More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5438 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  658    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  88.86 
 
 		 358 aa  595  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  73.58 
 
 		 328 aa  466  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  73.91 
 
 		 324 aa  458  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  66.98 
 
 		 323 aa  447  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  72.58 
 
 		 326 aa  435  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  68.23 
 
 		 334 aa  422  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  53.85 
 
 		 339 aa  321  9.999999999999999e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  51.59 
 
 		 339 aa  316  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  50.92 
 
 		 324 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  50.77 
 
 		 328 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  52.82 
 
 		 325 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  51.47 
 
 		 328 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  48.76 
 
 		 328 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  50.62 
 
 		 328 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  53.49 
 
 		 327 aa  310  2.9999999999999997e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  50.31 
 
 		 328 aa  309  5e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  50.16 
 
 		 310 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  50.62 
 
 		 336 aa  306  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  51.63 
 
 		 324 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  47.88 
 
 		 336 aa  306  4.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  49.17 
 
 		 330 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  49.51 
 
 		 330 aa  305  9.000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  48.2 
 
 		 331 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  51.35 
 
 		 349 aa  301  7.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  47.29 
 
 		 330 aa  297  2e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  47.29 
 
 		 330 aa  297  2e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  49.38 
 
 		 333 aa  295  7e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  50.5 
 
 		 339 aa  295  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  48.19 
 
 		 330 aa  293  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  50.33 
 
 		 330 aa  293  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  50.48 
 
 		 335 aa  293  4e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  45.65 
 
 		 328 aa  292  5e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  48.49 
 
 		 327 aa  291  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  48.49 
 
 		 325 aa  291  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  45.45 
 
 		 325 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  49.2 
 
 		 333 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  46.18 
 
 		 344 aa  290  3e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  51 
 
 		 328 aa  289  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  49.5 
 
 		 322 aa  289  5.0000000000000004e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  46.89 
 
 		 327 aa  288  6e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  47.67 
 
 		 334 aa  288  1e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  47.38 
 
 		 322 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  51.17 
 
 		 335 aa  286  4e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  48.5 
 
 		 314 aa  285  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  47.02 
 
 		 328 aa  285  5.999999999999999e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  47.83 
 
 		 327 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  46.01 
 
 		 322 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  44.38 
 
 		 326 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  44.48 
 
 		 322 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  46.77 
 
 		 353 aa  282  7.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  47.56 
 
 		 336 aa  282  7.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  48.16 
 
 		 322 aa  281  9e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  48 
 
 		 335 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  47.83 
 
 		 322 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  45.51 
 
 		 348 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  44.12 
 
 		 344 aa  280  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  44.27 
 
 		 332 aa  279  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  45.9 
 
 		 335 aa  279  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  49.67 
 
 		 331 aa  279  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  46.67 
 
 		 304 aa  278  8e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  44.06 
 
 		 331 aa  278  8e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  47.85 
 
 		 325 aa  278  8e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  46.41 
 
 		 360 aa  278  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  44.06 
 
 		 331 aa  278  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  47.12 
 
 		 341 aa  278  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  46.56 
 
 		 331 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  45.9 
 
 		 337 aa  278  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  46.15 
 
 		 355 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  46.08 
 
 		 345 aa  277  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  46.08 
 
 		 345 aa  277  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  47.37 
 
 		 322 aa  277  2e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  44.92 
 
 		 332 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  50.15 
 
 		 334 aa  276  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6260  hypothetical protein  47.37 
 
 		 332 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  46 
 
 		 330 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  49.03 
 
 		 335 aa  276  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2502  hypothetical protein  46.56 
 
 		 333 aa  276  4e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0326182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  47.19 
 
 		 359 aa  276  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0231  hypothetical protein  42.9 
 
 		 329 aa  276  5e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  44.81 
 
 		 335 aa  275  7e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  46.18 
 
 		 321 aa  275  8e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  43.17 
 
 		 328 aa  274  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  46.69 
 
 		 339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  45.62 
 
 		 324 aa  274  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  44.59 
 
 		 339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  46.71 
 
 		 333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  45.06 
 
 		 327 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  46.08 
 
 		 330 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  46.84 
 
 		 326 aa  273  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  43.75 
 
 		 356 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  45.17 
 
 		 324 aa  272  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  45.34 
 
 		 325 aa  272  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  43.44 
 
 		 327 aa  272  7e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  44.33 
 
 		 356 aa  272  7e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  46.89 
 
 		 325 aa  271  8.000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  46.88 
 
 		 332 aa  271  9e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  43.75 
 
 		 324 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  45.36 
 
 		 332 aa  271  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  46.8 
 
 		 325 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>