More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5733 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  679    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  44.55 
 
 		 336 aa  279  5e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  47.28 
 
 		 325 aa  279  5e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  47.42 
 
 		 345 aa  279  6e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  47.42 
 
 		 345 aa  278  7e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  46.75 
 
 		 360 aa  273  3e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  45.25 
 
 		 339 aa  273  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  43.96 
 
 		 331 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  44.98 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  44.55 
 
 		 330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  44.51 
 
 		 332 aa  269  5e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2872  hypothetical protein  45.12 
 
 		 334 aa  269  5e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.446965 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  45.48 
 
 		 325 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  46.15 
 
 		 344 aa  269  5.9999999999999995e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  44.85 
 
 		 324 aa  269  7e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  45.48 
 
 		 327 aa  268  7e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  43 
 
 		 331 aa  268  8.999999999999999e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  41.98 
 
 		 341 aa  268  8.999999999999999e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  44.09 
 
 		 327 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  44.76 
 
 		 327 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  46.41 
 
 		 333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  44.88 
 
 		 334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  44.18 
 
 		 344 aa  266  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  41.08 
 
 		 334 aa  266  4e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  44.67 
 
 		 330 aa  266  5e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  44.97 
 
 		 317 aa  266  5e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  44 
 
 		 330 aa  266  5e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  42.19 
 
 		 328 aa  265  5.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  42.81 
 
 		 339 aa  265  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  44.97 
 
 		 317 aa  265  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  45.57 
 
 		 334 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  43.77 
 
 		 304 aa  265  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  43.69 
 
 		 328 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  41.38 
 
 		 328 aa  264  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  44.3 
 
 		 333 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2834  hypothetical protein  43.19 
 
 		 327 aa  263  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.421115  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  45.07 
 
 		 324 aa  263  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  41.47 
 
 		 343 aa  262  4.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  44.94 
 
 		 328 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  46.31 
 
 		 326 aa  262  4.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  41.09 
 
 		 331 aa  262  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  40.92 
 
 		 332 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  45.54 
 
 		 333 aa  262  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  41.23 
 
 		 329 aa  261  8.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  41.62 
 
 		 334 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  44.59 
 
 		 330 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  43.69 
 
 		 322 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  42.99 
 
 		 326 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  44.34 
 
 		 335 aa  259  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  42.51 
 
 		 333 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  43.93 
 
 		 327 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  42.95 
 
 		 335 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  41.1 
 
 		 332 aa  258  9e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  44.63 
 
 		 321 aa  258  9e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  41.93 
 
 		 324 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  44.78 
 
 		 325 aa  258  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  43.89 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  41.81 
 
 		 334 aa  257  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2753  hypothetical protein  41.1 
 
 		 327 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  45.34 
 
 		 323 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  40.73 
 
 		 312 aa  257  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  42.02 
 
 		 337 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  45.1 
 
 		 366 aa  256  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  44.51 
 
 		 327 aa  256  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  43.43 
 
 		 338 aa  256  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  41.58 
 
 		 325 aa  255  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  45.17 
 
 		 339 aa  255  6e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  43.85 
 
 		 320 aa  255  7e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  41.32 
 
 		 334 aa  255  8e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  44.41 
 
 		 330 aa  255  8e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  42.28 
 
 		 335 aa  255  9e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5388  hypothetical protein  43.03 
 
 		 337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  41.16 
 
 		 346 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  43.87 
 
 		 314 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  45.64 
 
 		 355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  45.33 
 
 		 335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2765  hypothetical protein  42.57 
 
 		 332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  43.43 
 
 		 323 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  44.44 
 
 		 322 aa  253  3e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  41.18 
 
 		 356 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4980  hypothetical protein  42.42 
 
 		 321 aa  253  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.790818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  40.59 
 
 		 328 aa  253  3e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  41.56 
 
 		 321 aa  253  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  40.59 
 
 		 328 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  45.97 
 
 		 322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1270  hypothetical protein  40.99 
 
 		 323 aa  252  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  45.02 
 
 		 325 aa  253  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  39.18 
 
 		 322 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  43.29 
 
 		 328 aa  252  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  45.3 
 
 		 353 aa  252  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  46.18 
 
 		 326 aa  252  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  43.81 
 
 		 328 aa  252  7e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  44.92 
 
 		 334 aa  252  7e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6131  hypothetical protein  44.56 
 
 		 314 aa  252  8.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  42.96 
 
 		 326 aa  252  8.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  44 
 
 		 327 aa  251  9.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  41.53 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  44.55 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  40.3 
 
 		 332 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  44.79 
 
 		 335 aa  251  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>