More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1141 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1141  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  648    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  69.72 
 
 
326 aa  466  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  70.31 
 
 
322 aa  457  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0801  hypothetical protein  58.72 
 
 
337 aa  351  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  46.71 
 
 
328 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  42.72 
 
 
332 aa  279  4e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  45.28 
 
 
344 aa  278  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  46.3 
 
 
328 aa  276  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  43.48 
 
 
330 aa  273  3e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  43.24 
 
 
330 aa  271  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  42.68 
 
 
328 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  42.41 
 
 
327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  47.47 
 
 
325 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  43.41 
 
 
325 aa  267  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  44.9 
 
 
339 aa  265  8.999999999999999e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5118  hypothetical protein  42.04 
 
 
320 aa  264  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.534032 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  43.18 
 
 
339 aa  264  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  42.14 
 
 
326 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  44.1 
 
 
335 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  40.98 
 
 
318 aa  263  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  45.02 
 
 
356 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  40.89 
 
 
328 aa  262  4.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  42.49 
 
 
331 aa  262  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  44.29 
 
 
353 aa  261  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  42.99 
 
 
344 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  42.64 
 
 
336 aa  260  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  43.99 
 
 
328 aa  260  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  44.15 
 
 
328 aa  258  9e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  42.47 
 
 
328 aa  257  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  43.2 
 
 
330 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3459  hypothetical protein  43.73 
 
 
324 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505499  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  42.47 
 
 
328 aa  257  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  41.67 
 
 
320 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  40.46 
 
 
322 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  41.69 
 
 
331 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  41.35 
 
 
318 aa  256  4e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1145  hypothetical protein  42.27 
 
 
325 aa  256  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  42.52 
 
 
360 aa  255  7e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  44.11 
 
 
335 aa  255  8e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  40.89 
 
 
320 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  43.81 
 
 
333 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5113  extra-cytoplasmic solute receptor  40.37 
 
 
330 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000122246  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  42.81 
 
 
324 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  43.84 
 
 
337 aa  251  8.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  40.98 
 
 
324 aa  251  8.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  40.8 
 
 
335 aa  251  9.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1715  hypothetical protein  41.72 
 
 
320 aa  251  9.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.786272  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  43.22 
 
 
322 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  41.5 
 
 
345 aa  250  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  41.5 
 
 
345 aa  251  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  42.47 
 
 
333 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  42.19 
 
 
330 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2205  hypothetical protein  40.69 
 
 
324 aa  249  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0725118 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  42.54 
 
 
326 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  41.36 
 
 
358 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  41.84 
 
 
339 aa  249  5e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  41.07 
 
 
348 aa  249  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  43.38 
 
 
325 aa  249  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  42.27 
 
 
331 aa  248  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  40.59 
 
 
335 aa  248  8e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  42.76 
 
 
327 aa  248  8e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  43.2 
 
 
335 aa  248  8e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  41.95 
 
 
331 aa  248  9e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  41.94 
 
 
324 aa  248  9e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  41.08 
 
 
328 aa  248  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  40.38 
 
 
328 aa  247  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2023  hypothetical protein  40.13 
 
 
327 aa  247  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  43.75 
 
 
334 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  40.79 
 
 
332 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  42.95 
 
 
324 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3086  hypothetical protein  43.2 
 
 
332 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  41.81 
 
 
326 aa  246  4.9999999999999997e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  39.56 
 
 
323 aa  245  6e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  40.76 
 
 
321 aa  245  6e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  42.27 
 
 
334 aa  245  6.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  40.68 
 
 
339 aa  245  8e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  42.14 
 
 
322 aa  245  9e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  41.16 
 
 
318 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  40 
 
 
327 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  41.75 
 
 
324 aa  245  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  42.28 
 
 
330 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  42.23 
 
 
339 aa  243  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  38.56 
 
 
334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  41.84 
 
 
335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0790  hypothetical protein  44.18 
 
 
328 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0987  hypothetical protein  39.59 
 
 
320 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0902  hypothetical protein  39.59 
 
 
320 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  37.15 
 
 
327 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  42.91 
 
 
349 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  41.67 
 
 
341 aa  242  5e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  43.1 
 
 
331 aa  242  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  43.15 
 
 
338 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4641  hypothetical protein  41.39 
 
 
327 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647286  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5007  hypothetical protein  40.18 
 
 
335 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  38.02 
 
 
325 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  42.32 
 
 
324 aa  241  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  43.46 
 
 
325 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  39.25 
 
 
328 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  42.12 
 
 
325 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  42.12 
 
 
327 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>