More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4438 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  100 
 
 		 329 aa  664    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  46.77 
 
 		 320 aa  300  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  44.82 
 
 		 331 aa  291  8e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  48.01 
 
 		 356 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  49.83 
 
 		 325 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  44.93 
 
 		 318 aa  279  6e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  47.14 
 
 		 336 aa  275  9e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  47.3 
 
 		 328 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  45.25 
 
 		 325 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0902  hypothetical protein  43.92 
 
 		 320 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0987  hypothetical protein  43.92 
 
 		 320 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  47.47 
 
 		 334 aa  273  3e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  44.52 
 
 		 328 aa  271  8.000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  43.65 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1145  hypothetical protein  44.79 
 
 		 325 aa  271  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  47.84 
 
 		 328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0790  hypothetical protein  47.28 
 
 		 328 aa  269  4e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  44.7 
 
 		 322 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  43.44 
 
 		 327 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  44.3 
 
 		 326 aa  265  5.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  42.57 
 
 		 320 aa  265  8e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  44.55 
 
 		 351 aa  265  8.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  42.2 
 
 		 339 aa  265  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  44.59 
 
 		 334 aa  265  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  42.3 
 
 		 332 aa  264  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  43.05 
 
 		 353 aa  261  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  44.78 
 
 		 330 aa  259  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  41.55 
 
 		 330 aa  259  4e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2023  hypothetical protein  42.53 
 
 		 327 aa  259  4e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  43.26 
 
 		 332 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  45.45 
 
 		 334 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  41.55 
 
 		 330 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3459  hypothetical protein  42.81 
 
 		 324 aa  259  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505499  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  43.05 
 
 		 328 aa  258  7e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  44.97 
 
 		 327 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  41.88 
 
 		 326 aa  257  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5118  hypothetical protein  40.84 
 
 		 320 aa  257  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534032 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  42.86 
 
 		 328 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1715  hypothetical protein  39.44 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.786272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  42.9 
 
 		 326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  41.08 
 
 		 322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  42.72 
 
 		 360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2205  hypothetical protein  42.72 
 
 		 324 aa  253  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0725118 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  44.94 
 
 		 321 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  42.62 
 
 		 328 aa  253  3e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  42.86 
 
 		 326 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  43.89 
 
 		 358 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  41.75 
 
 		 321 aa  251  9.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2981  hypothetical protein  43 
 
 		 322 aa  251  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  43.26 
 
 		 321 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  42.43 
 
 		 333 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2409  hypothetical protein  43 
 
 		 322 aa  251  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.417331  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  43.92 
 
 		 325 aa  249  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  46.78 
 
 		 330 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  42.24 
 
 		 335 aa  249  5e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  39.63 
 
 		 344 aa  249  5e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  42.06 
 
 		 331 aa  249  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  39.94 
 
 		 356 aa  248  9e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  43.1 
 
 		 355 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  42.51 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  40.69 
 
 		 318 aa  248  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  40.82 
 
 		 321 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  41.81 
 
 		 333 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  42.06 
 
 		 328 aa  246  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  39.48 
 
 		 339 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  41.95 
 
 		 337 aa  247  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  46.95 
 
 		 330 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  42.06 
 
 		 328 aa  246  4e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  42.06 
 
 		 323 aa  246  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  42.02 
 
 		 314 aa  245  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0879  hypothetical protein  40.87 
 
 		 322 aa  245  9e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381567 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  39.51 
 
 		 327 aa  245  9e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  43.1 
 
 		 326 aa  245  9e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  42.47 
 
 		 339 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  44.44 
 
 		 322 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  40.86 
 
 		 345 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  40.86 
 
 		 345 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  45.33 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  42.27 
 
 		 322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  39.81 
 
 		 336 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  43.43 
 
 		 324 aa  242  6e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  44.3 
 
 		 325 aa  242  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  41.53 
 
 		 310 aa  242  7.999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  41.02 
 
 		 324 aa  241  9e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  40.27 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  40.37 
 
 		 321 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4634  hypothetical protein  41.36 
 
 		 322 aa  241  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  39.63 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  40.37 
 
 		 321 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  40.86 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  42.71 
 
 		 324 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4401  hypothetical protein  44.63 
 
 		 321 aa  241  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0268815  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5153  extra-cytoplasmic solute receptor  40.85 
 
 		 329 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415379 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  40.87 
 
 		 335 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  40.4 
 
 		 335 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  42.52 
 
 		 337 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  43.58 
 
 		 317 aa  241  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  41.99 
 
 		 341 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  45.15 
 
 		 325 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  40.61 
 
 		 330 aa  239  5e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>