More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0646 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  100 
 
 
334 aa  684    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  80.12 
 
 
336 aa  554  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  62.31 
 
 
331 aa  437  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  62.35 
 
 
343 aa  429  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2537  hypothetical protein  63.77 
 
 
329 aa  427  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  64.69 
 
 
334 aa  422  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0994  hypothetical protein  64.12 
 
 
341 aa  420  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1078  hypothetical protein  64.12 
 
 
344 aa  420  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.058258  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2872  hypothetical protein  65.44 
 
 
334 aa  415  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.446965 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1513  hypothetical protein  63.33 
 
 
337 aa  412  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.283946  normal  0.153712 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2765  hypothetical protein  62.75 
 
 
332 aa  407  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555979  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2753  hypothetical protein  57.37 
 
 
327 aa  399  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1349  hypothetical protein  54.37 
 
 
324 aa  346  4e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0601  hypothetical protein  54.81 
 
 
275 aa  319  3.9999999999999996e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  50 
 
 
345 aa  316  3e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  50 
 
 
345 aa  316  3e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  51.29 
 
 
333 aa  316  4e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  47.18 
 
 
336 aa  309  5e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  47.6 
 
 
339 aa  307  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  49.03 
 
 
360 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  48.93 
 
 
333 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  47.18 
 
 
331 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  45.17 
 
 
327 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  47.37 
 
 
330 aa  300  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  47.44 
 
 
339 aa  298  7e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  47.16 
 
 
330 aa  296  4e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  46.89 
 
 
328 aa  295  7e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  46.89 
 
 
328 aa  295  9e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  45.57 
 
 
330 aa  293  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  45.42 
 
 
335 aa  291  8e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  47.49 
 
 
325 aa  291  9e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  47.49 
 
 
327 aa  291  9e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  44.74 
 
 
314 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  49.55 
 
 
335 aa  289  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  47.65 
 
 
339 aa  289  5.0000000000000004e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0145  hypothetical protein  48.31 
 
 
325 aa  288  7e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0127  hypothetical protein  48.31 
 
 
325 aa  288  8e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  43.49 
 
 
344 aa  288  9e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  49.83 
 
 
338 aa  285  5e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  44.63 
 
 
330 aa  285  5.999999999999999e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  45.33 
 
 
321 aa  285  8e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  46.38 
 
 
328 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  46.13 
 
 
325 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  46.31 
 
 
327 aa  281  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  44.92 
 
 
335 aa  280  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  50.15 
 
 
334 aa  279  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  45.3 
 
 
339 aa  278  8e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  47.6 
 
 
334 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  44.41 
 
 
330 aa  278  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  41.82 
 
 
328 aa  277  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  46.03 
 
 
324 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  43.34 
 
 
333 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  45.54 
 
 
304 aa  276  4e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  43.52 
 
 
335 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  44.33 
 
 
356 aa  273  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  43.43 
 
 
322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  46.08 
 
 
351 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  43.96 
 
 
330 aa  273  3e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  43.96 
 
 
330 aa  273  3e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  42.09 
 
 
325 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  45.66 
 
 
324 aa  272  6e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  44.04 
 
 
335 aa  272  6e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  42.99 
 
 
331 aa  272  6e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  44.97 
 
 
321 aa  272  6e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  42.99 
 
 
331 aa  271  9e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  45.34 
 
 
320 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  44.51 
 
 
323 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  45.3 
 
 
343 aa  270  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  42.09 
 
 
328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  46.46 
 
 
326 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  44.19 
 
 
322 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  42.94 
 
 
331 aa  269  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  42.77 
 
 
325 aa  268  7e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  44.25 
 
 
331 aa  268  8e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4002  hypothetical protein  46.98 
 
 
335 aa  268  8e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0348816 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  41.32 
 
 
331 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  42.95 
 
 
325 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  42.69 
 
 
358 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  40.66 
 
 
325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5302  hypothetical protein  43.96 
 
 
326 aa  266  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  43.62 
 
 
330 aa  266  5e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  43.96 
 
 
328 aa  265  5.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  45.97 
 
 
322 aa  265  7e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1863  hypothetical protein  42.41 
 
 
327 aa  265  8e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  45.3 
 
 
349 aa  265  8e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  43 
 
 
337 aa  265  8.999999999999999e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  44.67 
 
 
326 aa  264  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  43.05 
 
 
330 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  44.3 
 
 
336 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  41.78 
 
 
327 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  41.42 
 
 
328 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  44.7 
 
 
322 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  43.24 
 
 
353 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  42.9 
 
 
318 aa  263  4e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  43.67 
 
 
323 aa  263  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  44.3 
 
 
335 aa  263  4.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  45.15 
 
 
355 aa  262  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2834  hypothetical protein  45.28 
 
 
327 aa  262  6e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.421115  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  44.3 
 
 
324 aa  261  8.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  44.2 
 
 
321 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>