More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1797 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1997  hypothetical protein  99.4 
 
 
334 aa  656    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.02937  normal  0.517294 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1797  hypothetical protein  100 
 
 
334 aa  660    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0211033  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0255  hypothetical protein  88.32 
 
 
332 aa  536  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459081  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  69.03 
 
 
330 aa  461  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  68.84 
 
 
331 aa  448  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  53.95 
 
 
333 aa  333  3e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  49.7 
 
 
332 aa  306  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  49.68 
 
 
328 aa  299  5e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  49.68 
 
 
328 aa  299  5e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  49.03 
 
 
330 aa  291  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  49.83 
 
 
324 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  49.01 
 
 
330 aa  290  3e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3407  hypothetical protein  47.96 
 
 
322 aa  285  9e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.495053  normal  0.890495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  49.54 
 
 
335 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  49.83 
 
 
349 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  50 
 
 
334 aa  282  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  46.01 
 
 
348 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3406  hypothetical protein  47.02 
 
 
322 aa  279  4e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.88077 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  47.19 
 
 
327 aa  279  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  47.33 
 
 
338 aa  278  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  48.84 
 
 
330 aa  277  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  48.84 
 
 
330 aa  277  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  46.82 
 
 
328 aa  275  7e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  44.97 
 
 
336 aa  275  8e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  44.55 
 
 
331 aa  275  9e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4278  hypothetical protein  50 
 
 
332 aa  274  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239022  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  48.17 
 
 
337 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  47.52 
 
 
327 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  47.96 
 
 
339 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  45.85 
 
 
330 aa  273  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  45.9 
 
 
322 aa  271  9e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  47.96 
 
 
328 aa  271  9e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  48.84 
 
 
323 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  45.45 
 
 
325 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  46.63 
 
 
326 aa  268  8e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  47.47 
 
 
323 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  45.45 
 
 
358 aa  267  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  46.75 
 
 
360 aa  268  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  46.36 
 
 
327 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  46.36 
 
 
325 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  46.62 
 
 
328 aa  264  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  45.45 
 
 
345 aa  265  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  45.45 
 
 
345 aa  265  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  43.84 
 
 
325 aa  264  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  43.95 
 
 
336 aa  264  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  45.05 
 
 
339 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  46.46 
 
 
326 aa  263  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  47.73 
 
 
333 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  45.08 
 
 
339 aa  263  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  47.8 
 
 
339 aa  262  4.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  44.55 
 
 
326 aa  262  6e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  46.18 
 
 
338 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  42.6 
 
 
334 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  44.21 
 
 
331 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  46.45 
 
 
337 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  42.94 
 
 
344 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  43.98 
 
 
332 aa  260  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  46.8 
 
 
324 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  43.34 
 
 
328 aa  259  6e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  44.11 
 
 
328 aa  258  9e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  44.48 
 
 
324 aa  257  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  42.22 
 
 
327 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  46.31 
 
 
323 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  45.85 
 
 
322 aa  257  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  44.48 
 
 
343 aa  257  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  44.78 
 
 
325 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  44.07 
 
 
330 aa  256  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  45.18 
 
 
322 aa  256  5e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  42.51 
 
 
346 aa  256  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  44.85 
 
 
339 aa  256  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  43.14 
 
 
327 aa  256  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  41.98 
 
 
325 aa  255  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  45.05 
 
 
323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  42.86 
 
 
334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  43.12 
 
 
320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  44.41 
 
 
331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  46.55 
 
 
322 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  44.56 
 
 
339 aa  254  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  44.3 
 
 
330 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2876  hypothetical protein  44.91 
 
 
328 aa  253  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.364701  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3086  hypothetical protein  44.7 
 
 
332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2999  hypothetical protein  44.3 
 
 
324 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.272534 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  45.33 
 
 
344 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  44.52 
 
 
337 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  43.49 
 
 
386 aa  252  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  46 
 
 
310 aa  252  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  46.96 
 
 
332 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  42.15 
 
 
331 aa  252  7e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  42.77 
 
 
326 aa  252  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  41.39 
 
 
329 aa  252  8.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3265  hypothetical protein  45.18 
 
 
323 aa  251  9.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  45.21 
 
 
330 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  43.75 
 
 
324 aa  251  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  43.39 
 
 
333 aa  250  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  42.35 
 
 
335 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  43.19 
 
 
335 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  42.69 
 
 
323 aa  250  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  43.32 
 
 
331 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  45.93 
 
 
329 aa  250  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  43.17 
 
 
332 aa  250  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.914226 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>