More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4827 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4827  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  774    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.419507 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3894  hypothetical protein  39.22 
 
 		 327 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367386  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4969  extra-cytoplasmic solute receptor  39.67 
 
 		 364 aa  266  5.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.332662  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3420  hypothetical protein  39.44 
 
 		 333 aa  256  5e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1098  hypothetical protein  38.42 
 
 		 339 aa  250  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  36.98 
 
 		 336 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  44.12 
 
 		 328 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  36.22 
 
 		 328 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  37.02 
 
 		 326 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  37.37 
 
 		 328 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  37.14 
 
 		 327 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  36.29 
 
 		 332 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  37.64 
 
 		 339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  43.54 
 
 		 331 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  43.59 
 
 		 360 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  36.48 
 
 		 328 aa  213  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  43.96 
 
 		 345 aa  212  9e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  43.96 
 
 		 345 aa  212  9e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  34.74 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  36.39 
 
 		 335 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  35.96 
 
 		 330 aa  209  5e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  35.96 
 
 		 330 aa  209  5e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  35.83 
 
 		 327 aa  209  9e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  33.16 
 
 		 331 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  35.49 
 
 		 344 aa  208  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  34.64 
 
 		 330 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  43.17 
 
 		 322 aa  206  5e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  40.63 
 
 		 314 aa  206  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  34.9 
 
 		 322 aa  206  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  43.01 
 
 		 328 aa  206  6e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  35.26 
 
 		 336 aa  206  6e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  36.13 
 
 		 349 aa  205  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  35.39 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  43.91 
 
 		 335 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2294  hypothetical protein  40.96 
 
 		 326 aa  204  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000131413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  32.81 
 
 		 328 aa  203  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  41.76 
 
 		 325 aa  202  7e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  41.76 
 
 		 327 aa  202  8e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  36.11 
 
 		 331 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  37.67 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  34.89 
 
 		 320 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  35.46 
 
 		 324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  35.18 
 
 		 325 aa  201  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  34.64 
 
 		 332 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  36.06 
 
 		 339 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  34.33 
 
 		 339 aa  199  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  34.55 
 
 		 324 aa  199  7.999999999999999e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  35.36 
 
 		 336 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3801  hypothetical protein  35.51 
 
 		 335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694709  normal  0.119002 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1726  hypothetical protein  38.91 
 
 		 337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  32.53 
 
 		 318 aa  197  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5277  hypothetical protein  35.98 
 
 		 327 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  36.48 
 
 		 331 aa  197  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  33.16 
 
 		 324 aa  197  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  34.67 
 
 		 348 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  34.74 
 
 		 322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  33.43 
 
 		 332 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  33.93 
 
 		 330 aa  196  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  34.41 
 
 		 339 aa  196  5.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6131  hypothetical protein  35.41 
 
 		 314 aa  196  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  34.54 
 
 		 326 aa  196  8.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  38.58 
 
 		 333 aa  195  9e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  38.07 
 
 		 325 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  33.99 
 
 		 330 aa  195  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4401  hypothetical protein  36.52 
 
 		 321 aa  195  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0268815  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  35.79 
 
 		 329 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  42.22 
 
 		 327 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  32.64 
 
 		 327 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  38.89 
 
 		 328 aa  193  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  40.45 
 
 		 337 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  38.89 
 
 		 328 aa  193  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  33.76 
 
 		 326 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  34.73 
 
 		 356 aa  194  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0108  hypothetical protein  35.39 
 
 		 332 aa  194  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251449 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  35.11 
 
 		 332 aa  193  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  35.56 
 
 		 343 aa  193  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  35.96 
 
 		 327 aa  193  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  33.24 
 
 		 330 aa  192  9e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  34.65 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  35 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  35.44 
 
 		 329 aa  192  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  41.18 
 
 		 327 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1371  hypothetical protein  35.34 
 
 		 342 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  34.11 
 
 		 353 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  40.29 
 
 		 322 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  33.59 
 
 		 331 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  33.71 
 
 		 339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  39.01 
 
 		 341 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  35.5 
 
 		 325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  33.6 
 
 		 323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  32.46 
 
 		 327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  38.36 
 
 		 326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  41.94 
 
 		 332 aa  190  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  34.82 
 
 		 356 aa  190  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  34.38 
 
 		 324 aa  190  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  33.06 
 
 		 321 aa  189  5e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  36.6 
 
 		 330 aa  190  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  39.35 
 
 		 327 aa  189  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  34.35 
 
 		 323 aa  189  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4503  hypothetical protein  35.97 
 
 		 339 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248373 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>