More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4213 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  100 
 
 		 326 aa  659    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4441  hypothetical protein  66.57 
 
 		 385 aa  462  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  59.68 
 
 		 322 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  51.61 
 
 		 345 aa  315  5e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  51.61 
 
 		 345 aa  315  7e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  51.94 
 
 		 339 aa  309  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  49.7 
 
 		 336 aa  309  4e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  49.38 
 
 		 344 aa  306  4.0000000000000004e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  51.01 
 
 		 339 aa  305  9.000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  50.82 
 
 		 360 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  50 
 
 		 328 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  50 
 
 		 324 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  47.2 
 
 		 328 aa  299  5e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  50 
 
 		 333 aa  298  6e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  48.32 
 
 		 330 aa  297  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  48.32 
 
 		 330 aa  297  2e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  51.23 
 
 		 335 aa  296  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  48.67 
 
 		 330 aa  295  5e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  49.83 
 
 		 333 aa  293  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  49.33 
 
 		 326 aa  293  4e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  47.81 
 
 		 327 aa  292  5e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  47.83 
 
 		 328 aa  291  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  45.68 
 
 		 324 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  46.93 
 
 		 328 aa  290  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  51.08 
 
 		 334 aa  287  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  46.23 
 
 		 339 aa  285  9e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  44.38 
 
 		 326 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  47.32 
 
 		 325 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  44.07 
 
 		 358 aa  281  8.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  45.43 
 
 		 325 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  44.79 
 
 		 322 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  46.63 
 
 		 331 aa  277  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  44.24 
 
 		 344 aa  278  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  47.85 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  47.85 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  44.55 
 
 		 328 aa  276  5e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  46.91 
 
 		 325 aa  275  6e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  43.61 
 
 		 325 aa  275  6e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  46.98 
 
 		 339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  46.44 
 
 		 336 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  43.16 
 
 		 333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  48.84 
 
 		 330 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  44.08 
 
 		 323 aa  273  4.0000000000000004e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  46.51 
 
 		 327 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  48.99 
 
 		 323 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  45.36 
 
 		 325 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  45.48 
 
 		 330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  45.48 
 
 		 330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  48.15 
 
 		 335 aa  269  4e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5113  extra-cytoplasmic solute receptor  44.55 
 
 		 330 aa  269  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000122246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  45.97 
 
 		 322 aa  268  7e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  45.74 
 
 		 324 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  47.42 
 
 		 335 aa  268  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  44.15 
 
 		 337 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  46.96 
 
 		 325 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  45.45 
 
 		 386 aa  267  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  44.79 
 
 		 332 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  39.94 
 
 		 339 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  45.64 
 
 		 324 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  45.82 
 
 		 326 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  45.82 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  43.24 
 
 		 324 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  42.62 
 
 		 349 aa  266  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  44.89 
 
 		 328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  46.31 
 
 		 322 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  45.82 
 
 		 331 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  43.26 
 
 		 356 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  44.3 
 
 		 314 aa  265  5.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  45.42 
 
 		 349 aa  265  7e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  43.85 
 
 		 318 aa  265  8.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  41.21 
 
 		 334 aa  265  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4432  hypothetical protein  46.82 
 
 		 324 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65696  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  43.3 
 
 		 344 aa  263  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  42.32 
 
 		 329 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  44.48 
 
 		 337 aa  263  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  41.96 
 
 		 327 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  44.26 
 
 		 335 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  43.49 
 
 		 327 aa  262  4.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  44.63 
 
 		 325 aa  262  4.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  42.72 
 
 		 327 aa  262  6e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  44.63 
 
 		 327 aa  262  6e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  43.22 
 
 		 322 aa  262  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  42.63 
 
 		 333 aa  261  8e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  42.04 
 
 		 318 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3411  hypothetical protein  43.2 
 
 		 330 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  43.58 
 
 		 335 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  43.75 
 
 		 322 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  44.3 
 
 		 314 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  42.14 
 
 		 334 aa  259  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  45.64 
 
 		 322 aa  259  6e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  44.15 
 
 		 326 aa  258  9e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1733  hypothetical protein  45 
 
 		 330 aa  257  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  43.17 
 
 		 325 aa  258  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  43.44 
 
 		 351 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  47.62 
 
 		 330 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  41.3 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  43.96 
 
 		 336 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  44.63 
 
 		 355 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  41.82 
 
 		 325 aa  256  3e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1548  hypothetical protein  44.74 
 
 		 332 aa  256  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>