More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0779 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  100 
 
 
360 aa  727    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  84.52 
 
 
345 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  84.52 
 
 
345 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  82.68 
 
 
339 aa  532  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  75.38 
 
 
344 aa  513  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  71.89 
 
 
336 aa  496  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  71.43 
 
 
333 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  68.47 
 
 
333 aa  440  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  54.9 
 
 
339 aa  358  8e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  56.13 
 
 
328 aa  349  5e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  54.13 
 
 
327 aa  341  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  51.94 
 
 
330 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  54.49 
 
 
334 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  52.71 
 
 
328 aa  334  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  51.8 
 
 
330 aa  333  3e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  52.85 
 
 
335 aa  331  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  51.47 
 
 
335 aa  331  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  49.27 
 
 
336 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  51.14 
 
 
321 aa  320  3e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  48.68 
 
 
334 aa  318  7e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  55.56 
 
 
335 aa  318  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  51.8 
 
 
330 aa  318  1e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  51.8 
 
 
330 aa  318  1e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  53.55 
 
 
330 aa  315  7e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  52.79 
 
 
331 aa  315  9e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  51.8 
 
 
328 aa  312  4.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  49.55 
 
 
328 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  51.5 
 
 
328 aa  310  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  49.85 
 
 
326 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  48.2 
 
 
327 aa  308  8e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  49.54 
 
 
331 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  47.01 
 
 
333 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  51.32 
 
 
349 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  47.16 
 
 
330 aa  306  3e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  46.69 
 
 
334 aa  306  4.0000000000000004e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  49.4 
 
 
335 aa  305  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  49.84 
 
 
324 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  49.84 
 
 
328 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  48.7 
 
 
330 aa  302  6.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  45.87 
 
 
325 aa  301  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  50.3 
 
 
325 aa  301  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  50 
 
 
339 aa  300  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  51.6 
 
 
324 aa  298  8e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  48.38 
 
 
325 aa  298  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  53.09 
 
 
339 aa  297  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  50 
 
 
328 aa  296  5e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  47.62 
 
 
333 aa  295  6e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  46.15 
 
 
331 aa  295  6e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  49.51 
 
 
331 aa  295  8e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  49.67 
 
 
325 aa  294  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  45.65 
 
 
327 aa  294  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  49.67 
 
 
327 aa  294  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  50.16 
 
 
322 aa  293  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  50.75 
 
 
330 aa  292  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1078  hypothetical protein  48.7 
 
 
344 aa  292  8e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.058258  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0994  hypothetical protein  48.7 
 
 
341 aa  291  9e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  46.38 
 
 
325 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  45.37 
 
 
325 aa  291  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  44.35 
 
 
324 aa  290  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  48.2 
 
 
322 aa  289  5.0000000000000004e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  45.02 
 
 
330 aa  289  6e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  49.02 
 
 
323 aa  288  7e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  47.38 
 
 
318 aa  288  8e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  46.77 
 
 
335 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  47.32 
 
 
331 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  50.29 
 
 
330 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  48.75 
 
 
314 aa  286  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  44.35 
 
 
323 aa  286  4e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  47.71 
 
 
328 aa  286  4e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  47.21 
 
 
327 aa  286  5e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  46.41 
 
 
337 aa  286  5e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  48.2 
 
 
353 aa  286  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  46.28 
 
 
344 aa  285  7e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  48.69 
 
 
355 aa  285  8e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  46.53 
 
 
335 aa  285  8e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  49.19 
 
 
328 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2872  hypothetical protein  48.52 
 
 
334 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.446965 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  47.1 
 
 
326 aa  285  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3791  hypothetical protein  46.69 
 
 
320 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  44.91 
 
 
332 aa  283  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  47.4 
 
 
324 aa  284  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  46.2 
 
 
322 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  44.18 
 
 
332 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  49.5 
 
 
321 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  49.5 
 
 
321 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  45.98 
 
 
332 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  44.84 
 
 
336 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  46.46 
 
 
322 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  46.48 
 
 
339 aa  282  5.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  49.5 
 
 
330 aa  282  8.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  48.54 
 
 
331 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  45.4 
 
 
326 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  44.64 
 
 
358 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  46.69 
 
 
304 aa  280  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  52.68 
 
 
325 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  44.35 
 
 
328 aa  280  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  45.59 
 
 
332 aa  279  6e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2416  hypothetical protein  47.84 
 
 
323 aa  278  9e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1513  hypothetical protein  47.73 
 
 
337 aa  278  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.283946  normal  0.153712 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  44.48 
 
 
326 aa  278  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>