More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0191 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  672    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  63.67 
 
 
314 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  50.33 
 
 
328 aa  323  3e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  50 
 
 
328 aa  322  8e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  51.5 
 
 
325 aa  321  9.000000000000001e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  51.68 
 
 
327 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  50.32 
 
 
360 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  50.61 
 
 
328 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  50.67 
 
 
339 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  50.83 
 
 
328 aa  312  4.999999999999999e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  48.83 
 
 
321 aa  311  6.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  45.97 
 
 
332 aa  311  9e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  50.65 
 
 
318 aa  310  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  49.69 
 
 
336 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  47.11 
 
 
331 aa  308  5.9999999999999995e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  49.67 
 
 
330 aa  307  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  48.85 
 
 
324 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  46.83 
 
 
336 aa  306  3e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  47.69 
 
 
331 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  47.84 
 
 
330 aa  305  6e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  46.04 
 
 
328 aa  305  7e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  47.45 
 
 
344 aa  305  7e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  46.18 
 
 
327 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  48.32 
 
 
335 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  47.67 
 
 
330 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  45.71 
 
 
327 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  48.71 
 
 
345 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  48.71 
 
 
345 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  45.99 
 
 
328 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  50.87 
 
 
322 aa  300  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  50.67 
 
 
323 aa  300  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  48.55 
 
 
333 aa  298  7e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  50.65 
 
 
330 aa  298  7e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  42.86 
 
 
325 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  45.9 
 
 
336 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  47.02 
 
 
328 aa  295  8e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  49.85 
 
 
334 aa  295  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  44.85 
 
 
322 aa  294  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  45.12 
 
 
330 aa  293  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  48.99 
 
 
353 aa  294  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  44.07 
 
 
334 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  47.14 
 
 
339 aa  293  4e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  43.87 
 
 
332 aa  292  6e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4433  extra-cytoplasmic solute receptor  46.46 
 
 
327 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  49.66 
 
 
335 aa  291  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  45.12 
 
 
356 aa  291  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  47.15 
 
 
326 aa  291  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  46.79 
 
 
339 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  46.31 
 
 
328 aa  289  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  44.48 
 
 
324 aa  289  4e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  47.78 
 
 
349 aa  288  7e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  46.49 
 
 
327 aa  288  8e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  46.49 
 
 
325 aa  288  9e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  46.33 
 
 
335 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  44.62 
 
 
329 aa  288  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  43.54 
 
 
325 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  44.97 
 
 
318 aa  287  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  46.69 
 
 
325 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  43.81 
 
 
337 aa  286  4e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  46.64 
 
 
327 aa  286  4e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  47.65 
 
 
326 aa  286  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  44.77 
 
 
335 aa  285  5.999999999999999e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  44.44 
 
 
323 aa  285  9e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  46.13 
 
 
332 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  46.6 
 
 
333 aa  284  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  46.31 
 
 
328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  45.33 
 
 
310 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  44.48 
 
 
323 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  44.92 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  49.83 
 
 
324 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  45.68 
 
 
339 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  43.89 
 
 
328 aa  281  8.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  43.9 
 
 
330 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  46 
 
 
334 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  43.9 
 
 
330 aa  281  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  47.22 
 
 
322 aa  281  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  43.87 
 
 
327 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  44.3 
 
 
330 aa  280  2e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  43.58 
 
 
358 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  45.63 
 
 
326 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  45.87 
 
 
333 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  43.38 
 
 
326 aa  279  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  46.31 
 
 
355 aa  279  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  45.12 
 
 
328 aa  280  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0125  hypothetical protein  46.76 
 
 
331 aa  279  5e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  44.62 
 
 
322 aa  278  8e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  43.47 
 
 
331 aa  278  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  46.08 
 
 
304 aa  277  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  45.05 
 
 
320 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  43.16 
 
 
331 aa  276  4e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  44.77 
 
 
331 aa  276  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  46.31 
 
 
322 aa  276  5e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  44.51 
 
 
343 aa  276  5e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  46.15 
 
 
337 aa  275  5e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  45.79 
 
 
322 aa  275  8e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  46.49 
 
 
326 aa  275  8e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  40.87 
 
 
330 aa  275  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  46.46 
 
 
330 aa  275  8e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  44.2 
 
 
326 aa  275  9e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  44.71 
 
 
330 aa  274  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>