More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_6021 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  100 
 
 
338 aa  679    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  45.48 
 
 
330 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  47.3 
 
 
325 aa  276  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  47.32 
 
 
331 aa  275  8e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  46.43 
 
 
328 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  46.43 
 
 
328 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  43.28 
 
 
333 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  45.27 
 
 
328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  44.23 
 
 
327 aa  268  8e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  42.32 
 
 
322 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  44.48 
 
 
332 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  44.09 
 
 
318 aa  266  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1797  hypothetical protein  47.04 
 
 
334 aa  266  5e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0211033  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  45.54 
 
 
335 aa  266  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  45.45 
 
 
323 aa  265  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  43.43 
 
 
336 aa  263  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  43.71 
 
 
329 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  43.96 
 
 
338 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  42.28 
 
 
346 aa  260  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  45.27 
 
 
338 aa  261  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1997  hypothetical protein  46.71 
 
 
334 aa  259  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.02937  normal  0.517294 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  44.85 
 
 
327 aa  259  6e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  44.52 
 
 
339 aa  259  7e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  43.5 
 
 
333 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  43.85 
 
 
326 aa  257  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  44.63 
 
 
339 aa  257  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  43.97 
 
 
328 aa  256  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  43.85 
 
 
332 aa  257  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  44.88 
 
 
327 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  42.86 
 
 
360 aa  256  5e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  42.16 
 
 
339 aa  255  6e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  43.62 
 
 
337 aa  255  9e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  42.36 
 
 
339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  43.42 
 
 
344 aa  255  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  41.86 
 
 
325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  47.67 
 
 
323 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  45.75 
 
 
333 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  42.34 
 
 
331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  43.48 
 
 
327 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  42.14 
 
 
330 aa  253  3e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  42.19 
 
 
330 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  40.59 
 
 
344 aa  253  5.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  41.25 
 
 
325 aa  252  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  44.75 
 
 
330 aa  252  8.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  42.37 
 
 
349 aa  251  9.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  44.27 
 
 
334 aa  251  9.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  45.64 
 
 
322 aa  251  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  40.9 
 
 
332 aa  250  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  42.21 
 
 
345 aa  250  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  42.21 
 
 
345 aa  250  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  40.88 
 
 
328 aa  249  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  43.42 
 
 
331 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0255  hypothetical protein  45.33 
 
 
332 aa  249  5e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459081  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  39.81 
 
 
331 aa  249  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  40.8 
 
 
327 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  41.16 
 
 
337 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  41.61 
 
 
314 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  42.14 
 
 
330 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  43.89 
 
 
333 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  44.33 
 
 
327 aa  245  6e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  44.33 
 
 
325 aa  246  6e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  41.09 
 
 
327 aa  245  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  42.95 
 
 
339 aa  245  6.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  42.77 
 
 
325 aa  245  8e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  42.28 
 
 
330 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  43.81 
 
 
327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  42.52 
 
 
332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  41.64 
 
 
326 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  41.69 
 
 
324 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  42.12 
 
 
331 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  42.11 
 
 
328 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  42.12 
 
 
331 aa  243  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  41.01 
 
 
324 aa  243  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  42.14 
 
 
339 aa  242  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  42.28 
 
 
323 aa  243  5e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  42.62 
 
 
343 aa  243  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  40.39 
 
 
335 aa  243  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  42.09 
 
 
335 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  39.02 
 
 
330 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  40.6 
 
 
349 aa  240  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1722  hypothetical protein  39.82 
 
 
338 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2668  hypothetical protein  40.06 
 
 
336 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3411  hypothetical protein  42.22 
 
 
330 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  41.14 
 
 
328 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  43.14 
 
 
322 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  40.18 
 
 
326 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  39.5 
 
 
336 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  41.58 
 
 
325 aa  239  5e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  41.12 
 
 
330 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  43.62 
 
 
324 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  41.08 
 
 
337 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  41.12 
 
 
330 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  43.43 
 
 
324 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  41.14 
 
 
323 aa  238  6.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1021  hypothetical protein  42.81 
 
 
323 aa  239  6.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.345353  normal  0.559311 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  42.71 
 
 
323 aa  238  9e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2871  hypothetical protein  41.55 
 
 
305 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3580  hypothetical protein  41.91 
 
 
336 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082795  normal  0.0103715 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  43.05 
 
 
310 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  40.75 
 
 
330 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>