More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5112 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  649    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  60.39 
 
 
324 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  52.04 
 
 
329 aa  335  5.999999999999999e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  50.99 
 
 
330 aa  335  7e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  51 
 
 
330 aa  334  1e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  52.68 
 
 
339 aa  332  6e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  52.68 
 
 
339 aa  331  1e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  51.5 
 
 
328 aa  329  4e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  50.17 
 
 
328 aa  328  9e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  52.67 
 
 
324 aa  326  3e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  49.83 
 
 
328 aa  326  4.0000000000000003e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  48.74 
 
 
346 aa  325  5e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  52.84 
 
 
323 aa  320  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  48.77 
 
 
327 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  51.74 
 
 
358 aa  318  6e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  51.34 
 
 
327 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  50.15 
 
 
326 aa  316  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  51 
 
 
324 aa  314  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  50.83 
 
 
328 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  50.46 
 
 
335 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  50.17 
 
 
328 aa  313  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  50.65 
 
 
320 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  50.67 
 
 
322 aa  313  3.9999999999999997e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  48.49 
 
 
336 aa  310  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  49.85 
 
 
344 aa  310  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  48.77 
 
 
336 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  49.37 
 
 
328 aa  309  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  51.5 
 
 
335 aa  309  4e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  47.83 
 
 
332 aa  308  5.9999999999999995e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  49.83 
 
 
327 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  48.67 
 
 
328 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  51.95 
 
 
345 aa  306  3e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  48.3 
 
 
331 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  51.95 
 
 
345 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  54.52 
 
 
330 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  48.53 
 
 
335 aa  305  5.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  46.32 
 
 
325 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  49.49 
 
 
330 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  49.49 
 
 
330 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  48.84 
 
 
330 aa  304  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  49.31 
 
 
349 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  43.87 
 
 
328 aa  302  4.0000000000000003e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  46.89 
 
 
322 aa  302  6.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  46 
 
 
327 aa  301  8.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  46 
 
 
325 aa  301  9e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  47.99 
 
 
325 aa  301  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  51.24 
 
 
334 aa  301  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  46.53 
 
 
330 aa  299  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  49.02 
 
 
331 aa  299  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  50.17 
 
 
328 aa  299  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  49.83 
 
 
314 aa  299  5e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  50 
 
 
326 aa  298  7e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  48.38 
 
 
360 aa  298  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  49.07 
 
 
337 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  49.21 
 
 
339 aa  296  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  46.35 
 
 
323 aa  297  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  47.65 
 
 
325 aa  296  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  47.28 
 
 
330 aa  296  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  50.49 
 
 
339 aa  296  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  50.33 
 
 
333 aa  296  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  50.5 
 
 
333 aa  296  5e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  49.02 
 
 
330 aa  295  7e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  47.87 
 
 
353 aa  295  8e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  45.7 
 
 
323 aa  293  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  49.01 
 
 
344 aa  294  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  46.67 
 
 
321 aa  293  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  44.75 
 
 
323 aa  293  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  44.85 
 
 
335 aa  293  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  46.44 
 
 
323 aa  291  9e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  46.39 
 
 
330 aa  291  1e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  47.49 
 
 
322 aa  291  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  46.84 
 
 
335 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  47.49 
 
 
355 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  49.67 
 
 
335 aa  291  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  45.43 
 
 
330 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  48.81 
 
 
331 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4433  extra-cytoplasmic solute receptor  45.15 
 
 
327 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  48.31 
 
 
334 aa  290  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  48.5 
 
 
339 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5058  extra-cytoplasmic solute receptor  48.64 
 
 
328 aa  290  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0827045  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  45.96 
 
 
331 aa  289  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2294  hypothetical protein  47.89 
 
 
326 aa  289  6e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000131413  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  42.24 
 
 
356 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  45.78 
 
 
332 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  45.6 
 
 
324 aa  287  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  44.82 
 
 
325 aa  285  7e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  42.86 
 
 
329 aa  285  8e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  47.32 
 
 
324 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  45.68 
 
 
326 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  45.82 
 
 
337 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  45.03 
 
 
325 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  45.51 
 
 
327 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5199  hypothetical protein  46.74 
 
 
342 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  46.11 
 
 
324 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  47.64 
 
 
310 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1400  hypothetical protein  45.81 
 
 
337 aa  282  4.0000000000000003e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  43.97 
 
 
326 aa  282  7.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  45.48 
 
 
330 aa  282  7.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  46.26 
 
 
304 aa  282  7.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  46.13 
 
 
326 aa  282  7.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>