More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4947 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  100 
 
 		 327 aa  663    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4676  hypothetical protein  59.51 
 
 		 327 aa  400  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  55.22 
 
 		 327 aa  341  9e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  50.5 
 
 		 326 aa  314  9.999999999999999e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3862  hypothetical protein  45.55 
 
 		 339 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.915599  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  45.85 
 
 		 333 aa  268  8e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  43.42 
 
 		 332 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  44.63 
 
 		 324 aa  264  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  45.48 
 
 		 327 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  45.58 
 
 		 327 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  44.88 
 
 		 331 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1726  hypothetical protein  44.12 
 
 		 337 aa  258  8e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  44.26 
 
 		 323 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  43.48 
 
 		 330 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  43.71 
 
 		 328 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  42.12 
 
 		 327 aa  255  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  41.67 
 
 		 330 aa  255  6e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  41.55 
 
 		 330 aa  255  8e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5153  extra-cytoplasmic solute receptor  43.27 
 
 		 329 aa  255  8e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415379 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  43.43 
 
 		 348 aa  255  9e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  42.91 
 
 		 328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  41.32 
 
 		 336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  43.09 
 
 		 318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  43.05 
 
 		 339 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  43.23 
 
 		 328 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  41.72 
 
 		 328 aa  253  3e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  45.45 
 
 		 331 aa  253  3e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  41.72 
 
 		 328 aa  253  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  42.14 
 
 		 325 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  39.55 
 
 		 325 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  46.3 
 
 		 331 aa  251  8.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3411  hypothetical protein  42.63 
 
 		 330 aa  251  9.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  42.11 
 
 		 336 aa  249  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  44.11 
 
 		 328 aa  248  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  42.27 
 
 		 322 aa  248  9e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  44.48 
 
 		 332 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  43.62 
 
 		 327 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  44.44 
 
 		 328 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  41.36 
 
 		 326 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  43.48 
 
 		 327 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  45.64 
 
 		 325 aa  246  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  42.81 
 
 		 336 aa  245  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  43.05 
 
 		 330 aa  245  9e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  43.05 
 
 		 330 aa  245  9e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  40.18 
 
 		 328 aa  243  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  41.61 
 
 		 326 aa  242  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  42.95 
 
 		 358 aa  241  9e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  41.91 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  43 
 
 		 362 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3406  hypothetical protein  43.09 
 
 		 322 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.88077 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  41.23 
 
 		 335 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  43.77 
 
 		 331 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  43.25 
 
 		 349 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  42.19 
 
 		 304 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  41.06 
 
 		 324 aa  240  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  43.69 
 
 		 321 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  40.31 
 
 		 335 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  42.76 
 
 		 324 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  41.89 
 
 		 337 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  41.43 
 
 		 325 aa  239  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  40.56 
 
 		 330 aa  238  8e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  38 
 
 		 325 aa  238  9e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0231  hypothetical protein  38.32 
 
 		 329 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  40.82 
 
 		 325 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5058  extra-cytoplasmic solute receptor  43.93 
 
 		 328 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0827045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  41.99 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  44.6 
 
 		 343 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  36.84 
 
 		 325 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  40.82 
 
 		 327 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  42.01 
 
 		 330 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  41.2 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  44.74 
 
 		 339 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  40.88 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  43.85 
 
 		 341 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  40.19 
 
 		 329 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  41.47 
 
 		 332 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  39.32 
 
 		 321 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0576  hypothetical protein  41.96 
 
 		 333 aa  236  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  41.64 
 
 		 360 aa  235  6e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  40.55 
 
 		 334 aa  236  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  40.96 
 
 		 333 aa  235  8e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  41.69 
 
 		 339 aa  235  8e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  41.91 
 
 		 324 aa  235  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  42.12 
 
 		 331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  40.73 
 
 		 338 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  40.94 
 
 		 324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3329  hypothetical protein  44.03 
 
 		 323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  40.91 
 
 		 326 aa  233  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  39.74 
 
 		 356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  39.74 
 
 		 314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0255  hypothetical protein  43.05 
 
 		 332 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  38.73 
 
 		 328 aa  233  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  40.84 
 
 		 345 aa  233  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3913  extra-cytoplasmic solute receptor  38.7 
 
 		 332 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107287  normal  0.463561 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5000  hypothetical protein  41.58 
 
 		 325 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.420695  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  38.73 
 
 		 328 aa  233  3e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  40.84 
 
 		 345 aa  233  3e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  40.74 
 
 		 338 aa  233  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  39.3 
 
 		 322 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  41.59 
 
 		 326 aa  232  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>