More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0855 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  100 
 
 
353 aa  707    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  99.39 
 
 
328 aa  651    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  83.33 
 
 
330 aa  517  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  66.15 
 
 
331 aa  430  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  67.54 
 
 
320 aa  427  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  54.52 
 
 
328 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  52.2 
 
 
325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  52.15 
 
 
322 aa  312  5.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  52.51 
 
 
326 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  50.83 
 
 
334 aa  306  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  53.37 
 
 
328 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  50.5 
 
 
330 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  50.5 
 
 
330 aa  302  5.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1145  hypothetical protein  49.54 
 
 
325 aa  300  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  51.66 
 
 
356 aa  298  8e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  47.35 
 
 
318 aa  297  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  47.37 
 
 
328 aa  296  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  53.14 
 
 
325 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  46.22 
 
 
328 aa  293  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  46.13 
 
 
327 aa  289  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  52.63 
 
 
322 aa  288  7e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  47.39 
 
 
332 aa  288  1e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  50.17 
 
 
326 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2023  hypothetical protein  47.48 
 
 
327 aa  286  4e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  47.02 
 
 
324 aa  286  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  49.33 
 
 
325 aa  286  4e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  49.33 
 
 
327 aa  286  4e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  46.32 
 
 
321 aa  283  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  47.39 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  48.04 
 
 
328 aa  282  7.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  44.92 
 
 
328 aa  281  9e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  44.97 
 
 
320 aa  280  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0902  hypothetical protein  46.64 
 
 
320 aa  279  5e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0987  hypothetical protein  46.64 
 
 
320 aa  279  5e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2205  hypothetical protein  44.97 
 
 
324 aa  279  7e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0725118 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  47.32 
 
 
339 aa  278  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  43.73 
 
 
331 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3459  hypothetical protein  47.51 
 
 
324 aa  276  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505499  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  44.18 
 
 
334 aa  276  5e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  46.69 
 
 
327 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  50.16 
 
 
330 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  44.38 
 
 
328 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  44.75 
 
 
339 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  44.03 
 
 
318 aa  273  4.0000000000000004e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1715  hypothetical protein  44.82 
 
 
320 aa  272  6e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.786272  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  45.96 
 
 
323 aa  271  9e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3994  hypothetical protein  44.82 
 
 
322 aa  271  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.189336 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  45.02 
 
 
345 aa  271  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  45.02 
 
 
345 aa  271  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  47.83 
 
 
330 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2416  hypothetical protein  48.19 
 
 
323 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  47.67 
 
 
330 aa  269  4e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  47.67 
 
 
330 aa  269  4e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  41.72 
 
 
322 aa  269  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  46.56 
 
 
312 aa  269  5.9999999999999995e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  47.06 
 
 
333 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4356  hypothetical protein  46.73 
 
 
323 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1141  hypothetical protein  42.77 
 
 
322 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  46.23 
 
 
326 aa  267  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  46.73 
 
 
330 aa  267  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  42.33 
 
 
329 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2833  hypothetical protein  46.27 
 
 
342 aa  266  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.226544  normal  0.225758 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  45.3 
 
 
322 aa  266  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  43.14 
 
 
356 aa  266  4e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  44.92 
 
 
325 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  43.47 
 
 
344 aa  266  5e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2912  hypothetical protein  47.32 
 
 
337 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  47.38 
 
 
330 aa  265  5.999999999999999e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  43.2 
 
 
333 aa  265  7e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  42.74 
 
 
353 aa  265  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  44.3 
 
 
304 aa  265  8.999999999999999e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2981  hypothetical protein  45.39 
 
 
322 aa  265  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2409  hypothetical protein  45.39 
 
 
322 aa  265  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.417331  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  44.3 
 
 
355 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  43.96 
 
 
330 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2989  hypothetical protein  48.22 
 
 
323 aa  264  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.593529  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  43.38 
 
 
322 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0879  hypothetical protein  44.82 
 
 
322 aa  264  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.381567 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4401  hypothetical protein  49.83 
 
 
321 aa  263  3e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0268815  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  44.63 
 
 
337 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  45.09 
 
 
332 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  43.56 
 
 
325 aa  263  4e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  46.05 
 
 
322 aa  263  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  43.61 
 
 
330 aa  263  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  44 
 
 
330 aa  263  4e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  44.17 
 
 
325 aa  263  4e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  44 
 
 
335 aa  262  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  45.97 
 
 
338 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  42.64 
 
 
321 aa  261  8.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  42.64 
 
 
321 aa  261  8.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0790  hypothetical protein  46.98 
 
 
328 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  47.83 
 
 
333 aa  261  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  43.81 
 
 
333 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  43.29 
 
 
331 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  43.07 
 
 
360 aa  261  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  43.49 
 
 
336 aa  260  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  46.44 
 
 
349 aa  260  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  43.64 
 
 
327 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  42.46 
 
 
332 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  42.28 
 
 
326 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>