More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2997 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  691    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  80.13 
 
 		 322 aa  494  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  58.99 
 
 		 332 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  59.93 
 
 		 327 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  46.8 
 
 		 328 aa  296  5e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  46.46 
 
 		 328 aa  294  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  47.2 
 
 		 325 aa  286  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  46.46 
 
 		 339 aa  281  9e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  42.42 
 
 		 327 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  43.54 
 
 		 328 aa  279  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  43.2 
 
 		 334 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  45.63 
 
 		 314 aa  275  7e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  44.3 
 
 		 330 aa  275  8e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  44.3 
 
 		 330 aa  275  8e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  45.39 
 
 		 332 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  45.28 
 
 		 337 aa  274  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  45.97 
 
 		 327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  46.91 
 
 		 333 aa  273  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  44.88 
 
 		 349 aa  272  5.000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  44.48 
 
 		 331 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  43.07 
 
 		 336 aa  272  6e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  44.16 
 
 		 331 aa  271  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  44.33 
 
 		 331 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  42.99 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  45 
 
 		 325 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  44.63 
 
 		 338 aa  270  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  43.43 
 
 		 330 aa  269  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  42.01 
 
 		 339 aa  269  4e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  45.3 
 
 		 353 aa  269  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  45.03 
 
 		 330 aa  269  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  45.67 
 
 		 334 aa  268  1e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0599  hypothetical protein  46.31 
 
 		 325 aa  268  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127348  normal  0.507852 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  46.28 
 
 		 339 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  43.12 
 
 		 324 aa  267  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  44.44 
 
 		 304 aa  266  5e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  43.89 
 
 		 331 aa  266  5e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  42.27 
 
 		 324 aa  265  7e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1006  twin-arginine translocation pathway signal  43.87 
 
 		 333 aa  265  8e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  43.48 
 
 		 329 aa  265  8e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  45.3 
 
 		 330 aa  265  8e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  44.63 
 
 		 355 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  46.27 
 
 		 328 aa  264  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  43.2 
 
 		 349 aa  265  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  44.48 
 
 		 321 aa  264  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  42.17 
 
 		 358 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  45.75 
 
 		 345 aa  264  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  45.75 
 
 		 345 aa  264  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  43.96 
 
 		 324 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  43.75 
 
 		 339 aa  264  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  43.69 
 
 		 335 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  41.72 
 
 		 332 aa  263  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  43.62 
 
 		 328 aa  263  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0971  twin-arginine translocation pathway signal  43.97 
 
 		 333 aa  263  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.694014  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  46.33 
 
 		 327 aa  262  6e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  45.45 
 
 		 337 aa  261  8e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  42.54 
 
 		 335 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  46.98 
 
 		 322 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  43.48 
 
 		 326 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  42.81 
 
 		 325 aa  261  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  42.81 
 
 		 327 aa  261  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  44.41 
 
 		 333 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  41.69 
 
 		 343 aa  260  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  45.18 
 
 		 335 aa  260  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  45.24 
 
 		 335 aa  261  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1429  hypothetical protein  46.71 
 
 		 321 aa  260  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0252  hypothetical protein  42.14 
 
 		 325 aa  259  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  42.24 
 
 		 335 aa  259  7e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  44.81 
 
 		 333 aa  259  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  42.31 
 
 		 333 aa  258  9e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  40.13 
 
 		 330 aa  258  9e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  40.63 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  41.27 
 
 		 346 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  43.67 
 
 		 310 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  40.54 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1601  hypothetical protein  42.81 
 
 		 322 aa  257  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0236612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  43.26 
 
 		 326 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  40.65 
 
 		 331 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  41.69 
 
 		 330 aa  257  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  43.56 
 
 		 334 aa  256  3e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  42.24 
 
 		 327 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  42.53 
 
 		 320 aa  256  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  41.61 
 
 		 331 aa  255  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  42.72 
 
 		 328 aa  256  6e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  42.81 
 
 		 322 aa  255  8e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  41.08 
 
 		 356 aa  255  8e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  43.89 
 
 		 339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  42.19 
 
 		 331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  42.95 
 
 		 360 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3086  hypothetical protein  41.08 
 
 		 332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  43.24 
 
 		 335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  41.33 
 
 		 330 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2753  hypothetical protein  41.51 
 
 		 327 aa  254  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  40.4 
 
 		 323 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  43.94 
 
 		 328 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  42.14 
 
 		 326 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  43.99 
 
 		 335 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  45.15 
 
 		 330 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4803  hypothetical protein  45.45 
 
 		 474 aa  253  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2999  hypothetical protein  43.85 
 
 		 324 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.272534 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  43.96 
 
 		 323 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>