More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2117 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  652    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  76.52 
 
 		 330 aa  503  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  75.33 
 
 		 330 aa  480  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  75.33 
 
 		 330 aa  480  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  75.93 
 
 		 349 aa  475  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  71.48 
 
 		 328 aa  448  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  68.46 
 
 		 331 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  51.34 
 
 		 325 aa  329  4e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  51.34 
 
 		 327 aa  328  5.0000000000000004e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  53.85 
 
 		 328 aa  325  5e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  50.67 
 
 		 328 aa  325  7e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  53.85 
 
 		 339 aa  322  4e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  50.15 
 
 		 328 aa  320  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  51.67 
 
 		 330 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  51.67 
 
 		 330 aa  320  3e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  50.16 
 
 		 331 aa  317  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  51.17 
 
 		 325 aa  317  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  47.88 
 
 		 335 aa  316  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  49.66 
 
 		 322 aa  314  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  48.73 
 
 		 336 aa  314  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  50 
 
 		 330 aa  313  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  51.94 
 
 		 324 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  51.23 
 
 		 326 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  48.59 
 
 		 327 aa  311  9e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  48.9 
 
 		 328 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  51.38 
 
 		 358 aa  309  5e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  48.2 
 
 		 360 aa  309  5e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  51.23 
 
 		 335 aa  308  5.9999999999999995e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  49.67 
 
 		 304 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  48.79 
 
 		 333 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  51.17 
 
 		 324 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  51.67 
 
 		 328 aa  305  5.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  48.51 
 
 		 333 aa  304  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  52.01 
 
 		 322 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  49.01 
 
 		 328 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  48.68 
 
 		 328 aa  302  6.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  47.43 
 
 		 331 aa  301  7.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  50.83 
 
 		 333 aa  301  8.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  46.83 
 
 		 325 aa  301  9e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  48.26 
 
 		 314 aa  301  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  48.89 
 
 		 328 aa  300  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  47.54 
 
 		 345 aa  300  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  45.45 
 
 		 344 aa  300  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  47.54 
 
 		 345 aa  300  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  49.04 
 
 		 335 aa  300  3e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  52.01 
 
 		 334 aa  299  5e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  49.33 
 
 		 324 aa  298  6e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  49.33 
 
 		 335 aa  298  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  48.32 
 
 		 337 aa  298  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  48.32 
 
 		 323 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  49.17 
 
 		 333 aa  297  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  45.57 
 
 		 334 aa  296  4e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  52.51 
 
 		 323 aa  296  4e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  47.78 
 
 		 336 aa  296  4e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  48.17 
 
 		 330 aa  295  9e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  47.51 
 
 		 327 aa  293  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  48.68 
 
 		 327 aa  293  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  47.23 
 
 		 335 aa  294  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  52.86 
 
 		 332 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  50 
 
 		 334 aa  292  5e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  49.5 
 
 		 338 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  46.88 
 
 		 325 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  43.73 
 
 		 324 aa  290  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  45.09 
 
 		 327 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  45.31 
 
 		 325 aa  290  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  49.07 
 
 		 332 aa  289  4e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  49.67 
 
 		 326 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  44.34 
 
 		 331 aa  288  6e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  47.81 
 
 		 325 aa  288  7e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  44.34 
 
 		 331 aa  288  7e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  45.9 
 
 		 323 aa  287  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  44.65 
 
 		 332 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  44.66 
 
 		 339 aa  287  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  48.69 
 
 		 336 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  49.49 
 
 		 330 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  48.49 
 
 		 339 aa  286  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  45.85 
 
 		 334 aa  285  8e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  49.15 
 
 		 325 aa  284  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2562  hypothetical protein  49.84 
 
 		 330 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  47.34 
 
 		 330 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  45.73 
 
 		 336 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  46.5 
 
 		 321 aa  282  5.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  45.85 
 
 		 356 aa  282  6.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  46.31 
 
 		 321 aa  281  9e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  44.51 
 
 		 328 aa  281  9e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  47.26 
 
 		 329 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  44.7 
 
 		 331 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  44.94 
 
 		 318 aa  280  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  45.85 
 
 		 323 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4803  hypothetical protein  47.42 
 
 		 474 aa  280  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  49.51 
 
 		 310 aa  279  4e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  46.91 
 
 		 329 aa  279  4e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  46.56 
 
 		 338 aa  278  6e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1128  putative tricarboxylate transporter, periplasmic ligand binding protein (TctC subunit))  47.62 
 
 		 328 aa  278  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3406  hypothetical protein  47.8 
 
 		 322 aa  278  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.88077 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3407  hypothetical protein  47.68 
 
 		 322 aa  278  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.495053  normal  0.890495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  49.33 
 
 		 335 aa  278  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  46.31 
 
 		 339 aa  278  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  48.16 
 
 		 334 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  47 
 
 		 325 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>