More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3145 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  672    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  87.95 
 
 		 333 aa  557  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  70.87 
 
 		 339 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  71.75 
 
 		 360 aa  442  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  70.78 
 
 		 345 aa  435  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  70.78 
 
 		 345 aa  435  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  65.77 
 
 		 344 aa  420  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  64.48 
 
 		 336 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  57.43 
 
 		 339 aa  356  3.9999999999999996e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  55.23 
 
 		 330 aa  351  1e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  55.45 
 
 		 330 aa  350  2e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  54.4 
 
 		 328 aa  340  2e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  52.57 
 
 		 328 aa  337  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  54.95 
 
 		 335 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  54.84 
 
 		 327 aa  333  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  54.52 
 
 		 334 aa  328  6e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  52.28 
 
 		 328 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  54.81 
 
 		 335 aa  326  3e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  52.61 
 
 		 335 aa  322  6e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  53.42 
 
 		 330 aa  321  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  48.93 
 
 		 334 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  53.44 
 
 		 323 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  50.91 
 
 		 336 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  51.31 
 
 		 324 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  50.76 
 
 		 325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  51.96 
 
 		 331 aa  305  6e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  50 
 
 		 331 aa  305  8.000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  47.4 
 
 		 318 aa  302  4.0000000000000003e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  50.49 
 
 		 321 aa  301  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  50.75 
 
 		 330 aa  300  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  52.15 
 
 		 339 aa  299  4e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  51.31 
 
 		 328 aa  297  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  50.33 
 
 		 325 aa  297  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  49.17 
 
 		 327 aa  297  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  46.75 
 
 		 331 aa  296  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  47.11 
 
 		 324 aa  296  5e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  50.16 
 
 		 304 aa  295  5e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  47.39 
 
 		 325 aa  295  6e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  50.98 
 
 		 328 aa  295  7e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  47.71 
 
 		 326 aa  295  8e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  48.84 
 
 		 324 aa  294  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  50 
 
 		 323 aa  293  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  45.87 
 
 		 325 aa  293  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  50.15 
 
 		 328 aa  292  7e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  48.63 
 
 		 328 aa  291  1e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  49.02 
 
 		 326 aa  291  1e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  48.86 
 
 		 314 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  48.17 
 
 		 353 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  49.85 
 
 		 333 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  47.71 
 
 		 324 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2416  hypothetical protein  49.51 
 
 		 323 aa  290  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  46.04 
 
 		 333 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  50.32 
 
 		 331 aa  290  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  47.42 
 
 		 322 aa  290  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  45.15 
 
 		 331 aa  289  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  50.5 
 
 		 327 aa  289  4e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2989  hypothetical protein  49.51 
 
 		 323 aa  289  4e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.593529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  50.5 
 
 		 325 aa  289  4e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  47.85 
 
 		 334 aa  289  4e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  48 
 
 		 349 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5388  hypothetical protein  47.24 
 
 		 337 aa  288  6e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  50 
 
 		 324 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  48.68 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  45.87 
 
 		 322 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  48.84 
 
 		 331 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  45.43 
 
 		 333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2872  hypothetical protein  49.03 
 
 		 334 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.446965 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  45.98 
 
 		 337 aa  286  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  48.51 
 
 		 328 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  49.5 
 
 		 328 aa  286  5e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  47.52 
 
 		 330 aa  285  5e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  47.52 
 
 		 330 aa  285  5e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  45.48 
 
 		 358 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  49.35 
 
 		 355 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  45.65 
 
 		 326 aa  282  5.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  46.06 
 
 		 325 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  48.04 
 
 		 334 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  44.88 
 
 		 330 aa  281  8.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  46.1 
 
 		 344 aa  281  8.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  46.42 
 
 		 324 aa  281  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  47.7 
 
 		 322 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  44.84 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  44.77 
 
 		 322 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  45.98 
 
 		 325 aa  280  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  44.98 
 
 		 335 aa  280  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3791  hypothetical protein  47.33 
 
 		 320 aa  279  4e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  47.27 
 
 		 336 aa  279  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  44.03 
 
 		 326 aa  279  6e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  47.09 
 
 		 326 aa  278  9e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  45.78 
 
 		 332 aa  277  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  44.16 
 
 		 332 aa  278  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1292  hypothetical protein  46.67 
 
 		 325 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  44.24 
 
 		 323 aa  277  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  46.03 
 
 		 326 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1975  hypothetical protein  45.72 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.222715  normal  0.0272576 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  42.99 
 
 		 343 aa  276  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  48.9 
 
 		 326 aa  275  7e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  43 
 
 		 349 aa  275  8e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  47.85 
 
 		 325 aa  275  9e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  48.52 
 
 		 322 aa  275  9e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>