More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0560 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0560  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 325 aa  656    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2907  hypothetical protein  69.44 
 
 		 327 aa  469  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  63.89 
 
 		 325 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2909  hypothetical protein  54.32 
 
 		 323 aa  371  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1083  hypothetical protein  50 
 
 		 337 aa  333  3e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.371432  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3770  hypothetical protein  47.68 
 
 		 327 aa  329  5.0000000000000004e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353088  normal  0.289939 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4273  hypothetical protein  48.01 
 
 		 324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.292182  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2406  hypothetical protein  47.69 
 
 		 324 aa  302  5.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  45.68 
 
 		 328 aa  286  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  42.46 
 
 		 327 aa  272  7e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  43.61 
 
 		 324 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  42.68 
 
 		 344 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  44.19 
 
 		 327 aa  267  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  45.34 
 
 		 698 aa  266  2.9999999999999995e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  44 
 
 		 325 aa  265  8e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  42.72 
 
 		 328 aa  265  8.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  42.11 
 
 		 331 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  43.29 
 
 		 330 aa  260  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  42.43 
 
 		 330 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  41.81 
 
 		 327 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  42.81 
 
 		 333 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  43.19 
 
 		 304 aa  256  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  43.5 
 
 		 331 aa  256  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  41.72 
 
 		 329 aa  256  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  41.53 
 
 		 325 aa  256  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  42.33 
 
 		 346 aa  256  5e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  42.05 
 
 		 346 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  42.52 
 
 		 339 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  40.18 
 
 		 330 aa  253  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  41.81 
 
 		 356 aa  252  5.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  41 
 
 		 322 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  43.45 
 
 		 314 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  41.16 
 
 		 349 aa  251  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  40.55 
 
 		 339 aa  251  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  40.62 
 
 		 328 aa  249  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  42.72 
 
 		 320 aa  248  7e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  41.86 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  39.08 
 
 		 331 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5777  hypothetical protein  39.26 
 
 		 334 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  41.32 
 
 		 341 aa  246  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  43.1 
 
 		 339 aa  245  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2834  hypothetical protein  41.53 
 
 		 327 aa  245  6.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.421115  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  42.52 
 
 		 341 aa  245  8e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  40.2 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  40 
 
 		 330 aa  243  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  40.27 
 
 		 339 aa  242  6e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  42.33 
 
 		 323 aa  242  6e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  44.03 
 
 		 326 aa  242  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4980  hypothetical protein  40.13 
 
 		 321 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.790818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  39.67 
 
 		 330 aa  240  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  39.67 
 
 		 330 aa  240  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2668  hypothetical protein  37.35 
 
 		 336 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  40.76 
 
 		 352 aa  240  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  37.65 
 
 		 328 aa  239  4e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  37.65 
 
 		 328 aa  239  5e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  37.3 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  39.2 
 
 		 312 aa  238  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  42.35 
 
 		 328 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  37.94 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  40.8 
 
 		 324 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  41.12 
 
 		 336 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  40.45 
 
 		 360 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  41.69 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  41.37 
 
 		 338 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0300  hypothetical protein  42.47 
 
 		 337 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  0.367492 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  40.53 
 
 		 333 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1106  hypothetical protein  38.8 
 
 		 326 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171121  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0909  hypothetical protein  40.96 
 
 		 329 aa  236  5.0000000000000005e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  37.73 
 
 		 327 aa  236  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  37.79 
 
 		 323 aa  235  7e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  38.46 
 
 		 334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  37.21 
 
 		 330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  40.8 
 
 		 331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  37.39 
 
 		 336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  38.77 
 
 		 327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  37.77 
 
 		 331 aa  233  3e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  37.77 
 
 		 331 aa  233  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  36.88 
 
 		 327 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  37.85 
 
 		 330 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  35.46 
 
 		 325 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  36.31 
 
 		 329 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  41.43 
 
 		 332 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  38.54 
 
 		 335 aa  232  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  40.19 
 
 		 318 aa  232  7.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  39.02 
 
 		 323 aa  232  8.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  40.13 
 
 		 323 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  38.21 
 
 		 335 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  40.46 
 
 		 349 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  37.03 
 
 		 336 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  40.82 
 
 		 325 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4278  hypothetical protein  41.98 
 
 		 332 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  38.91 
 
 		 331 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  36.16 
 
 		 325 aa  229  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  39.45 
 
 		 323 aa  229  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  38.34 
 
 		 326 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  36.45 
 
 		 324 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  40 
 
 		 331 aa  229  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  37.84 
 
 		 330 aa  229  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  40.51 
 
 		 326 aa  229  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1427  twin-arginine translocation pathway signal  38.23 
 
 		 334 aa  229  6e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>