More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1325 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  667    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5058  extra-cytoplasmic solute receptor  61.46 
 
 		 328 aa  342  5e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0827045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0114  hypothetical protein  52.51 
 
 		 316 aa  315  6e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0097  hypothetical protein  52.17 
 
 		 316 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0210  hypothetical protein  51.85 
 
 		 322 aa  311  7.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  50 
 
 		 330 aa  305  7e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  49.66 
 
 		 330 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4804  hypothetical protein  52.2 
 
 		 350 aa  303  3.0000000000000004e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.589881  normal  0.119891 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  48.58 
 
 		 328 aa  300  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3411  hypothetical protein  49.83 
 
 		 330 aa  299  5e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  50.51 
 
 		 339 aa  298  8e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  44.65 
 
 		 331 aa  295  6e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  50.17 
 
 		 328 aa  295  7e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  46.86 
 
 		 327 aa  294  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  47.46 
 
 		 325 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  45.18 
 
 		 330 aa  281  8.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  44.88 
 
 		 336 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  46.15 
 
 		 339 aa  279  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  46.43 
 
 		 345 aa  279  6e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  46.43 
 
 		 345 aa  278  6e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  48.23 
 
 		 333 aa  276  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5153  extra-cytoplasmic solute receptor  42.77 
 
 		 329 aa  276  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415379 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  44.17 
 
 		 344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  44.74 
 
 		 318 aa  274  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  48.46 
 
 		 335 aa  273  4.0000000000000004e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  45.25 
 
 		 324 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  45.64 
 
 		 360 aa  271  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  41.14 
 
 		 314 aa  269  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  43.46 
 
 		 332 aa  270  4e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  44.3 
 
 		 335 aa  269  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  44.7 
 
 		 330 aa  269  5.9999999999999995e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  47.16 
 
 		 336 aa  268  7e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  44.37 
 
 		 320 aa  268  8e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  45.45 
 
 		 326 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  43.65 
 
 		 338 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  43.43 
 
 		 323 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  44.73 
 
 		 325 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  43.96 
 
 		 322 aa  266  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  45.51 
 
 		 328 aa  266  4e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  45.51 
 
 		 328 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0108  hypothetical protein  43.38 
 
 		 332 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251449 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  46.18 
 
 		 327 aa  265  7e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  41.93 
 
 		 328 aa  265  8e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  47.96 
 
 		 326 aa  264  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  45.79 
 
 		 329 aa  265  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  45.45 
 
 		 329 aa  265  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  44.74 
 
 		 339 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  43.38 
 
 		 335 aa  264  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  42.28 
 
 		 330 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  44.63 
 
 		 337 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  41.25 
 
 		 318 aa  262  4.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  44.77 
 
 		 334 aa  262  6e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  45.51 
 
 		 328 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  43.96 
 
 		 324 aa  262  6.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  46.31 
 
 		 333 aa  262  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  44.48 
 
 		 328 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  46.39 
 
 		 330 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  45.36 
 
 		 339 aa  261  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  45.18 
 
 		 353 aa  260  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  44.95 
 
 		 332 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  46.08 
 
 		 323 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  43.42 
 
 		 333 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  45.45 
 
 		 320 aa  259  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  43.71 
 
 		 356 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  46.18 
 
 		 325 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  42.77 
 
 		 353 aa  259  6e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  46.31 
 
 		 330 aa  258  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  44.86 
 
 		 358 aa  258  7e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  39.69 
 
 		 332 aa  258  8e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  42.71 
 
 		 349 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  40.94 
 
 		 356 aa  258  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  42.38 
 
 		 331 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  43.37 
 
 		 330 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0693  hypothetical protein  44.21 
 
 		 320 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  41.99 
 
 		 318 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  43.96 
 
 		 330 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  43.29 
 
 		 332 aa  257  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  42.05 
 
 		 331 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  38.62 
 
 		 327 aa  255  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  47.33 
 
 		 335 aa  255  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2876  hypothetical protein  44.59 
 
 		 328 aa  255  7e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.364701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  43.83 
 
 		 330 aa  255  8e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  40.55 
 
 		 339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  45.64 
 
 		 326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  45.83 
 
 		 322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  44.52 
 
 		 334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  44.48 
 
 		 355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  43.88 
 
 		 324 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  43.38 
 
 		 321 aa  253  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1190  hypothetical protein  43.89 
 
 		 347 aa  253  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  41.1 
 
 		 331 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1654  hypothetical protein  43.43 
 
 		 326 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.917353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  44.07 
 
 		 332 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  41.78 
 
 		 310 aa  252  6e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  45.92 
 
 		 324 aa  252  7e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  44.26 
 
 		 322 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  41.95 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1323  hypothetical protein  41.34 
 
 		 333 aa  251  1e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  40.48 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  42.09 
 
 		 322 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>