More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4323 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  100 
 
 		 344 aa  687    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  75.42 
 
 		 339 aa  469  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  49.83 
 
 		 328 aa  306  3e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  47.87 
 
 		 330 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  51.15 
 
 		 336 aa  303  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  47.52 
 
 		 330 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  49.84 
 
 		 331 aa  302  5.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3797  twin-arginine translocation pathway signal  49.34 
 
 		 329 aa  300  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.800124  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  45.27 
 
 		 332 aa  300  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  48.68 
 
 		 327 aa  299  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  48.05 
 
 		 345 aa  298  7e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  46.27 
 
 		 330 aa  298  7e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  48.05 
 
 		 345 aa  298  9e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  48.5 
 
 		 339 aa  297  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  48.31 
 
 		 328 aa  298  1e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  46.48 
 
 		 339 aa  297  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1449  twin-arginine translocation pathway signal  49.68 
 
 		 331 aa  296  3e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0404058  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  44.38 
 
 		 336 aa  295  5e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  49.01 
 
 		 325 aa  294  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  49.7 
 
 		 335 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  48.06 
 
 		 328 aa  293  3e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  46.25 
 
 		 358 aa  292  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  44.86 
 
 		 331 aa  292  5e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  48.52 
 
 		 326 aa  291  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  46.69 
 
 		 333 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  45.21 
 
 		 344 aa  290  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  48.68 
 
 		 324 aa  290  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  46.18 
 
 		 326 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1578  hypothetical protein  48.34 
 
 		 395 aa  288  7e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383459 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  48.5 
 
 		 324 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  46.71 
 
 		 325 aa  287  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  47.32 
 
 		 325 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  48.01 
 
 		 328 aa  287  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  48.18 
 
 		 327 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  48.18 
 
 		 325 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  44.95 
 
 		 323 aa  286  4e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  46.28 
 
 		 360 aa  286  5e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  43.15 
 
 		 346 aa  285  5.999999999999999e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3927  extra-cytoplasmic solute receptor  46.71 
 
 		 329 aa  285  5.999999999999999e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000102175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  47.96 
 
 		 324 aa  285  9e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  48.98 
 
 		 326 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3271  hypothetical protein  47.1 
 
 		 338 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448127 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  46.05 
 
 		 330 aa  284  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3801  hypothetical protein  46.23 
 
 		 335 aa  284  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694709  normal  0.119002 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  47.02 
 
 		 325 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  46.38 
 
 		 326 aa  283  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  46.2 
 
 		 341 aa  282  5.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  47.68 
 
 		 322 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  43.79 
 
 		 322 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  45.07 
 
 		 334 aa  280  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  49.67 
 
 		 323 aa  280  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  46.58 
 
 		 330 aa  280  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  43.93 
 
 		 339 aa  280  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  45.75 
 
 		 337 aa  280  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  42.28 
 
 		 322 aa  279  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  45.91 
 
 		 339 aa  279  5e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  48.16 
 
 		 334 aa  279  5e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  46.53 
 
 		 322 aa  279  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  45.9 
 
 		 333 aa  278  7e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  45.25 
 
 		 326 aa  278  8e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  44.65 
 
 		 328 aa  278  8e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  45.7 
 
 		 355 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  48.43 
 
 		 334 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  44.24 
 
 		 326 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  45.69 
 
 		 337 aa  278  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  43.25 
 
 		 327 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  46.63 
 
 		 334 aa  276  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  45.48 
 
 		 327 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  47.21 
 
 		 324 aa  276  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  47.23 
 
 		 331 aa  276  5e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  45.97 
 
 		 349 aa  276  5e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  43.08 
 
 		 329 aa  276  5e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  48.62 
 
 		 327 aa  276  5e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  41.07 
 
 		 341 aa  275  6e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  44.08 
 
 		 322 aa  275  7e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  43.44 
 
 		 320 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  44.12 
 
 		 335 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  45.03 
 
 		 330 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  46.71 
 
 		 336 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  45.03 
 
 		 330 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4002  hypothetical protein  48.34 
 
 		 335 aa  273  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0348816 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  45.85 
 
 		 334 aa  273  3e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  43.42 
 
 		 328 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  46.49 
 
 		 330 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  46.86 
 
 		 386 aa  273  4.0000000000000004e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  43.42 
 
 		 328 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  43.52 
 
 		 356 aa  272  7e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  44.14 
 
 		 331 aa  271  9e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  44.77 
 
 		 324 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  41.87 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  43.52 
 
 		 326 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  43.85 
 
 		 339 aa  270  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  42.64 
 
 		 356 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  45.72 
 
 		 339 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  43.56 
 
 		 330 aa  269  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  42.37 
 
 		 341 aa  269  5e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  44.59 
 
 		 332 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  43.2 
 
 		 338 aa  268  7e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  44.52 
 
 		 353 aa  268  8e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  43.19 
 
 		 330 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>