More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0842 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  654    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  89.85 
 
 		 325 aa  600  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  64.82 
 
 		 324 aa  417  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  63.79 
 
 		 326 aa  388  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  59.43 
 
 		 328 aa  380  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  59.8 
 
 		 335 aa  371  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  48.92 
 
 		 356 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  53.77 
 
 		 337 aa  315  5e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  50.83 
 
 		 324 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  47.85 
 
 		 329 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  49.22 
 
 		 336 aa  311  7.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  48.72 
 
 		 328 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  48.1 
 
 		 328 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  50.17 
 
 		 333 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  46.2 
 
 		 330 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  47.44 
 
 		 327 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  45.67 
 
 		 330 aa  300  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  47.18 
 
 		 304 aa  300  3e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  44.69 
 
 		 328 aa  299  4e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  51.37 
 
 		 323 aa  299  4e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  46.84 
 
 		 331 aa  298  8e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  48.18 
 
 		 345 aa  298  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  48.18 
 
 		 345 aa  298  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  45.4 
 
 		 327 aa  297  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  48.33 
 
 		 326 aa  296  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  47.97 
 
 		 328 aa  296  4e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  47.97 
 
 		 328 aa  296  4e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  50.16 
 
 		 334 aa  294  1e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  47.16 
 
 		 337 aa  294  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  47.35 
 
 		 322 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  46.43 
 
 		 339 aa  292  5e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  46.8 
 
 		 328 aa  292  6e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  49.14 
 
 		 339 aa  291  9e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  47.47 
 
 		 333 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  45.95 
 
 		 334 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  46.23 
 
 		 325 aa  290  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  47.81 
 
 		 327 aa  288  8e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  45.48 
 
 		 325 aa  288  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  45.48 
 
 		 327 aa  288  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  46.18 
 
 		 360 aa  288  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  47.1 
 
 		 332 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  45.57 
 
 		 314 aa  286  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  46.13 
 
 		 335 aa  286  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  46.8 
 
 		 330 aa  285  5e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  46.8 
 
 		 330 aa  285  5e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  45.34 
 
 		 336 aa  285  5.999999999999999e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3530  hypothetical protein  47.32 
 
 		 321 aa  284  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  44.19 
 
 		 333 aa  284  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  45.91 
 
 		 324 aa  283  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  47.02 
 
 		 344 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  45.64 
 
 		 338 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  45.89 
 
 		 349 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  43.57 
 
 		 334 aa  282  6.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  46.44 
 
 		 325 aa  282  7.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  47.16 
 
 		 328 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  44.3 
 
 		 339 aa  280  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  44.48 
 
 		 331 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  44.34 
 
 		 333 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  43.54 
 
 		 335 aa  280  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  46.27 
 
 		 332 aa  280  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1931  hypothetical protein  44.59 
 
 		 329 aa  280  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  45 
 
 		 335 aa  279  5e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  46.64 
 
 		 322 aa  279  5e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  44.67 
 
 		 335 aa  279  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  44.33 
 
 		 312 aa  278  7e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  44.62 
 
 		 325 aa  278  8e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  44.19 
 
 		 336 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1270  hypothetical protein  44.75 
 
 		 323 aa  277  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  44.84 
 
 		 320 aa  277  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  43.75 
 
 		 321 aa  277  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  43.71 
 
 		 324 aa  276  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  44.67 
 
 		 334 aa  276  5e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  45.48 
 
 		 330 aa  275  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  43.09 
 
 		 334 aa  275  6e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  44.84 
 
 		 330 aa  275  7e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  47.3 
 
 		 330 aa  275  8e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  46.98 
 
 		 334 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  43.67 
 
 		 328 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  43.65 
 
 		 343 aa  274  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  45.02 
 
 		 330 aa  273  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  44.3 
 
 		 326 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  41.85 
 
 		 341 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2753  hypothetical protein  42.72 
 
 		 327 aa  271  9e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  45.15 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  45.89 
 
 		 331 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  45.62 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  42.15 
 
 		 323 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  41.93 
 
 		 327 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  46.39 
 
 		 353 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  45.3 
 
 		 321 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  43.4 
 
 		 326 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  42.81 
 
 		 318 aa  270  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  44.93 
 
 		 334 aa  269  4e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  44 
 
 		 335 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  43.37 
 
 		 322 aa  269  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5930  hypothetical protein  43.04 
 
 		 323 aa  269  5.9999999999999995e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  45.18 
 
 		 339 aa  269  5.9999999999999995e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  42.41 
 
 		 332 aa  268  7e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  43.64 
 
 		 326 aa  268  7e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  41.91 
 
 		 332 aa  268  8e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>