More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2562 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_2562  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  654    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  51.5 
 
 
327 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  47.27 
 
 
328 aa  290  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  49.38 
 
 
326 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  46.97 
 
 
328 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  46.22 
 
 
336 aa  287  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  43.96 
 
 
332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  46.2 
 
 
336 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  48.3 
 
 
358 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  43.69 
 
 
327 aa  282  6.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  45.37 
 
 
336 aa  281  8.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  46.71 
 
 
328 aa  281  9e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  44.85 
 
 
328 aa  279  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  46.33 
 
 
355 aa  279  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  44.3 
 
 
325 aa  279  5e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  46.06 
 
 
330 aa  279  6e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  46.06 
 
 
330 aa  279  6e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  46.39 
 
 
323 aa  279  6e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  46.36 
 
 
330 aa  278  6e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  47.65 
 
 
339 aa  278  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  46.27 
 
 
339 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  42.72 
 
 
331 aa  277  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  42.72 
 
 
331 aa  277  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  46.08 
 
 
330 aa  276  3e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  44.51 
 
 
328 aa  276  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  46.31 
 
 
327 aa  276  5e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  46.31 
 
 
325 aa  275  6e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  46.64 
 
 
323 aa  275  6e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  43.38 
 
 
331 aa  275  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  46.49 
 
 
330 aa  275  9e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  43.12 
 
 
335 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  45.93 
 
 
360 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  45.18 
 
 
344 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  46.98 
 
 
321 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  43 
 
 
335 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  43.69 
 
 
353 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  46.78 
 
 
349 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  47.67 
 
 
324 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  45.19 
 
 
345 aa  268  5.9999999999999995e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  45.19 
 
 
345 aa  268  7e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  43.89 
 
 
335 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  46.05 
 
 
324 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  43.08 
 
 
327 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  43.62 
 
 
349 aa  268  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  48.11 
 
 
304 aa  267  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4356  hypothetical protein  43.48 
 
 
323 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  44.31 
 
 
332 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  41.28 
 
 
327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  41.14 
 
 
333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1083  hypothetical protein  39.02 
 
 
337 aa  266  4e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.371432  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  42.9 
 
 
328 aa  266  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  44.62 
 
 
334 aa  265  5.999999999999999e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  45.64 
 
 
339 aa  265  7e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  46.53 
 
 
333 aa  265  7e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  46.08 
 
 
333 aa  265  7e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  45.48 
 
 
328 aa  265  8e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  42.94 
 
 
334 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  44.15 
 
 
334 aa  264  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  44.33 
 
 
337 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  41.56 
 
 
333 aa  263  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  43.69 
 
 
322 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  44.16 
 
 
327 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  41.82 
 
 
325 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  44.33 
 
 
325 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  43.96 
 
 
324 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  43.45 
 
 
332 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  44.92 
 
 
328 aa  263  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  42.32 
 
 
325 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  44.15 
 
 
332 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4002  hypothetical protein  46.91 
 
 
335 aa  263  4e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0348816 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  43.5 
 
 
330 aa  263  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  44.48 
 
 
328 aa  263  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  45.54 
 
 
333 aa  262  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  44.82 
 
 
331 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  42.14 
 
 
330 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  44.67 
 
 
318 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  45.97 
 
 
323 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  43.05 
 
 
335 aa  260  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  44.98 
 
 
326 aa  260  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1726  hypothetical protein  42.64 
 
 
337 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183123  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  45 
 
 
314 aa  259  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  41.23 
 
 
331 aa  260  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  43.96 
 
 
331 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  43.79 
 
 
331 aa  259  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  43.44 
 
 
330 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  44.17 
 
 
323 aa  259  4e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  42.95 
 
 
330 aa  259  6e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  42.99 
 
 
322 aa  258  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  44.59 
 
 
327 aa  258  7e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  46.92 
 
 
333 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  43.24 
 
 
339 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0039  hypothetical protein  43.73 
 
 
324 aa  257  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  43.57 
 
 
331 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  42.31 
 
 
322 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  45.51 
 
 
325 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0145  hypothetical protein  43.65 
 
 
325 aa  256  3e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  41.74 
 
 
323 aa  256  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  41.44 
 
 
339 aa  256  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3526  hypothetical protein  41.59 
 
 
371 aa  256  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  41.23 
 
 
321 aa  256  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>