More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0478 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  650    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  84.62 
 
 		 325 aa  573  1.0000000000000001e-162  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  54.18 
 
 		 332 aa  332  4e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  51.35 
 
 		 327 aa  327  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3580  hypothetical protein  49.83 
 
 		 336 aa  307  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082795  normal  0.0103715 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  46.71 
 
 		 337 aa  293  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  46.98 
 
 		 330 aa  290  3e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  46.58 
 
 		 330 aa  288  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  45.89 
 
 		 332 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  46.35 
 
 		 328 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  42.14 
 
 		 331 aa  275  7e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  47.42 
 
 		 339 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  44.37 
 
 		 328 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  42.41 
 
 		 322 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  42.54 
 
 		 322 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  44.37 
 
 		 328 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  46.03 
 
 		 325 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  42.55 
 
 		 333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  43.27 
 
 		 333 aa  273  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  43.38 
 
 		 318 aa  273  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  42.17 
 
 		 320 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  45.28 
 
 		 325 aa  271  8.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1696  hypothetical protein  45.45 
 
 		 327 aa  269  4e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  42.86 
 
 		 327 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  45.97 
 
 		 338 aa  268  7e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5302  hypothetical protein  44.16 
 
 		 326 aa  268  8e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  43.75 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  42.62 
 
 		 324 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  46.13 
 
 		 328 aa  264  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  42.9 
 
 		 326 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  41.89 
 
 		 334 aa  263  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  43.89 
 
 		 327 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  43.59 
 
 		 331 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  40.31 
 
 		 323 aa  263  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  44.76 
 
 		 328 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  45.85 
 
 		 335 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  44.37 
 
 		 324 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  42.72 
 
 		 358 aa  263  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  44.37 
 
 		 339 aa  262  6e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  42.81 
 
 		 339 aa  261  8e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  41.3 
 
 		 324 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  44.59 
 
 		 330 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  42.72 
 
 		 320 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  41.12 
 
 		 339 aa  259  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  44.78 
 
 		 314 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  44.85 
 
 		 333 aa  259  6e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  46.13 
 
 		 328 aa  259  6e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  44.82 
 
 		 327 aa  259  6e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  42.62 
 
 		 326 aa  258  8e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  41.55 
 
 		 339 aa  258  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  45.79 
 
 		 353 aa  258  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  43.17 
 
 		 326 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  43.48 
 
 		 325 aa  258  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0434  hypothetical protein  44.7 
 
 		 327 aa  256  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000234827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  41.3 
 
 		 330 aa  256  4e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  42.07 
 
 		 320 aa  256  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  41.22 
 
 		 349 aa  256  5e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  43.19 
 
 		 314 aa  255  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0576  hypothetical protein  43.85 
 
 		 333 aa  255  6e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  41.01 
 
 		 324 aa  255  7e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  42.47 
 
 		 322 aa  255  8e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3870  hypothetical protein  40.89 
 
 		 315 aa  255  8e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0646118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  40.56 
 
 		 351 aa  255  8e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  43.61 
 
 		 326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0300  hypothetical protein  42.28 
 
 		 337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  0.367492 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  42.66 
 
 		 349 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  45.45 
 
 		 323 aa  253  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2294  hypothetical protein  40.94 
 
 		 326 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000131413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  39.55 
 
 		 327 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  40.58 
 
 		 698 aa  253  4.0000000000000004e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  41.61 
 
 		 325 aa  252  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  42.09 
 
 		 324 aa  252  7e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  42.72 
 
 		 344 aa  252  7e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  45.57 
 
 		 330 aa  252  8.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  42.39 
 
 		 310 aa  251  8.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  41.82 
 
 		 330 aa  251  1e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  40.89 
 
 		 341 aa  251  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  42.95 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  39.67 
 
 		 335 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  42.31 
 
 		 335 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  42.43 
 
 		 360 aa  250  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  40.98 
 
 		 332 aa  249  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  42.81 
 
 		 331 aa  250  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  40.91 
 
 		 326 aa  249  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  43.17 
 
 		 338 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  40.79 
 
 		 331 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  42.72 
 
 		 345 aa  249  4e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  42.72 
 
 		 345 aa  249  4e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  42.05 
 
 		 336 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0120  hypothetical protein  41.2 
 
 		 361 aa  249  6e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  40.34 
 
 		 362 aa  249  6e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  38.14 
 
 		 344 aa  249  6e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  45.51 
 
 		 330 aa  249  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5699  hypothetical protein  42 
 
 		 327 aa  249  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  39.68 
 
 		 339 aa  249  6e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  43 
 
 		 330 aa  248  7e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  43 
 
 		 330 aa  248  7e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  42.62 
 
 		 334 aa  248  8e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  44 
 
 		 328 aa  248  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  42.99 
 
 		 330 aa  248  9e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>