More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4214 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  647    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  52.9 
 
 		 330 aa  334  9e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  55.18 
 
 		 324 aa  334  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  52.9 
 
 		 330 aa  334  1e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  53.9 
 
 		 349 aa  334  1e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  52.8 
 
 		 339 aa  332  5e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  50.83 
 
 		 330 aa  330  2e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  50.83 
 
 		 330 aa  330  2e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  50.61 
 
 		 326 aa  326  3e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  52.51 
 
 		 335 aa  322  4e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  49.1 
 
 		 358 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  51.16 
 
 		 327 aa  318  7e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  51.7 
 
 		 335 aa  318  7e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  51.58 
 
 		 336 aa  317  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  52.84 
 
 		 324 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  52.51 
 
 		 328 aa  315  7e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  49.66 
 
 		 328 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  49.33 
 
 		 328 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  51.16 
 
 		 328 aa  312  4.999999999999999e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  51.85 
 
 		 323 aa  311  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  50.48 
 
 		 328 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  50.5 
 
 		 328 aa  310  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  47.37 
 
 		 328 aa  308  6.999999999999999e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  51.41 
 
 		 339 aa  307  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  48.72 
 
 		 328 aa  306  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  50.67 
 
 		 325 aa  306  3e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  50.67 
 
 		 327 aa  306  3e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  50.84 
 
 		 339 aa  305  7e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  52.63 
 
 		 335 aa  305  9.000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  51.17 
 
 		 331 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  51.68 
 
 		 335 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  47.27 
 
 		 318 aa  304  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  50.84 
 
 		 304 aa  301  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  46.88 
 
 		 328 aa  300  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  48.01 
 
 		 330 aa  300  3e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  48.38 
 
 		 327 aa  299  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  48.84 
 
 		 333 aa  299  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  46.44 
 
 		 322 aa  299  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  49.83 
 
 		 323 aa  298  7e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  52.15 
 
 		 334 aa  298  8e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  47.16 
 
 		 325 aa  298  9e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  46.84 
 
 		 332 aa  297  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  48.68 
 
 		 344 aa  297  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  46.79 
 
 		 336 aa  296  3e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  48.32 
 
 		 322 aa  295  8e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  48.51 
 
 		 333 aa  294  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  50.67 
 
 		 326 aa  294  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  43.61 
 
 		 331 aa  293  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  46.64 
 
 		 330 aa  293  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  48.81 
 
 		 327 aa  292  6e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  48.16 
 
 		 322 aa  291  7e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  48.8 
 
 		 339 aa  291  7e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  46.49 
 
 		 334 aa  291  7e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  46.65 
 
 		 325 aa  291  8e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  47.68 
 
 		 328 aa  291  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  47.06 
 
 		 335 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  47.49 
 
 		 321 aa  290  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  45.2 
 
 		 323 aa  288  6e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  46.58 
 
 		 337 aa  288  7e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  46.23 
 
 		 333 aa  288  8e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  43.64 
 
 		 344 aa  288  9e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  45.82 
 
 		 325 aa  288  9e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  46.86 
 
 		 332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  46.03 
 
 		 327 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  45.62 
 
 		 331 aa  285  8e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  45.75 
 
 		 360 aa  285  8e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  45.9 
 
 		 345 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  45.62 
 
 		 331 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  45.9 
 
 		 345 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  46.13 
 
 		 339 aa  284  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  44.86 
 
 		 326 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  43.38 
 
 		 325 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  44.44 
 
 		 356 aa  281  8.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5699  hypothetical protein  48.84 
 
 		 327 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  45.75 
 
 		 331 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  47.97 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  46.41 
 
 		 331 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  43.09 
 
 		 318 aa  280  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  44.74 
 
 		 348 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  45.72 
 
 		 310 aa  279  4e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  45 
 
 		 326 aa  279  4e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  47.22 
 
 		 325 aa  279  5e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  43.34 
 
 		 324 aa  278  6e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  44.3 
 
 		 322 aa  278  9e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  46.37 
 
 		 330 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  44.01 
 
 		 339 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  47.49 
 
 		 333 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5878  hypothetical protein  47.3 
 
 		 327 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  47.67 
 
 		 324 aa  276  3e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  46 
 
 		 322 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  42.58 
 
 		 325 aa  276  3e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  45.7 
 
 		 337 aa  276  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  42.54 
 
 		 343 aa  276  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  45.24 
 
 		 337 aa  275  8e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  44.55 
 
 		 328 aa  275  8e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  42.06 
 
 		 334 aa  275  8e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  44.3 
 
 		 332 aa  275  9e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  47.08 
 
 		 327 aa  275  9e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  44.74 
 
 		 332 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  44.44 
 
 		 314 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>