More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2597 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  658    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  81.08 
 
 
330 aa  542  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1797  hypothetical protein  69.44 
 
 
334 aa  426  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0211033  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1997  hypothetical protein  69.14 
 
 
334 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.02937  normal  0.517294 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0255  hypothetical protein  65.97 
 
 
332 aa  401  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459081  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  56.93 
 
 
333 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  50.76 
 
 
332 aa  315  5e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  49.68 
 
 
345 aa  298  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  49.68 
 
 
345 aa  298  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  50.45 
 
 
339 aa  295  9e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  49.19 
 
 
328 aa  293  3e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  48.87 
 
 
324 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4278  hypothetical protein  51.17 
 
 
332 aa  289  5.0000000000000004e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239022  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  48.68 
 
 
330 aa  288  6e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  48.7 
 
 
330 aa  288  9e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  48.84 
 
 
327 aa  288  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  47.19 
 
 
328 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  48.33 
 
 
335 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  47.99 
 
 
349 aa  281  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  49.24 
 
 
334 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  45.62 
 
 
331 aa  280  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  47.28 
 
 
339 aa  279  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3407  hypothetical protein  47.95 
 
 
322 aa  279  6e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.495053  normal  0.890495 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  48.47 
 
 
339 aa  278  7e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3406  hypothetical protein  47.32 
 
 
322 aa  277  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.88077 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  46.86 
 
 
326 aa  277  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  48.65 
 
 
331 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  47.88 
 
 
325 aa  277  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  45 
 
 
334 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  47.39 
 
 
360 aa  276  3e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  46.86 
 
 
344 aa  276  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  46.33 
 
 
327 aa  275  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  45.51 
 
 
336 aa  275  5e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  47.32 
 
 
338 aa  275  7e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  44.48 
 
 
328 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  46.08 
 
 
325 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  44.48 
 
 
328 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  48.99 
 
 
337 aa  273  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  44.94 
 
 
325 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  47.6 
 
 
333 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  46.41 
 
 
330 aa  272  7e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  46.41 
 
 
330 aa  272  7e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  46.58 
 
 
328 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  45.73 
 
 
339 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  44.11 
 
 
327 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  46.32 
 
 
326 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  45.9 
 
 
327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  44.76 
 
 
348 aa  269  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  46.82 
 
 
358 aa  269  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0560  twin-arginine translocation pathway signal  43.5 
 
 
325 aa  269  5.9999999999999995e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  44.38 
 
 
336 aa  268  8e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  46.53 
 
 
330 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  46.31 
 
 
323 aa  267  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  47.64 
 
 
339 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  46.8 
 
 
328 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  42.86 
 
 
332 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  46.43 
 
 
337 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  45.03 
 
 
338 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  46.47 
 
 
322 aa  266  4e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  45.19 
 
 
344 aa  265  5.999999999999999e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  44.81 
 
 
331 aa  265  8e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  45.4 
 
 
322 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  43.07 
 
 
325 aa  265  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  43.03 
 
 
327 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  46.96 
 
 
323 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  48.21 
 
 
335 aa  264  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  43.32 
 
 
334 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  47.21 
 
 
330 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  43.67 
 
 
314 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  44.48 
 
 
339 aa  263  4e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  43.84 
 
 
323 aa  262  4.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5153  extra-cytoplasmic solute receptor  45.4 
 
 
329 aa  262  8e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.415379 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  44.38 
 
 
328 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  46.28 
 
 
333 aa  261  8.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  43.6 
 
 
328 aa  261  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  45.36 
 
 
327 aa  260  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  45.73 
 
 
335 aa  260  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  45.36 
 
 
325 aa  260  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2753  hypothetical protein  41.87 
 
 
327 aa  259  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  46.46 
 
 
331 aa  260  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  45.97 
 
 
323 aa  259  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  46.01 
 
 
343 aa  260  3e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  43.83 
 
 
331 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  41.39 
 
 
329 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  42.17 
 
 
324 aa  258  9e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  46.73 
 
 
333 aa  258  9e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2872  hypothetical protein  44.12 
 
 
334 aa  258  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.446965 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  44.37 
 
 
346 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  42.95 
 
 
356 aa  258  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  43.14 
 
 
330 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  43.29 
 
 
331 aa  256  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  43.29 
 
 
331 aa  256  5e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  43.61 
 
 
325 aa  256  5e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  44.18 
 
 
330 aa  255  6e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  44.55 
 
 
338 aa  255  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  43.2 
 
 
330 aa  255  8e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  41.98 
 
 
325 aa  255  8e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  46.38 
 
 
326 aa  255  8e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  44.66 
 
 
327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  45.97 
 
 
330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268792 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>