More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2991 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  667    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  84.94 
 
 
333 aa  560  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  71.75 
 
 
345 aa  441  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  71.75 
 
 
345 aa  441  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  71.43 
 
 
360 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  69.23 
 
 
339 aa  432  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  64.86 
 
 
336 aa  421  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  63.96 
 
 
344 aa  418  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  59.74 
 
 
339 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  56.54 
 
 
330 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  56.44 
 
 
330 aa  354  1e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  56.68 
 
 
328 aa  349  4e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  58.42 
 
 
335 aa  339  4e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  53.97 
 
 
327 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  57 
 
 
335 aa  331  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  52.44 
 
 
328 aa  329  4e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  55.42 
 
 
334 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  52.61 
 
 
335 aa  323  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  52.42 
 
 
328 aa  323  4e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  51.37 
 
 
336 aa  319  5e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  50.46 
 
 
334 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  49.23 
 
 
318 aa  317  3e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  54.52 
 
 
325 aa  316  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  52.43 
 
 
330 aa  316  4e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  52.94 
 
 
331 aa  315  6e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  52.58 
 
 
324 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  51.82 
 
 
330 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  51.94 
 
 
328 aa  308  5.9999999999999995e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  51.61 
 
 
328 aa  306  3e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  51.48 
 
 
321 aa  306  3e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  49.54 
 
 
331 aa  306  5.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  52.81 
 
 
339 aa  305  6e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  50.17 
 
 
325 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  47.31 
 
 
333 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  48.37 
 
 
358 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  51.98 
 
 
328 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  51.31 
 
 
322 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  50.83 
 
 
327 aa  302  6.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  49.83 
 
 
334 aa  300  2e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  46.53 
 
 
331 aa  300  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  49.02 
 
 
330 aa  299  4e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  50 
 
 
326 aa  299  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  47.42 
 
 
325 aa  298  7e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  49.02 
 
 
324 aa  298  7e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  50.81 
 
 
314 aa  298  9e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  50.33 
 
 
325 aa  296  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  52.12 
 
 
333 aa  296  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  46.69 
 
 
344 aa  296  3e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  51.32 
 
 
339 aa  296  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  51.82 
 
 
325 aa  296  4e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  51.82 
 
 
327 aa  296  4e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  50.17 
 
 
331 aa  295  6e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1292  hypothetical protein  50.33 
 
 
325 aa  295  7e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  51.67 
 
 
304 aa  295  7e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  48.96 
 
 
353 aa  294  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2416  hypothetical protein  51.83 
 
 
323 aa  294  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3791  hypothetical protein  50.33 
 
 
320 aa  294  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2989  hypothetical protein  51.83 
 
 
323 aa  293  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.593529  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  50.16 
 
 
323 aa  293  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  49.83 
 
 
328 aa  293  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  51.49 
 
 
323 aa  292  5e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  50 
 
 
326 aa  292  5e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  50.65 
 
 
322 aa  291  7e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  49.67 
 
 
328 aa  291  8e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0363  hypothetical protein  47.78 
 
 
322 aa  291  9e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  50.83 
 
 
328 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  47.87 
 
 
326 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5388  hypothetical protein  50.84 
 
 
337 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  50.49 
 
 
355 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  49.68 
 
 
331 aa  290  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  49 
 
 
349 aa  289  4e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  49.04 
 
 
341 aa  289  5.0000000000000004e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  48.51 
 
 
324 aa  288  7e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  47.5 
 
 
323 aa  288  7e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  48.65 
 
 
328 aa  288  8e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  47.73 
 
 
337 aa  288  9e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  49.5 
 
 
326 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  50.98 
 
 
336 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  48.4 
 
 
335 aa  286  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2872  hypothetical protein  49.17 
 
 
334 aa  287  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.446965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  48.18 
 
 
330 aa  286  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  48.18 
 
 
330 aa  286  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3300  hypothetical protein  50.83 
 
 
323 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205377  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  47.91 
 
 
334 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  47.42 
 
 
325 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  50 
 
 
324 aa  285  5.999999999999999e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  45.92 
 
 
324 aa  285  5.999999999999999e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  46.71 
 
 
331 aa  285  8e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  45.75 
 
 
322 aa  285  9e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  47.25 
 
 
322 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  46.3 
 
 
343 aa  283  2.0000000000000002e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  49.19 
 
 
322 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1975  hypothetical protein  48.04 
 
 
328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.222715  normal  0.0272576 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0994  hypothetical protein  49.02 
 
 
341 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1078  hypothetical protein  49.02 
 
 
344 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.058258  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  48.61 
 
 
332 aa  282  5.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  49.34 
 
 
334 aa  282  5.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  47.73 
 
 
324 aa  281  8.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  46.85 
 
 
325 aa  281  8.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  46.53 
 
 
330 aa  281  8.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>