More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4634 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4634  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  639    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  73.07 
 
 
321 aa  480  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  73.07 
 
 
321 aa  480  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  71.74 
 
 
321 aa  473  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0879  hypothetical protein  64.81 
 
 
322 aa  430  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.381567 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3994  hypothetical protein  58.39 
 
 
322 aa  379  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.189336 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  48.85 
 
 
322 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  48.48 
 
 
326 aa  305  9.000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  52.61 
 
 
325 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  47.81 
 
 
325 aa  298  8e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  47.14 
 
 
328 aa  296  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  50.17 
 
 
356 aa  293  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  49.16 
 
 
331 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  48.53 
 
 
320 aa  286  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  47.14 
 
 
328 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5118  hypothetical protein  44.72 
 
 
320 aa  273  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.534032 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  44.44 
 
 
344 aa  273  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  45.21 
 
 
318 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  47.8 
 
 
344 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3459  hypothetical protein  45.09 
 
 
324 aa  269  5e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505499  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  44.24 
 
 
336 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  46.86 
 
 
360 aa  266  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  48 
 
 
330 aa  265  5.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  42.86 
 
 
320 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  45.33 
 
 
328 aa  264  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  45 
 
 
353 aa  264  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  44.11 
 
 
332 aa  264  2e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2205  hypothetical protein  42.68 
 
 
324 aa  262  4.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0725118 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2981  hypothetical protein  44.92 
 
 
322 aa  261  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1145  hypothetical protein  45.26 
 
 
325 aa  260  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  45.54 
 
 
345 aa  260  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2409  hypothetical protein  44.92 
 
 
322 aa  260  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.417331  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  45.54 
 
 
345 aa  260  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  43.53 
 
 
326 aa  258  9e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0902  hypothetical protein  42.86 
 
 
320 aa  258  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0987  hypothetical protein  42.86 
 
 
320 aa  258  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  44.19 
 
 
333 aa  257  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  44.78 
 
 
356 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  41.52 
 
 
339 aa  257  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  45.23 
 
 
327 aa  256  5e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  43.65 
 
 
330 aa  256  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  43.77 
 
 
328 aa  255  9e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  44.34 
 
 
332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  42.12 
 
 
329 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  42.9 
 
 
333 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2023  hypothetical protein  43.08 
 
 
327 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  41.91 
 
 
339 aa  252  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  42.68 
 
 
347 aa  251  9.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  43.92 
 
 
333 aa  250  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  41.07 
 
 
328 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1715  hypothetical protein  42.86 
 
 
320 aa  249  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.786272  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  44.98 
 
 
323 aa  249  5e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  42.42 
 
 
334 aa  248  8e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  43.53 
 
 
328 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0790  hypothetical protein  46.46 
 
 
328 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  43.12 
 
 
326 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  44.3 
 
 
328 aa  246  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  44.41 
 
 
328 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  43.93 
 
 
328 aa  245  8e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  43.32 
 
 
322 aa  245  9e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  42.09 
 
 
331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  46.81 
 
 
324 aa  243  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  44 
 
 
339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  41.08 
 
 
318 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  43.08 
 
 
327 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  42.01 
 
 
330 aa  243  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  42.01 
 
 
330 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  43.85 
 
 
322 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  43.03 
 
 
358 aa  242  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  43.05 
 
 
328 aa  242  7e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1141  hypothetical protein  42.52 
 
 
322 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  41.1 
 
 
330 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  41.45 
 
 
335 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  40.4 
 
 
334 aa  241  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  42.15 
 
 
339 aa  239  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  43.82 
 
 
328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  44.03 
 
 
335 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  43.17 
 
 
330 aa  239  4e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  40.31 
 
 
328 aa  239  5.999999999999999e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  42.42 
 
 
330 aa  238  8e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  42.42 
 
 
330 aa  238  8e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  42.42 
 
 
324 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  42.76 
 
 
334 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  42.76 
 
 
324 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  42.76 
 
 
349 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  42.42 
 
 
327 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  43.29 
 
 
326 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  42.73 
 
 
324 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6030  hypothetical protein  44.3 
 
 
351 aa  237  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.053883  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  42.19 
 
 
328 aa  236  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  41.47 
 
 
310 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  41.5 
 
 
325 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  42.19 
 
 
328 aa  236  4e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  42.36 
 
 
325 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  41.98 
 
 
334 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  42.71 
 
 
330 aa  235  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  42.63 
 
 
328 aa  235  8e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4611  hypothetical protein  40.13 
 
 
349 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  38.66 
 
 
325 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  42.28 
 
 
335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>