More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4980 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4980  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  645    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.790818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2834  hypothetical protein  73.74 
 
 		 327 aa  468  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.421115  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1106  hypothetical protein  47.16 
 
 		 326 aa  301  7.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171121  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  42.5 
 
 		 327 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  42.72 
 
 		 328 aa  267  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  45.28 
 
 		 304 aa  266  5e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  43.22 
 
 		 327 aa  262  6e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  43.69 
 
 		 328 aa  261  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  45.31 
 
 		 333 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  44.67 
 
 		 322 aa  260  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  43.29 
 
 		 325 aa  258  7e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  43.29 
 
 		 327 aa  258  9e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3770  hypothetical protein  42.42 
 
 		 327 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353088  normal  0.289939 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  44.63 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  45.85 
 
 		 344 aa  256  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  42.12 
 
 		 337 aa  256  4e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  43.89 
 
 		 348 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  42.14 
 
 		 328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  40.13 
 
 		 328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2909  hypothetical protein  40.99 
 
 		 323 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  40.62 
 
 		 325 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  41.36 
 
 		 331 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  42.42 
 
 		 341 aa  253  4.0000000000000004e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  42.52 
 
 		 327 aa  252  6e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  42.3 
 
 		 325 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  41.58 
 
 		 330 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  43.71 
 
 		 328 aa  250  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  43.49 
 
 		 332 aa  249  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  43.71 
 
 		 328 aa  249  4e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  40.67 
 
 		 324 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  41.43 
 
 		 336 aa  249  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  40.63 
 
 		 346 aa  248  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  41.55 
 
 		 337 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  43.35 
 
 		 322 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0560  twin-arginine translocation pathway signal  39.81 
 
 		 325 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2562  hypothetical protein  40.62 
 
 		 330 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  44.44 
 
 		 330 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  43 
 
 		 335 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  40.13 
 
 		 327 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  40.66 
 
 		 336 aa  246  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  38.63 
 
 		 322 aa  245  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  41.95 
 
 		 355 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  41.61 
 
 		 324 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  38.87 
 
 		 329 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  41.28 
 
 		 339 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3526  hypothetical protein  41.25 
 
 		 371 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  38.39 
 
 		 325 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  41.51 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  40.27 
 
 		 325 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  40.78 
 
 		 337 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  39.16 
 
 		 330 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  38.26 
 
 		 332 aa  242  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2907  hypothetical protein  39.81 
 
 		 327 aa  242  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4273  hypothetical protein  40.89 
 
 		 324 aa  241  9e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.292182  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  38.93 
 
 		 331 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  41.08 
 
 		 314 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  40.51 
 
 		 335 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  39.08 
 
 		 333 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  46.13 
 
 		 325 aa  240  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  41.81 
 
 		 349 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  41.81 
 
 		 335 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  41.8 
 
 		 345 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  41.8 
 
 		 345 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  39.74 
 
 		 335 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  42.66 
 
 		 333 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  38.46 
 
 		 330 aa  239  4e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  37.5 
 
 		 334 aa  239  4e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  41.28 
 
 		 349 aa  239  4e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0363  hypothetical protein  40.69 
 
 		 322 aa  238  6.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  37.65 
 
 		 328 aa  238  6.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  45.3 
 
 		 323 aa  238  8e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  38.92 
 
 		 698 aa  238  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  41.07 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  40.86 
 
 		 353 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  39.47 
 
 		 330 aa  236  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2127  hypothetical protein  40.37 
 
 		 332 aa  236  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00713348 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  39.47 
 
 		 330 aa  236  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  41.75 
 
 		 328 aa  236  4e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4433  extra-cytoplasmic solute receptor  41.61 
 
 		 327 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  39.68 
 
 		 331 aa  235  6e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  42.86 
 
 		 339 aa  235  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  40.6 
 
 		 338 aa  235  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  41.47 
 
 		 323 aa  235  7e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  41.3 
 
 		 334 aa  235  9e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  42.63 
 
 		 341 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  40.45 
 
 		 326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  39.8 
 
 		 356 aa  234  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  39.93 
 
 		 325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  41.42 
 
 		 330 aa  233  3e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  37.42 
 
 		 327 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1145  hypothetical protein  40.31 
 
 		 325 aa  233  4.0000000000000004e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2765  hypothetical protein  39.33 
 
 		 332 aa  233  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  40.13 
 
 		 325 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  37.95 
 
 		 330 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  40.69 
 
 		 326 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  40.68 
 
 		 339 aa  232  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  39.81 
 
 		 327 aa  232  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  40.33 
 
 		 341 aa  233  5e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2753  hypothetical protein  37.15 
 
 		 327 aa  232  8.000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2294  hypothetical protein  42.62 
 
 		 326 aa  232  8.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000131413  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>