More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0790 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0790  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  654    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  61.2 
 
 		 318 aa  403  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5118  hypothetical protein  60.37 
 
 		 320 aa  398  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534032 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  62.37 
 
 		 320 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  62.42 
 
 		 328 aa  390  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2205  hypothetical protein  58.54 
 
 		 324 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0725118 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2023  hypothetical protein  60.24 
 
 		 327 aa  390  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1715  hypothetical protein  60.25 
 
 		 320 aa  386  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.786272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0902  hypothetical protein  60.07 
 
 		 320 aa  384  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0987  hypothetical protein  60.07 
 
 		 320 aa  384  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3459  hypothetical protein  60.13 
 
 		 324 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505499  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2409  hypothetical protein  62.08 
 
 		 322 aa  377  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.417331  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2981  hypothetical protein  62.08 
 
 		 322 aa  377  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  53.23 
 
 		 332 aa  372  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1145  hypothetical protein  57.06 
 
 		 325 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  53.02 
 
 		 328 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  54 
 
 		 328 aa  319  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  53.67 
 
 		 356 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  53.97 
 
 		 325 aa  311  6.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  48 
 
 		 322 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  47.8 
 
 		 326 aa  300  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  46.82 
 
 		 331 aa  293  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  46.64 
 
 		 320 aa  293  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  47.48 
 
 		 325 aa  292  6e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  46.27 
 
 		 329 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  47.18 
 
 		 353 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  46.84 
 
 		 328 aa  280  3e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  45.05 
 
 		 322 aa  276  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  43.14 
 
 		 334 aa  274  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  43.83 
 
 		 321 aa  274  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  44.69 
 
 		 326 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1141  hypothetical protein  43.85 
 
 		 322 aa  268  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  43.34 
 
 		 327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  43.21 
 
 		 321 aa  263  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  43.21 
 
 		 321 aa  263  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  42.17 
 
 		 334 aa  261  8e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  42.48 
 
 		 325 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  45.85 
 
 		 330 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  43.14 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  43.89 
 
 		 328 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4634  hypothetical protein  45.6 
 
 		 322 aa  261  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  44.63 
 
 		 347 aa  259  6e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  43.29 
 
 		 312 aa  258  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  43.23 
 
 		 327 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0801  hypothetical protein  44.63 
 
 		 337 aa  256  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  42.11 
 
 		 324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  39.88 
 
 		 330 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  40.13 
 
 		 325 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  41.54 
 
 		 344 aa  251  8.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0879  hypothetical protein  41.41 
 
 		 322 aa  252  8.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381567 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  41.14 
 
 		 318 aa  251  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  41.54 
 
 		 336 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3994  hypothetical protein  44.31 
 
 		 322 aa  251  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.189336 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  43.67 
 
 		 324 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  47.17 
 
 		 334 aa  250  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  40.31 
 
 		 339 aa  249  3e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4931  extra-cytoplasmic solute receptor  42.47 
 
 		 330 aa  248  9e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  39.26 
 
 		 330 aa  248  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5277  hypothetical protein  41.9 
 
 		 327 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  44.82 
 
 		 360 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  41.95 
 
 		 333 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  43.52 
 
 		 333 aa  245  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  43.38 
 
 		 345 aa  245  9e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  43.38 
 
 		 345 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  40 
 
 		 351 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  38.11 
 
 		 328 aa  243  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  41.9 
 
 		 335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  40.88 
 
 		 332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  40.31 
 
 		 344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  41.07 
 
 		 331 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  41.04 
 
 		 335 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3530  hypothetical protein  45.21 
 
 		 321 aa  242  6e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  41.53 
 
 		 339 aa  242  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  40.94 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  40.24 
 
 		 322 aa  241  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  40.94 
 
 		 327 aa  241  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  40.25 
 
 		 332 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  43.64 
 
 		 325 aa  239  4e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  38.21 
 
 		 330 aa  239  4e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  39.94 
 
 		 324 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  40.47 
 
 		 334 aa  239  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2833  hypothetical protein  43.61 
 
 		 342 aa  238  8e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.226544  normal  0.225758 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  40.94 
 
 		 328 aa  238  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  41.14 
 
 		 326 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2912  hypothetical protein  43.79 
 
 		 337 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  41.05 
 
 		 339 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  40.62 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  39.02 
 
 		 327 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  42.71 
 
 		 341 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  39.26 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  41.58 
 
 		 322 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2040  hypothetical protein  39.3 
 
 		 332 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0456371 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  42.09 
 
 		 334 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5116  hypothetical protein  40.75 
 
 		 332 aa  236  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.855195 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  40.51 
 
 		 348 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  38.82 
 
 		 320 aa  235  9e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  37.65 
 
 		 332 aa  235  9e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  40.94 
 
 		 324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  40.13 
 
 		 324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  37.58 
 
 		 356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>