  hypothetical protein  89.23 
 
 
100 aa  114  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0653  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  115  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10879 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0829  CoA-binding domain-containing protein  100 
 
 
766 aa  114  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4187  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  98.21 
 
 
721 aa  114  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.162597 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3056  hypothetical protein  98.18 
 
 
94 aa  114  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0293375 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0830  hypothetical protein  93.55 
 
 
383 aa  114  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.360573  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4827  hypothetical protein  78.38 
 
 
382 aa  114  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.419507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4550  hypothetical protein  91.67 
 
 
952 aa  114  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  27.78 
 
 
1095 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0759  hypothetical protein  86.36 
 
 
80 aa  112  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0647  hypothetical protein  82.61 
 
 
940 aa  112  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34885  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1385  hypothetical protein  98.18 
 
 
311 aa  112  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  25.87 
 
 
1058 aa  110  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3462  hypothetical protein  96.49 
 
 
100 aa  110  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1350  hypothetical protein  83.33 
 
 
160 aa  109  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.137623 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  94.64 
 
 
312 aa  109  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.551347  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2442  ABC transporter related  91.53 
 
 
634 aa  109  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0403227  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4861  imidazole glycerol phosphate synthase, glutamine amidotransferase subunit  96.43 
 
 
270 aa  109  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.285943  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0145  hypothetical protein  96.36 
 
 
93 aa  109  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.356397  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0216  hypothetical protein  96.43 
 
 
220 aa  109  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0862  hypothetical protein  96.36 
 
 
114 aa  108  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2362  hypothetical protein  82.35 
 
 
137 aa  108  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.409842  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4671  hypothetical protein  96.36 
 
 
101 aa  108  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.651437  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0516  hypothetical protein  96.36 
 
 
202 aa  108  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0335528  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4091  hypothetical protein  96.36 
 
 
87 aa  108  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459018  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3585  hypothetical protein  89.66 
 
 
95 aa  108  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.767622  normal  0.347274 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3301  hypothetical protein  80 
 
 
178 aa  108  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  92.98 
 
 
2200 aa  108  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3399  hypothetical protein  80 
 
 
109 aa  107  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.355088  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4462  hypothetical protein  94.64 
 
 
167 aa  107  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00243841  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>