More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4286 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  100 
 
 		 353 aa  714    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  87.17 
 
 		 355 aa  556  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  63.25 
 
 		 322 aa  393  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  59.93 
 
 		 330 aa  388  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  58.88 
 
 		 326 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  50.16 
 
 		 328 aa  316  4e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  50.16 
 
 		 328 aa  316  4e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  51.15 
 
 		 345 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  50.17 
 
 		 339 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  51.15 
 
 		 345 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  49.39 
 
 		 336 aa  302  5.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  46.85 
 
 		 332 aa  300  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  49.67 
 
 		 330 aa  298  8e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  50 
 
 		 330 aa  298  8e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  50.16 
 
 		 339 aa  298  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  49.66 
 
 		 327 aa  296  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  49.33 
 
 		 339 aa  295  7e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  48 
 
 		 328 aa  293  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  49.16 
 
 		 325 aa  293  4e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  50.82 
 
 		 333 aa  291  9e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  46.11 
 
 		 328 aa  290  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  47.53 
 
 		 328 aa  288  7e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  46.83 
 
 		 344 aa  288  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  49.5 
 
 		 324 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  47.99 
 
 		 339 aa  287  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  47.68 
 
 		 324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  48.2 
 
 		 360 aa  286  5e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  46.77 
 
 		 326 aa  285  5.999999999999999e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  48.51 
 
 		 328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  45.48 
 
 		 327 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  48 
 
 		 335 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  44.48 
 
 		 358 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  44.88 
 
 		 331 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  44.88 
 
 		 331 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  44.3 
 
 		 337 aa  282  6.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  43.96 
 
 		 324 aa  282  7.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  47.49 
 
 		 321 aa  282  7.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  46.91 
 
 		 328 aa  281  8.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  48.69 
 
 		 314 aa  281  8.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  46.28 
 
 		 324 aa  281  9e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  47.65 
 
 		 322 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  48.99 
 
 		 335 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  49.5 
 
 		 330 aa  281  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  49.5 
 
 		 330 aa  281  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  48.17 
 
 		 333 aa  279  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  45.75 
 
 		 337 aa  278  8e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  46.31 
 
 		 335 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  48.61 
 
 		 323 aa  278  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  45.06 
 
 		 331 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  44.31 
 
 		 323 aa  277  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  46.31 
 
 		 356 aa  276  3e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1295  hypothetical protein  47.49 
 
 		 324 aa  275  9e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.356601  normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  45.97 
 
 		 330 aa  275  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  46.75 
 
 		 336 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  48 
 
 		 323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  47.64 
 
 		 333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  46.91 
 
 		 326 aa  273  3e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  45.3 
 
 		 330 aa  273  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  43.49 
 
 		 332 aa  273  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  48.14 
 
 		 349 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  46.49 
 
 		 324 aa  272  5.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0594  hypothetical protein  55.36 
 
 		 233 aa  272  7e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  46.49 
 
 		 328 aa  272  8.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  47.95 
 
 		 334 aa  271  9e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  46.82 
 
 		 334 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  46.39 
 
 		 325 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  44.37 
 
 		 335 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  47.49 
 
 		 327 aa  270  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  44.69 
 
 		 325 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  42.81 
 
 		 327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  44.92 
 
 		 343 aa  270  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  44.58 
 
 		 331 aa  270  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  45.64 
 
 		 325 aa  270  4e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  44.7 
 
 		 344 aa  269  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  46.6 
 
 		 322 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1323  hypothetical protein  45.68 
 
 		 333 aa  269  5.9999999999999995e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  45.64 
 
 		 338 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  44.14 
 
 		 343 aa  268  8.999999999999999e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  44.31 
 
 		 331 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  45.68 
 
 		 324 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  46.5 
 
 		 327 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  43.91 
 
 		 325 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  44.77 
 
 		 335 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  45.64 
 
 		 325 aa  267  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  45.64 
 
 		 327 aa  267  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  46.67 
 
 		 334 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  43.33 
 
 		 332 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  47.95 
 
 		 338 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  47.32 
 
 		 322 aa  266  4e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  45.05 
 
 		 318 aa  266  4e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  44.95 
 
 		 334 aa  266  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  42.51 
 
 		 322 aa  266  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  45.42 
 
 		 335 aa  265  7e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  45.3 
 
 		 326 aa  265  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  43.89 
 
 		 318 aa  265  8.999999999999999e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6131  hypothetical protein  46.18 
 
 		 314 aa  264  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  44.37 
 
 		 325 aa  264  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  45.77 
 
 		 325 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  43.24 
 
 		 334 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  46 
 
 		 353 aa  263  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>