More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0982 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  652    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  89.94 
 
 		 328 aa  570  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  57.14 
 
 		 356 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  54.72 
 
 		 320 aa  347  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  58.86 
 
 		 325 aa  341  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  53.82 
 
 		 326 aa  335  3.9999999999999995e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  55.81 
 
 		 322 aa  335  7e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  52.2 
 
 		 325 aa  329  4e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  51.84 
 
 		 322 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  50.91 
 
 		 331 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  53.29 
 
 		 326 aa  325  7e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2981  hypothetical protein  53.64 
 
 		 322 aa  323  3e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2409  hypothetical protein  53.64 
 
 		 322 aa  323  3e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.417331  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  54.67 
 
 		 328 aa  323  3e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2205  hypothetical protein  51.1 
 
 		 324 aa  323  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0725118 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  54.33 
 
 		 353 aa  322  6e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  51.49 
 
 		 334 aa  321  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  52.01 
 
 		 320 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5118  hypothetical protein  51.97 
 
 		 320 aa  316  3e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534032 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0790  hypothetical protein  54.03 
 
 		 328 aa  315  5e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  49.24 
 
 		 321 aa  305  8.000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  54.07 
 
 		 330 aa  303  4.0000000000000003e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  49.54 
 
 		 327 aa  302  5.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1145  hypothetical protein  49.09 
 
 		 325 aa  302  5.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  48.66 
 
 		 332 aa  302  6.000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0902  hypothetical protein  48.99 
 
 		 320 aa  300  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0987  hypothetical protein  48.99 
 
 		 320 aa  300  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  47.21 
 
 		 318 aa  297  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  48.6 
 
 		 328 aa  296  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1715  hypothetical protein  47.87 
 
 		 320 aa  296  3e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.786272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  47.72 
 
 		 321 aa  296  4e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3459  hypothetical protein  48.03 
 
 		 324 aa  296  4e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505499  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  47.72 
 
 		 321 aa  296  4e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  48.99 
 
 		 328 aa  294  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  45.73 
 
 		 328 aa  294  2e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  47.83 
 
 		 327 aa  293  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  47.83 
 
 		 325 aa  293  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2023  hypothetical protein  47.81 
 
 		 327 aa  293  4e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1141  hypothetical protein  46.39 
 
 		 322 aa  293  4e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  48.69 
 
 		 325 aa  292  6e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4634  hypothetical protein  45.76 
 
 		 322 aa  291  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  49.68 
 
 		 333 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  47.75 
 
 		 318 aa  289  5.0000000000000004e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  48.99 
 
 		 339 aa  288  6e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3994  hypothetical protein  47.87 
 
 		 322 aa  288  7e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.189336 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0879  hypothetical protein  45.45 
 
 		 322 aa  286  4e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381567 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  46.63 
 
 		 329 aa  285  8e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  48.99 
 
 		 328 aa  285  8e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  45.6 
 
 		 328 aa  285  9e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  45.9 
 
 		 347 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  48.64 
 
 		 314 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  47.65 
 
 		 348 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  48.32 
 
 		 335 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  48.03 
 
 		 330 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0801  hypothetical protein  51.07 
 
 		 337 aa  283  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  47.65 
 
 		 330 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  47.21 
 
 		 333 aa  282  7.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  48.2 
 
 		 345 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  48.18 
 
 		 339 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  48.86 
 
 		 360 aa  281  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  48.84 
 
 		 333 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  48.2 
 
 		 345 aa  281  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  47.24 
 
 		 327 aa  280  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  45.12 
 
 		 335 aa  280  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  45.4 
 
 		 336 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  48.85 
 
 		 327 aa  279  4e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  46.47 
 
 		 339 aa  279  5e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  45.13 
 
 		 325 aa  278  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  47.65 
 
 		 322 aa  278  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  49.39 
 
 		 334 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  45.37 
 
 		 344 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  48.32 
 
 		 322 aa  274  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  43.29 
 
 		 334 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  44.63 
 
 		 330 aa  273  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  46.28 
 
 		 324 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  47.54 
 
 		 324 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  45.71 
 
 		 325 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  44.48 
 
 		 304 aa  273  3e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  46.6 
 
 		 336 aa  272  5.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  43.96 
 
 		 330 aa  272  5.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  43.96 
 
 		 356 aa  272  6e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  45.14 
 
 		 332 aa  272  6e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  47.78 
 
 		 325 aa  272  7e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  48 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  45.23 
 
 		 331 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2912  hypothetical protein  48.1 
 
 		 337 aa  271  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  48 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  46.9 
 
 		 339 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  49.31 
 
 		 330 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  43.87 
 
 		 331 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  45.02 
 
 		 331 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  45.25 
 
 		 325 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  45.15 
 
 		 334 aa  268  8.999999999999999e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  43.87 
 
 		 336 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  48.31 
 
 		 353 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  45 
 
 		 324 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  46.28 
 
 		 355 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  44.69 
 
 		 335 aa  267  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  43.92 
 
 		 344 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  45.48 
 
 		 334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>