More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0902 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0987  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  638    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0902  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  638    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  81.56 
 
 		 320 aa  524  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  79.05 
 
 		 318 aa  517  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1715  hypothetical protein  78.12 
 
 		 320 aa  502  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.786272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3459  hypothetical protein  80.56 
 
 		 324 aa  499  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505499  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5118  hypothetical protein  75.94 
 
 		 320 aa  497  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534032 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2023  hypothetical protein  73.07 
 
 		 327 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1145  hypothetical protein  71.69 
 
 		 325 aa  454  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2205  hypothetical protein  71.15 
 
 		 324 aa  455  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0725118 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  68.67 
 
 		 328 aa  434  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  68.57 
 
 		 332 aa  436  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2981  hypothetical protein  70.9 
 
 		 322 aa  427  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2409  hypothetical protein  70.9 
 
 		 322 aa  426  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.417331  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0790  hypothetical protein  60.68 
 
 		 328 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  58.39 
 
 		 326 aa  363  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  55.45 
 
 		 322 aa  351  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  54.43 
 
 		 325 aa  342  4e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  54.61 
 
 		 325 aa  333  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  54.6 
 
 		 356 aa  333  3e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  48.78 
 
 		 328 aa  321  9.000000000000001e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  45.69 
 
 		 320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  48.48 
 
 		 328 aa  300  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  43.41 
 
 		 334 aa  291  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  46.51 
 
 		 353 aa  288  6e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  43.25 
 
 		 331 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  47.04 
 
 		 328 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  43.79 
 
 		 329 aa  282  6.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  45.06 
 
 		 321 aa  281  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  45.06 
 
 		 321 aa  281  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  43.21 
 
 		 321 aa  278  8e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  44.09 
 
 		 322 aa  276  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  44.16 
 
 		 326 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  43.23 
 
 		 330 aa  269  4e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  46.77 
 
 		 330 aa  269  4e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  42.67 
 
 		 330 aa  265  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1141  hypothetical protein  40.32 
 
 		 322 aa  264  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4634  hypothetical protein  44 
 
 		 322 aa  264  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  39.75 
 
 		 332 aa  261  8.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  46.5 
 
 		 336 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  44.19 
 
 		 360 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3994  hypothetical protein  42.68 
 
 		 322 aa  256  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.189336 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  41.69 
 
 		 334 aa  255  7e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  41.36 
 
 		 324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  39.01 
 
 		 328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  40.59 
 
 		 325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  40.62 
 
 		 327 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  42.28 
 
 		 324 aa  253  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  41.77 
 
 		 328 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  43.56 
 
 		 345 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  43.56 
 
 		 345 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  40 
 
 		 318 aa  252  7e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  42.04 
 
 		 324 aa  250  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  41.25 
 
 		 312 aa  250  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  39.17 
 
 		 325 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  41.85 
 
 		 330 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  42.81 
 
 		 333 aa  249  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  40.19 
 
 		 344 aa  249  6e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  40.58 
 
 		 339 aa  248  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  42.15 
 
 		 325 aa  247  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  40.19 
 
 		 351 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  42.3 
 
 		 327 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  39.37 
 
 		 698 aa  246  4e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  42.45 
 
 		 358 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  38.84 
 
 		 326 aa  246  6e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  39.18 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  40 
 
 		 332 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  40.6 
 
 		 339 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  41.95 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  40.13 
 
 		 324 aa  243  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  41.9 
 
 		 326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0879  hypothetical protein  38.89 
 
 		 322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381567 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  39.93 
 
 		 325 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  39.94 
 
 		 322 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  42.38 
 
 		 325 aa  243  3.9999999999999997e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2833  hypothetical protein  41.67 
 
 		 342 aa  242  6e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.226544  normal  0.225758 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  41.54 
 
 		 330 aa  242  7.999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1083  hypothetical protein  39.93 
 
 		 337 aa  241  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.371432  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  40.66 
 
 		 328 aa  240  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  41.22 
 
 		 328 aa  240  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  40.44 
 
 		 331 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  41.12 
 
 		 339 aa  240  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  39.26 
 
 		 334 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  41.85 
 
 		 335 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0801  hypothetical protein  40.89 
 
 		 337 aa  239  5e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2912  hypothetical protein  41.16 
 
 		 337 aa  238  8e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  38.39 
 
 		 332 aa  238  9e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  40.88 
 
 		 328 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  38.36 
 
 		 344 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  43.43 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1270  hypothetical protein  40.31 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  38.36 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3797  twin-arginine translocation pathway signal  39.67 
 
 		 329 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.800124  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  39.68 
 
 		 341 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  38.67 
 
 		 327 aa  236  4e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  40 
 
 		 322 aa  236  4e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  38.26 
 
 		 339 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  41.22 
 
 		 333 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  41.85 
 
 		 330 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0909  hypothetical protein  42.66 
 
 		 329 aa  236  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>