More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2869 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  99.39 
 
 		 330 aa  659    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  663    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  75.45 
 
 		 328 aa  484  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  78.52 
 
 		 339 aa  480  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  75.75 
 
 		 335 aa  450  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  64.53 
 
 		 335 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  65.33 
 
 		 334 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  56.21 
 
 		 333 aa  354  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  54.18 
 
 		 328 aa  352  7e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  57.81 
 
 		 324 aa  351  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  55.45 
 
 		 333 aa  351  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  51.21 
 
 		 327 aa  344  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  53.19 
 
 		 336 aa  343  2.9999999999999997e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  54.15 
 
 		 331 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  51.23 
 
 		 328 aa  342  4e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  53.23 
 
 		 345 aa  342  5e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  51.08 
 
 		 327 aa  342  5e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  53.23 
 
 		 345 aa  342  7e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  53.44 
 
 		 339 aa  339  5e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  49.39 
 
 		 331 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  51.32 
 
 		 325 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  51.62 
 
 		 360 aa  334  1e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  52.9 
 
 		 324 aa  328  8e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  52.33 
 
 		 327 aa  326  3e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  52.33 
 
 		 325 aa  326  3e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  48.61 
 
 		 333 aa  325  6e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  52.01 
 
 		 330 aa  325  7e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  52.29 
 
 		 328 aa  324  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  53.18 
 
 		 328 aa  323  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  52.84 
 
 		 331 aa  323  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  50.17 
 
 		 328 aa  323  3e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  50.17 
 
 		 328 aa  323  4e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  47.89 
 
 		 328 aa  322  6e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  50.67 
 
 		 321 aa  321  9.999999999999999e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  51.67 
 
 		 327 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  49.21 
 
 		 318 aa  320  1.9999999999999998e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  47.34 
 
 		 344 aa  319  3e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  51.09 
 
 		 336 aa  318  6e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  49.53 
 
 		 339 aa  317  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  53.85 
 
 		 323 aa  315  7e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  49.83 
 
 		 349 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  50.95 
 
 		 320 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  48.53 
 
 		 335 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  49.5 
 
 		 324 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  49.16 
 
 		 325 aa  313  3.9999999999999997e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  50.33 
 
 		 330 aa  312  3.9999999999999997e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  50.33 
 
 		 330 aa  312  3.9999999999999997e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  51.84 
 
 		 324 aa  312  4.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  52.01 
 
 		 326 aa  312  5.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  49.67 
 
 		 322 aa  311  6.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  47.99 
 
 		 325 aa  311  7.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  48.29 
 
 		 322 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  51.17 
 
 		 328 aa  311  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  48.84 
 
 		 356 aa  310  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  46.46 
 
 		 326 aa  310  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  48.62 
 
 		 324 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  50.66 
 
 		 325 aa  309  4e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  50.47 
 
 		 322 aa  308  5.9999999999999995e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  48.53 
 
 		 337 aa  308  8e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  45.13 
 
 		 344 aa  308  9e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  48.93 
 
 		 358 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  48.68 
 
 		 336 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  46.11 
 
 		 332 aa  307  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  47.01 
 
 		 330 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  47.56 
 
 		 314 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  44.78 
 
 		 351 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  47.26 
 
 		 326 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  51.03 
 
 		 330 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  49.83 
 
 		 335 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  46.2 
 
 		 325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  45.03 
 
 		 322 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  52.88 
 
 		 330 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  44.44 
 
 		 325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  48.99 
 
 		 304 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  46.88 
 
 		 334 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  51.19 
 
 		 338 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  46.82 
 
 		 337 aa  303  3.0000000000000004e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  50.5 
 
 		 353 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  49.66 
 
 		 327 aa  302  5.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  49.66 
 
 		 335 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  46.79 
 
 		 318 aa  302  5.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  44.72 
 
 		 339 aa  302  6.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  50 
 
 		 341 aa  302  6.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  50.5 
 
 		 328 aa  301  8.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  48.67 
 
 		 332 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  48.45 
 
 		 330 aa  301  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  46.5 
 
 		 331 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  47.83 
 
 		 334 aa  301  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  48.18 
 
 		 330 aa  301  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  46.37 
 
 		 329 aa  301  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  48.15 
 
 		 323 aa  301  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  48.43 
 
 		 326 aa  300  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  50.47 
 
 		 330 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  47.17 
 
 		 320 aa  300  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  49.84 
 
 		 322 aa  300  3e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  47.27 
 
 		 330 aa  299  4e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  47.88 
 
 		 336 aa  299  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  48.99 
 
 		 339 aa  299  5e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  50 
 
 		 353 aa  299  5e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  48.32 
 
 		 326 aa  298  9e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>