More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1019 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  100 
 
 
334 aa  669    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1548  hypothetical protein  55.85 
 
 
332 aa  341  1e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2127  hypothetical protein  49.51 
 
 
332 aa  300  3e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00713348 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  48.53 
 
 
330 aa  294  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  49.24 
 
 
339 aa  294  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  51.49 
 
 
325 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  48.92 
 
 
325 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  48.17 
 
 
330 aa  287  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1189  hypothetical protein  47.12 
 
 
330 aa  285  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  48.84 
 
 
337 aa  283  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  45.14 
 
 
343 aa  280  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  45.73 
 
 
329 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  47.85 
 
 
336 aa  278  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  49.15 
 
 
325 aa  277  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  46.63 
 
 
344 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1967  hypothetical protein  46.25 
 
 
332 aa  276  5e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.829127  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  45.73 
 
 
344 aa  275  5e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  48.36 
 
 
345 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  48.36 
 
 
345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  46.33 
 
 
339 aa  272  5.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  45.93 
 
 
334 aa  272  6e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  45.96 
 
 
324 aa  272  7e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  46.71 
 
 
328 aa  271  9e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  47.77 
 
 
353 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  47.56 
 
 
328 aa  271  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  46.03 
 
 
360 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  46.23 
 
 
355 aa  268  8e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  46.31 
 
 
338 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  46.26 
 
 
330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  47.95 
 
 
325 aa  266  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  47.33 
 
 
304 aa  264  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  43.73 
 
 
356 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  44.16 
 
 
324 aa  263  4e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  44.51 
 
 
336 aa  262  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  45.89 
 
 
326 aa  262  8e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  47.3 
 
 
324 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  46.69 
 
 
322 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  43.12 
 
 
327 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  46.51 
 
 
327 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  46.78 
 
 
349 aa  261  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  45.82 
 
 
330 aa  260  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  45.82 
 
 
330 aa  260  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  45.48 
 
 
328 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  43.09 
 
 
324 aa  259  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  46.53 
 
 
335 aa  258  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  46.23 
 
 
328 aa  258  7e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  49.83 
 
 
335 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  43.85 
 
 
336 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  43.81 
 
 
335 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  45.63 
 
 
325 aa  256  3e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  44.3 
 
 
325 aa  256  5e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  42.41 
 
 
331 aa  256  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  44.07 
 
 
331 aa  256  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  47.78 
 
 
322 aa  256  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  45.55 
 
 
326 aa  255  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  41.64 
 
 
326 aa  255  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  46.64 
 
 
328 aa  255  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  45.79 
 
 
325 aa  255  8e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  42.36 
 
 
358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  43.89 
 
 
339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  42.62 
 
 
334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  44.7 
 
 
327 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  44.62 
 
 
327 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  41.05 
 
 
332 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  42.64 
 
 
321 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  44.93 
 
 
344 aa  253  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  45.64 
 
 
328 aa  253  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  44.7 
 
 
325 aa  253  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  43.39 
 
 
335 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  45 
 
 
328 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  43.21 
 
 
328 aa  252  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2871  hypothetical protein  43.23 
 
 
305 aa  252  8.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  43.29 
 
 
333 aa  251  9.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  45.73 
 
 
323 aa  251  9.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  44.38 
 
 
327 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  44.52 
 
 
343 aa  251  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  43.14 
 
 
323 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  44.37 
 
 
339 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  48.04 
 
 
322 aa  251  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  44.41 
 
 
324 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  45.51 
 
 
322 aa  251  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  45.33 
 
 
333 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  43.79 
 
 
322 aa  250  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  44.19 
 
 
333 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  44.44 
 
 
324 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  44.19 
 
 
334 aa  250  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0909  hypothetical protein  45.02 
 
 
329 aa  251  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  42.86 
 
 
322 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2999  hypothetical protein  42.67 
 
 
324 aa  249  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.272534 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  47.16 
 
 
330 aa  249  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  40.56 
 
 
336 aa  249  5e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0994  hypothetical protein  41.55 
 
 
341 aa  249  6e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  41.8 
 
 
331 aa  249  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  42.91 
 
 
328 aa  249  6e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1078  hypothetical protein  41.55 
 
 
344 aa  249  6e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.058258  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  42.91 
 
 
328 aa  249  6e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  44.24 
 
 
323 aa  248  8e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  43.89 
 
 
310 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  41.82 
 
 
330 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4314  hypothetical protein  44.48 
 
 
322 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210006  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>