More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0594 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0594  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  475  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  66.09 
 
 		 330 aa  339  2.9999999999999998e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  66.09 
 
 		 322 aa  336  1.9999999999999998e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  63.95 
 
 		 326 aa  323  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  55.36 
 
 		 353 aa  272  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  52.79 
 
 		 355 aa  261  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  42.92 
 
 		 339 aa  207  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  44.69 
 
 		 334 aa  205  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  41.63 
 
 		 314 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  43.7 
 
 		 336 aa  202  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  43.28 
 
 		 333 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  43.5 
 
 		 331 aa  201  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  41.2 
 
 		 330 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  41.2 
 
 		 330 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  43.59 
 
 		 331 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  43.59 
 
 		 324 aa  199  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  42.92 
 
 		 336 aa  198  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  40.89 
 
 		 327 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  39.91 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  41.67 
 
 		 333 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  42.86 
 
 		 339 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  42.92 
 
 		 339 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  40.26 
 
 		 332 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  41.99 
 
 		 327 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  41.13 
 
 		 327 aa  195  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  40.42 
 
 		 345 aa  195  6e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  40.42 
 
 		 345 aa  194  7e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  41.63 
 
 		 328 aa  194  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  40.34 
 
 		 326 aa  193  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  39.91 
 
 		 325 aa  193  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  42.86 
 
 		 328 aa  192  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  40.68 
 
 		 344 aa  192  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  40.34 
 
 		 324 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  37.77 
 
 		 322 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  41.33 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  41.2 
 
 		 332 aa  189  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  43.28 
 
 		 323 aa  189  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0909  hypothetical protein  41.59 
 
 		 329 aa  189  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  38.63 
 
 		 335 aa  188  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6352  hypothetical protein  41.33 
 
 		 321 aa  188  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.997284  normal  0.0840681 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  39.38 
 
 		 324 aa  188  5.999999999999999e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  38.7 
 
 		 328 aa  188  7e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  39.82 
 
 		 327 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  42.92 
 
 		 335 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  38.7 
 
 		 328 aa  187  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  42.6 
 
 		 330 aa  186  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  40.71 
 
 		 331 aa  186  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  41.48 
 
 		 358 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  39.91 
 
 		 325 aa  186  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  39.22 
 
 		 323 aa  185  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  38.33 
 
 		 360 aa  185  6e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  37.77 
 
 		 337 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  41.38 
 
 		 335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  39.15 
 
 		 335 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  38.63 
 
 		 324 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  39.04 
 
 		 356 aa  183  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  40.35 
 
 		 326 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  39.74 
 
 		 343 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  39.06 
 
 		 331 aa  182  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0994  hypothetical protein  39.21 
 
 		 341 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1078  hypothetical protein  39.21 
 
 		 344 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.058258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3791  hypothetical protein  39.24 
 
 		 320 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2537  hypothetical protein  42.04 
 
 		 329 aa  182  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  39.19 
 
 		 326 aa  182  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2416  hypothetical protein  39.66 
 
 		 323 aa  181  8.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  39.66 
 
 		 338 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  39.66 
 
 		 336 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3927  extra-cytoplasmic solute receptor  39.91 
 
 		 329 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000102175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  39.74 
 
 		 326 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  38.66 
 
 		 326 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1270  hypothetical protein  37.61 
 
 		 323 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2294  hypothetical protein  36.48 
 
 		 326 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000131413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2989  hypothetical protein  39.24 
 
 		 323 aa  180  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.593529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  40 
 
 		 339 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  38.14 
 
 		 339 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  39.13 
 
 		 339 aa  179  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  39.06 
 
 		 330 aa  179  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  36.48 
 
 		 343 aa  179  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  37.34 
 
 		 333 aa  179  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  37.39 
 
 		 326 aa  178  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  37.34 
 
 		 349 aa  179  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  37.92 
 
 		 344 aa  178  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  37.77 
 
 		 322 aa  178  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  37.76 
 
 		 335 aa  178  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  37.89 
 
 		 325 aa  178  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  37.34 
 
 		 330 aa  178  7e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  37.33 
 
 		 318 aa  178  8e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  36.48 
 
 		 325 aa  177  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0599  hypothetical protein  38.53 
 
 		 325 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127348  normal  0.507852 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  39.06 
 
 		 312 aa  177  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  40.27 
 
 		 343 aa  177  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  40 
 
 		 327 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  41.99 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  38.86 
 
 		 324 aa  176  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3300  hypothetical protein  38.4 
 
 		 323 aa  176  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205377  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  39.47 
 
 		 322 aa  176  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1323  hypothetical protein  41.55 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  38.46 
 
 		 346 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  39.22 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  40.36 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>