More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3949 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  674    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  57.58 
 
 		 332 aa  394  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1323  hypothetical protein  58.75 
 
 		 333 aa  379  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  58.28 
 
 		 310 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5830  hypothetical protein  60.87 
 
 		 339 aa  362  4e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6260  hypothetical protein  56.38 
 
 		 332 aa  320  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  49.5 
 
 		 330 aa  318  7.999999999999999e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  51.59 
 
 		 326 aa  318  7.999999999999999e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  49.39 
 
 		 336 aa  317  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  51.23 
 
 		 358 aa  316  5e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  49.83 
 
 		 330 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0625  hypothetical protein  57.25 
 
 		 276 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.545238  normal  0.474322 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  50.34 
 
 		 330 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  50.81 
 
 		 345 aa  311  1e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  49.39 
 
 		 339 aa  311  1e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  50.81 
 
 		 345 aa  311  1e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  50.17 
 
 		 328 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  49.5 
 
 		 356 aa  310  2.9999999999999997e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  50.17 
 
 		 328 aa  309  4e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  51.49 
 
 		 328 aa  308  5.9999999999999995e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  49.23 
 
 		 328 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  49.54 
 
 		 353 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  47.99 
 
 		 327 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  50.17 
 
 		 355 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  49.84 
 
 		 360 aa  302  6.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  50.51 
 
 		 339 aa  301  9e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  50.84 
 
 		 324 aa  298  7e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  51.31 
 
 		 333 aa  297  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  47.11 
 
 		 333 aa  297  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  50.34 
 
 		 325 aa  296  3e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  46.65 
 
 		 328 aa  296  4e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  47.98 
 
 		 331 aa  296  4e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  48.04 
 
 		 331 aa  295  9e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  47.08 
 
 		 339 aa  294  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  45.87 
 
 		 328 aa  293  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  46.48 
 
 		 332 aa  293  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  46.73 
 
 		 332 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  45.92 
 
 		 344 aa  291  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  48.81 
 
 		 321 aa  291  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  46.2 
 
 		 335 aa  290  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  48.34 
 
 		 324 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  48.67 
 
 		 304 aa  289  4e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  48.99 
 
 		 325 aa  289  4e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  48.99 
 
 		 327 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4641  hypothetical protein  48.36 
 
 		 327 aa  288  7e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647286  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  46.47 
 
 		 328 aa  287  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  48.68 
 
 		 333 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  46.3 
 
 		 336 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  48.33 
 
 		 327 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  46.98 
 
 		 334 aa  286  4e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  49.66 
 
 		 324 aa  286  4e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  49.83 
 
 		 328 aa  285  7e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  44.58 
 
 		 334 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  44.75 
 
 		 330 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  48.5 
 
 		 323 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  48.78 
 
 		 322 aa  284  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  47.08 
 
 		 333 aa  283  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  46.88 
 
 		 320 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  45.68 
 
 		 325 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  48.22 
 
 		 324 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  47.4 
 
 		 336 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  48.3 
 
 		 349 aa  282  8.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  48.97 
 
 		 328 aa  281  9e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  45.73 
 
 		 322 aa  281  9e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  48 
 
 		 330 aa  280  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  48.32 
 
 		 328 aa  281  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  44.22 
 
 		 335 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  50.51 
 
 		 323 aa  280  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  46.5 
 
 		 325 aa  280  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  44.48 
 
 		 324 aa  280  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  45.68 
 
 		 338 aa  279  6e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  45.02 
 
 		 314 aa  279  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  47 
 
 		 330 aa  279  6e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  47 
 
 		 330 aa  279  6e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  46.51 
 
 		 327 aa  278  8e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  46.58 
 
 		 330 aa  278  8e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  43.77 
 
 		 330 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  45.1 
 
 		 335 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  50.99 
 
 		 326 aa  276  3e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  45.87 
 
 		 325 aa  276  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  42.33 
 
 		 326 aa  276  5e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  44.95 
 
 		 321 aa  276  5e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  46.46 
 
 		 322 aa  275  6e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3875  hypothetical protein  49.68 
 
 		 325 aa  275  6e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.229403  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  45.68 
 
 		 330 aa  275  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0576  hypothetical protein  46.3 
 
 		 333 aa  275  7e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  47.52 
 
 		 335 aa  275  7e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  48.33 
 
 		 331 aa  275  8e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  45.51 
 
 		 337 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  44.41 
 
 		 322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  43.71 
 
 		 322 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  46.54 
 
 		 323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  45.81 
 
 		 320 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0840  hypothetical protein  43.79 
 
 		 324 aa  273  3e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  46.91 
 
 		 330 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  47.64 
 
 		 322 aa  273  3e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  47.73 
 
 		 331 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  45.15 
 
 		 324 aa  273  4.0000000000000004e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  42.59 
 
 		 331 aa  272  5.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2294  hypothetical protein  46.67 
 
 		 326 aa  272  5.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000131413  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>