More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2095 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  646    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  80.56 
 
 
323 aa  527  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  80.94 
 
 
328 aa  496  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  72.1 
 
 
358 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  78.48 
 
 
326 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  71.25 
 
 
326 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  65.78 
 
 
334 aa  427  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  54.18 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  55.18 
 
 
324 aa  325  5e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  51.31 
 
 
328 aa  320  3e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  51.31 
 
 
328 aa  319  3.9999999999999996e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  50.94 
 
 
328 aa  318  5e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  52.63 
 
 
328 aa  315  5e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  50.99 
 
 
325 aa  315  5e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  51.64 
 
 
330 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  51.06 
 
 
336 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  48.77 
 
 
328 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  51.84 
 
 
330 aa  312  4.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  51.15 
 
 
336 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  51.51 
 
 
339 aa  306  4.0000000000000004e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  50.33 
 
 
325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  50.33 
 
 
324 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  50.33 
 
 
327 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  51.54 
 
 
335 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  48.62 
 
 
331 aa  300  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  48.87 
 
 
333 aa  299  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  49.33 
 
 
327 aa  298  8e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  47.77 
 
 
327 aa  298  9e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  48.33 
 
 
330 aa  297  2e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  48.33 
 
 
330 aa  297  2e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  47.88 
 
 
336 aa  297  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  48.8 
 
 
330 aa  296  4e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  45.68 
 
 
326 aa  295  5e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  48.57 
 
 
328 aa  295  6e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  48.99 
 
 
349 aa  295  8e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  50 
 
 
330 aa  294  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  48.52 
 
 
344 aa  291  8e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  50.77 
 
 
334 aa  291  8e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  47.67 
 
 
310 aa  290  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  47.08 
 
 
356 aa  288  6e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  50.17 
 
 
325 aa  288  8e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  48.82 
 
 
325 aa  288  9e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  47.91 
 
 
345 aa  287  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  47.84 
 
 
327 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  47.7 
 
 
333 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  47.91 
 
 
345 aa  287  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  46.91 
 
 
344 aa  286  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  48.67 
 
 
328 aa  286  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  46.23 
 
 
325 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  49.66 
 
 
339 aa  286  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  48 
 
 
304 aa  286  4e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  47.83 
 
 
327 aa  285  5.999999999999999e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  47.42 
 
 
360 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  49.07 
 
 
335 aa  285  7e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  46.33 
 
 
322 aa  285  7e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  48.33 
 
 
331 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  47.28 
 
 
339 aa  284  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  45.57 
 
 
328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  46.25 
 
 
334 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  45.67 
 
 
334 aa  282  5.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  45.83 
 
 
314 aa  281  7.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  46.53 
 
 
335 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  48.2 
 
 
322 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  44.81 
 
 
335 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  49.67 
 
 
335 aa  280  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  48 
 
 
335 aa  279  4e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  48.68 
 
 
339 aa  279  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  48.34 
 
 
324 aa  279  4e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  45.57 
 
 
335 aa  279  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0231  hypothetical protein  43.03 
 
 
329 aa  278  6e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  47.18 
 
 
323 aa  279  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2466  hypothetical protein  45.7 
 
 
321 aa  278  7e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  45.62 
 
 
331 aa  278  9e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  48.67 
 
 
323 aa  278  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  46.58 
 
 
333 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  48.99 
 
 
334 aa  278  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  44.48 
 
 
324 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  45.51 
 
 
321 aa  276  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  46.49 
 
 
355 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  46.49 
 
 
322 aa  276  4e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  43.52 
 
 
331 aa  276  4e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  43.52 
 
 
331 aa  275  6e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  45.39 
 
 
332 aa  275  7e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  46.15 
 
 
328 aa  275  9e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  45.03 
 
 
324 aa  274  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  46.96 
 
 
323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5968  hypothetical protein  47.33 
 
 
344 aa  274  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  49.16 
 
 
330 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  44.75 
 
 
322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  42.59 
 
 
323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  46.49 
 
 
322 aa  273  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  44.24 
 
 
348 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  45.06 
 
 
322 aa  273  3e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  46.49 
 
 
353 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  45.72 
 
 
332 aa  273  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  43.63 
 
 
318 aa  272  6e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  44.44 
 
 
322 aa  272  7e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  47.62 
 
 
333 aa  272  7e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  45.39 
 
 
341 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0363  hypothetical protein  46.13 
 
 
322 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.732087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>